203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1265 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1265  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 324 aa  662    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3984  polysaccharide deacetylase  39.25 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0148  polysaccharide deacetylase  39.24 
 
 		 342 aa  262  4.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1500  polysaccharide deacetylase family protein  31.9 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.89834  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3250  polysaccharide deacetylase family protein  28.71 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1847  polysaccharide deacetylase  28.34 
 
 		 313 aa  109  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  27.76 
 
 		 318 aa  93.6  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  25.32 
 
 		 348 aa  92  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  24.66 
 
 		 337 aa  92  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14351  hypothetical protein  26.6 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.188906  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  23.78 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  24.12 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  24.59 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  22.18 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  33.96 
 
 		 659 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  23.1 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  20.85 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  21.43 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  33.96 
 
 		 660 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  21.66 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  21.32 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  33.02 
 
 		 659 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  35.19 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  24.92 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  22.41 
 
 		 353 aa  66.2  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  22.26 
 
 		 327 aa  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  22.65 
 
 		 672 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  34.04 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  32.35 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  32.73 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  22.26 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  33.93 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  21.24 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  22.78 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  29.39 
 
 		 673 aa  62  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  19.03 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0475  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (glutamineamidotransferase; GMP synthetase)  23.64 
 
 		 265 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  21.66 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04002  Polysaccharide deacetylase family protein  32.53 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  24.52 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  29.82 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  32.71 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  37.76 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 		 510 aa  60.1  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  32.43 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0603  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 		 371 aa  59.3  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  21.47 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  21.47 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  21.09 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2791  hypothetical protein  41.67 
 
 		 640 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.291104  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0570  polysaccharide deacetylase  31.18 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0342536 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  32.56 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1287  polysaccharide deacetylase  20.24 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.374689  normal  0.442268 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  32.06 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  26.34 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  37.76 
 
 		 261 aa  57  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  23.36 
 
 		 256 aa  57  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  34.52 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  34.62 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  18.71 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1658  polysaccharide deacetylase family protein  31.96 
 
 		 366 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0732576  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  26.09 
 
 		 349 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3093  polysaccharide deacetylase  20.51 
 
 		 350 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  24.58 
 
 		 273 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  31.31 
 
 		 426 aa  55.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  38.04 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3300  polysaccharide deacetylase  28.87 
 
 		 327 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.821044  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2105  polysaccharide deacetylase  37.31 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0828766  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0178  outer membrane N-deacetylase  32.56 
 
 		 665 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4842  polysaccharide deacetylase  33.7 
 
 		 712 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3765  polysaccharide deacetylase  33.7 
 
 		 712 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04327  biofilm PGA synthesis lipoprotein PgaB  34.09 
 
 		 624 aa  54.3  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.215859  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  19.11 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1138  outer membrane N-deacetylase  40.62 
 
 		 672 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115575  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 348 aa  54.3  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  25.13 
 
 		 336 aa  53.9  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4286  outer membrane N-deacetylase  35 
 
 		 671 aa  53.9  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  27.13 
 
 		 285 aa  53.9  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  34.48 
 
 		 297 aa  53.9  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 271 aa  53.9  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  34.41 
 
 		 273 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  34.41 
 
 		 273 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  34.41 
 
 		 273 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01025  predicted enzyme associated with biofilm formation  40.62 
 
 		 672 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2620  polysaccharide deacetylase  40.62 
 
 		 672 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0287  putative hemin storage signal peptide protein  32.61 
 
 		 724 aa  53.5  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111967  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1265  outer membrane N-deacetylase  40.62 
 
 		 672 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.798831 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2573  outer membrane N-deacetylase  40.62 
 
 		 672 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0269291 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01032  hypothetical protein  40.62 
 
 		 672 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0136  hemin storage protein  35.63 
 
 		 684 aa  53.5  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.84788  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1143  outer membrane N-deacetylase  40.62 
 
 		 672 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2240  outer membrane N-deacetylase  38.27 
 
 		 673 aa  53.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  35.35 
 
 		 319 aa  53.1  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2142  outer membrane N-deacetylase  38.27 
 
 		 673 aa  53.1  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0474034 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2130  outer membrane N-deacetylase  38.27 
 
 		 673 aa  53.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0132  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.97 
 
 		 409 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  32.29 
 
 		 401 aa  53.1  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4607  outer membrane N-deacetylase  33.75 
 
 		 671 aa  52.4  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  34.41 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  28.57 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>