252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0603 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0603  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 371 aa  772    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  33.06 
 
 		 336 aa  145  9e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1658  polysaccharide deacetylase family protein  25.54 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0732576  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0570  polysaccharide deacetylase  23.39 
 
 		 383 aa  100  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0342536 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  34.18 
 
 		 273 aa  96.7  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  33.54 
 
 		 273 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  33.54 
 
 		 273 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  33.54 
 
 		 273 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  34.42 
 
 		 273 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1287  polysaccharide deacetylase  22.85 
 
 		 366 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.374689  normal  0.442268 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  30 
 
 		 284 aa  89  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  30.72 
 
 		 273 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  30.72 
 
 		 273 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  29.41 
 
 		 273 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  29.38 
 
 		 284 aa  86.3  8e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  29.14 
 
 		 273 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3997  polysaccharide deacetylase  32.35 
 
 		 697 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695216  normal  0.336374 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 285 aa  83.2  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0287  putative hemin storage signal peptide protein  30.67 
 
 		 724 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111967  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4263  polysaccharide deacetylase  31.62 
 
 		 697 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4103  polysaccharide deacetylase  31.62 
 
 		 697 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.871871  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4842  polysaccharide deacetylase  31.33 
 
 		 712 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3765  polysaccharide deacetylase  31.33 
 
 		 712 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  31.48 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3420  polysaccharide deacetylase  31.62 
 
 		 698 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0136  hemin storage protein  30.32 
 
 		 684 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.84788  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  26.28 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  35.34 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4483  polysaccharide deacetylase  30.15 
 
 		 695 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.367373  normal  0.863016 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  28.93 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  29.19 
 
 		 373 aa  79.3  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01025  predicted enzyme associated with biofilm formation  24.84 
 
 		 672 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2620  polysaccharide deacetylase  24.84 
 
 		 672 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2573  outer membrane N-deacetylase  24.84 
 
 		 672 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0269291 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2791  hypothetical protein  38.3 
 
 		 640 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.291104  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1941  polysaccharide deacetylase  30.15 
 
 		 697 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01032  hypothetical protein  24.84 
 
 		 672 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  26.88 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2240  outer membrane N-deacetylase  28.83 
 
 		 673 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1143  outer membrane N-deacetylase  24.84 
 
 		 672 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  40 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2130  outer membrane N-deacetylase  28.83 
 
 		 673 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  27.17 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2204  polysaccharide deacetylase  25.09 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2142  outer membrane N-deacetylase  28.83 
 
 		 673 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0474034 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3514  polysaccharide deacetylase  30.15 
 
 		 697 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000898006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1265  outer membrane N-deacetylase  24.84 
 
 		 672 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.798831 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1138  outer membrane N-deacetylase  24.84 
 
 		 672 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115575  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  30.41 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0178  outer membrane N-deacetylase  28.28 
 
 		 665 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  27.78 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  27.78 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  30.13 
 
 		 256 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  31.87 
 
 		 276 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  34.95 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1756  polysaccharide deacetylase  22.36 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  29.81 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  30.52 
 
 		 627 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4607  outer membrane N-deacetylase  26.97 
 
 		 671 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  27.16 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4286  outer membrane N-deacetylase  26.97 
 
 		 671 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0475  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (glutamineamidotransferase; GMP synthetase)  29.38 
 
 		 265 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  27.81 
 
 		 645 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  28.48 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  31.91 
 
 		 271 aa  72  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04327  biofilm PGA synthesis lipoprotein PgaB  25.7 
 
 		 624 aa  72  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.215859  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0290  polysaccharide deacetylase  21.78 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3100  polysaccharide deacetylase  26.28 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  38 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  30 
 
 		 590 aa  70.1  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  25.81 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  26.45 
 
 		 274 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  24.05 
 
 		 510 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3300  polysaccharide deacetylase  27.22 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.821044  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  28.95 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  29.94 
 
 		 615 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  29.94 
 
 		 615 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  25.67 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  33.61 
 
 		 261 aa  67  0.0000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  29.5 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1542  polysaccharide deacetylase  28.39 
 
 		 273 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.04781e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2698  polysaccharide deacetylase  27.74 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000289703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  23.86 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  24.84 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  23.87 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  23.87 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  25.91 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  31.5 
 
 		 1015 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  26.75 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2717  polysaccharide deacetylase  24.82 
 
 		 628 aa  63.9  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  31.5 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  24.7 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  32.74 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  26.42 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5605  polysaccharide deacetylase  21.26 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  30.6 
 
 		 673 aa  61.6  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  23.57 
 
 		 274 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0678  polysaccharide deacetylase  22.98 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.945313  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  23.03 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>