101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3300 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3300  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
327 aa  682    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.821044  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0290  polysaccharide deacetylase  35.6 
 
 
322 aa  191  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  26.77 
 
 
285 aa  92.4  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  23.9 
 
 
276 aa  90.9  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  25.86 
 
 
284 aa  88.6  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  25.86 
 
 
284 aa  87.8  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  22.88 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  22.88 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  22.88 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  22.88 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  24.92 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0570  polysaccharide deacetylase  34.3 
 
 
383 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0342536 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  24.84 
 
 
276 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  23.7 
 
 
273 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  23.86 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1226  polysaccharide deacetylase  23.95 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  23.7 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  23.7 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  22.93 
 
 
273 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1287  polysaccharide deacetylase  24.18 
 
 
366 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.374689  normal  0.442268 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  36.08 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1658  polysaccharide deacetylase family protein  25.27 
 
 
366 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0732576  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0603  polysaccharide deacetylase  27.22 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1756  polysaccharide deacetylase  23.24 
 
 
351 aa  65.5  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  38.3 
 
 
347 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  27.65 
 
 
256 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  30.61 
 
 
319 aa  63.2  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2204  polysaccharide deacetylase  29.01 
 
 
402 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  31.03 
 
 
256 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  34.02 
 
 
322 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  23.1 
 
 
249 aa  60.1  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0475  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (glutamineamidotransferase; GMP synthetase)  27.89 
 
 
265 aa  59.7  0.00000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  32.99 
 
 
306 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  32.99 
 
 
306 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1233  yggt family protein  26.52 
 
 
266 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0196  polysaccharide deacetylase domain protein  22 
 
 
409 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0195  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  21.85 
 
 
407 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0204  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  22 
 
 
409 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  30.16 
 
 
401 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  29.91 
 
 
254 aa  56.6  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0199  polysaccharide deacetylase domain protein  21.52 
 
 
409 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.37766  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0213  polysaccharide deacetylase  21.67 
 
 
407 aa  56.6  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268611  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  25.69 
 
 
298 aa  56.6  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  28.24 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  34.04 
 
 
279 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3402  hypothetical protein  23.42 
 
 
393 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.377712  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  23.05 
 
 
344 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  32.61 
 
 
278 aa  55.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1265  polysaccharide deacetylase  28.87 
 
 
324 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0132  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.13 
 
 
409 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  22.85 
 
 
316 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.13 
 
 
409 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.13 
 
 
409 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  25.75 
 
 
257 aa  53.1  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
266 aa  53.1  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
291 aa  53.1  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0148  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 
342 aa  52.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4730  polysaccharide deacetylase  31.53 
 
 
548 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0138  polysaccharide deacetylase domain protein  28.35 
 
 
409 aa  52  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  31.3 
 
 
336 aa  52.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5025  polysaccharide deacetylase  31.53 
 
 
548 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.794076  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  29.91 
 
 
354 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  19.87 
 
 
426 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  30.21 
 
 
645 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
1015 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
321 aa  50.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1105  polysaccharide deacetylase  27.18 
 
 
270 aa  50.1  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  30.19 
 
 
251 aa  50.1  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  23.31 
 
 
239 aa  49.7  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  23.31 
 
 
239 aa  49.7  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0846  polysaccharide deacetylase  26.36 
 
 
280 aa  49.3  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00129  predicted polysaccharide deacetylase lipoprotein  27.56 
 
 
409 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.530219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3472  polysaccharide deacetylase  27.56 
 
 
409 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3529  polysaccharide deacetylase  27.56 
 
 
409 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00128  hypothetical protein  27.56 
 
 
409 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411127  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
373 aa  48.5  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4642  polysaccharide deacetylase  34.94 
 
 
457 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.921462  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 
318 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  27.81 
 
 
275 aa  47  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0678  polysaccharide deacetylase  26.36 
 
 
415 aa  47.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.945313  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  25.81 
 
 
283 aa  47  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  25.24 
 
 
318 aa  45.8  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  22.39 
 
 
339 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  28.37 
 
 
590 aa  45.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3475  polysaccharide deacetylase  25.4 
 
 
437 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  36.9 
 
 
349 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3346  polysaccharide deacetylase family protein  25.2 
 
 
417 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000257148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1014  polysaccharide deacetylase family protein  25.2 
 
 
417 aa  45.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  26.36 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5866  polysaccharide deacetylase  30.3 
 
 
350 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  29.89 
 
 
272 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2791  hypothetical protein  30.38 
 
 
640 aa  43.5  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.291104  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  28.09 
 
 
615 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  28.09 
 
 
615 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  27.37 
 
 
357 aa  42.7  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  32.69 
 
 
353 aa  42.7  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04327  biofilm PGA synthesis lipoprotein PgaB  24.39 
 
 
624 aa  42.7  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.215859  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
316 aa  42.7  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  30.34 
 
 
627 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>