237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0187 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  634    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  34.45 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  32.59 
 
 		 351 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  31.69 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  27.59 
 
 		 386 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  32.1 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  26.56 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  29.56 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  31.95 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  30.41 
 
 		 318 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  28.18 
 
 		 353 aa  93.2  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  26.38 
 
 		 318 aa  93.2  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  30.35 
 
 		 321 aa  93.2  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  27.41 
 
 		 282 aa  92.4  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  32.06 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  29.97 
 
 		 672 aa  91.3  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  28.21 
 
 		 271 aa  90.9  3e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  30.09 
 
 		 344 aa  89.4  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  30.24 
 
 		 322 aa  88.2  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1635  polysaccharide deacetylase  25.84 
 
 		 328 aa  87  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280055  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  33.79 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  26.81 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  31.21 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  29.28 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  31.86 
 
 		 398 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  31.86 
 
 		 398 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  31.16 
 
 		 398 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  27.65 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  24.91 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  33.21 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  27.36 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  33.21 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  29.32 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  25.56 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3984  polysaccharide deacetylase  27.1 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  26 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  27.14 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  23.84 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  31.33 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  26.55 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  29.72 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  24.83 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  28.25 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  26.24 
 
 		 352 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0854  polysaccharide deacetylase  25.63 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  28.11 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  24.72 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  27.45 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  23.05 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0883  polysaccharide deacetylase  28.52 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  25.08 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6486  polysaccharide deacetylase  26.54 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  27.45 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  30.08 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  27.45 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0595  polysaccharide deacetylase  26.65 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  23.99 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0240  polysaccharide deacetylase  28.4 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  27.99 
 
 		 233 aa  68.9  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1121  polysaccharide deacetylase  25.89 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  27.6 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  35.65 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  32.27 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  26.61 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  28 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  28 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  30.36 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1233  yggt family protein  27.44 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0771  polysaccharide deacetylase  29.25 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  30.36 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0635  polysaccharide deacetylase  28.11 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  29.25 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  33.1 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  27.56 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0603  polysaccharide deacetylase  25.91 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  23.57 
 
 		 590 aa  63.9  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  33.1 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  27.56 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  23.03 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0475  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (glutamineamidotransferase; GMP synthetase)  26.61 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  32.41 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  32.41 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  32.41 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  32.41 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  27.31 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  26.94 
 
 		 350 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  28 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  32.41 
 
 		 348 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  28 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  34.4 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  26.5 
 
 		 368 aa  62  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2142  outer membrane N-deacetylase  23.9 
 
 		 673 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0474034 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2240  outer membrane N-deacetylase  23.9 
 
 		 673 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  28.1 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  31.03 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2130  outer membrane N-deacetylase  23.9 
 
 		 673 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>