197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3984 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3984  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 322 aa  650    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0148  polysaccharide deacetylase  43.27 
 
 		 342 aa  272  5.000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1265  polysaccharide deacetylase  39.25 
 
 		 324 aa  270  2e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3250  polysaccharide deacetylase family protein  28.8 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1500  polysaccharide deacetylase family protein  26.27 
 
 		 304 aa  107  4e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.89834  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1847  polysaccharide deacetylase  31.41 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  29.19 
 
 		 348 aa  102  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  28.25 
 
 		 353 aa  100  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  22.85 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  23.89 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  27.39 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  27.1 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.47 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  25.44 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  26.02 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  25.52 
 
 		 386 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  38.24 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  38.24 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  22.54 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  22.54 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  26.2 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  38.46 
 
 		 627 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  23.1 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  35.11 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  25.95 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  22.78 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0287  putative hemin storage signal peptide protein  38.82 
 
 		 724 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111967  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 645 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  31.13 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  25.87 
 
 		 672 aa  63.2  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  24.44 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  27.3 
 
 		 352 aa  62  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  37.11 
 
 		 278 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  22.19 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  34.38 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  22 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  27.21 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1138  outer membrane N-deacetylase  44.29 
 
 		 672 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115575  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01025  predicted enzyme associated with biofilm formation  44.29 
 
 		 672 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2620  polysaccharide deacetylase  44.29 
 
 		 672 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2573  outer membrane N-deacetylase  44.29 
 
 		 672 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0269291 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01032  hypothetical protein  44.29 
 
 		 672 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1265  outer membrane N-deacetylase  44.29 
 
 		 672 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.798831 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1143  outer membrane N-deacetylase  44.29 
 
 		 672 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  36.67 
 
 		 615 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  36.67 
 
 		 615 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  35.16 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  35.16 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  35.16 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04002  Polysaccharide deacetylase family protein  34.57 
 
 		 391 aa  59.3  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  34.65 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0603  polysaccharide deacetylase  26.06 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3093  polysaccharide deacetylase  24.85 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  21.54 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3765  polysaccharide deacetylase  36.47 
 
 		 712 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  31.91 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  23.96 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4842  polysaccharide deacetylase  36.47 
 
 		 712 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4607  outer membrane N-deacetylase  49.02 
 
 		 671 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  36.75 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  35.16 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  36.75 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 		 510 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4286  outer membrane N-deacetylase  52.17 
 
 		 671 aa  56.6  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  29.9 
 
 		 256 aa  57  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  36.56 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  34.07 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  40.24 
 
 		 659 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  40.24 
 
 		 659 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  25.41 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  40.24 
 
 		 660 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  36 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1658  polysaccharide deacetylase family protein  33.33 
 
 		 366 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0732576  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  28.08 
 
 		 352 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  35.63 
 
 		 354 aa  55.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  35.56 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2791  hypothetical protein  45 
 
 		 640 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.291104  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  34.41 
 
 		 322 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  25.61 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1178  polysaccharide deacetylase  36.26 
 
 		 370 aa  53.9  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  25.85 
 
 		 398 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2240  outer membrane N-deacetylase  31.85 
 
 		 673 aa  53.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  26.19 
 
 		 398 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2130  outer membrane N-deacetylase  31.85 
 
 		 673 aa  53.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2142  outer membrane N-deacetylase  31.85 
 
 		 673 aa  53.1  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0474034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2699  polysaccharide deacetylase  25.17 
 
 		 348 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  34.88 
 
 		 673 aa  52.8  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2932  polysaccharide deacetylase  26.92 
 
 		 309 aa  52.8  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0136  hemin storage protein  32.03 
 
 		 684 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.84788  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  26.19 
 
 		 398 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  21.07 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 		 342 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0570  polysaccharide deacetylase  33.7 
 
 		 383 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0342536 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  35.48 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  35.48 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>