237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3306 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 333 aa  660    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  36.1 
 
 		 316 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  33.44 
 
 		 318 aa  179  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  31.33 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  32.09 
 
 		 324 aa  116  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  31.17 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  28.85 
 
 		 337 aa  103  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  34.78 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  27.83 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  28.43 
 
 		 348 aa  99.8  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  31.31 
 
 		 322 aa  94.7  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  32 
 
 		 322 aa  93.2  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  29.27 
 
 		 339 aa  93.6  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  25.87 
 
 		 327 aa  89  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  27.99 
 
 		 354 aa  88.2  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  30.7 
 
 		 352 aa  86.3  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  27.13 
 
 		 348 aa  85.9  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  28.38 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  32.61 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  27.9 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  31.37 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  30.45 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  35.37 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  29.41 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  33.11 
 
 		 398 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  31.89 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0635  polysaccharide deacetylase  29.97 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  33.11 
 
 		 398 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  27.73 
 
 		 672 aa  79.7  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  31.15 
 
 		 350 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04002  Polysaccharide deacetylase family protein  37.5 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  32.59 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  29.58 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  29.74 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0595  polysaccharide deacetylase  30.97 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  31.72 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  31.85 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1265  polysaccharide deacetylase  20.82 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  31.4 
 
 		 400 aa  75.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  28.47 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  26.2 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5866  polysaccharide deacetylase  30.83 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  25.32 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2994  polysaccharide deacetylase  28.39 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649589 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  38.55 
 
 		 590 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  30.23 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  32.66 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  33.59 
 
 		 357 aa  72.4  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  32.66 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  25.6 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  31.06 
 
 		 400 aa  72.8  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2932  polysaccharide deacetylase  32.28 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3093  polysaccharide deacetylase  27.3 
 
 		 350 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  44.71 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3984  polysaccharide deacetylase  26.18 
 
 		 322 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0148  polysaccharide deacetylase  25.41 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  46.24 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  36.78 
 
 		 278 aa  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1500  polysaccharide deacetylase family protein  19.03 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.89834  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  27.87 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  27.69 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  28.85 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  39.05 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  34.38 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  30.25 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4603  putative polysaccharide deacetylase  27.98 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  41.05 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  42.55 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  22.75 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  35.16 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0240  polysaccharide deacetylase  25.68 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  41.49 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  35.24 
 
 		 282 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  41.49 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  27.51 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  38.78 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  32.04 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  40.21 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  24.91 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4928  polysaccharide deacetylase  27.99 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  27.24 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  29.63 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  29.63 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  38.3 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0771  polysaccharide deacetylase  26.04 
 
 		 352 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  30.67 
 
 		 363 aa  59.3  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  40.43 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0883  polysaccharide deacetylase  26.79 
 
 		 352 aa  59.3  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  41.24 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  35.71 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  39.56 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1027  hypothetical protein  25.16 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504748  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5079  polysaccharide deacetylase  37.23 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5781  polysaccharide deacetylase  37.23 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  29.57 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1847  polysaccharide deacetylase  26.82 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  35.71 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  35.71 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  35.71 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>