183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5370 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 351 aa  685    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5866  polysaccharide deacetylase  82.34 
 
 		 350 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  69.32 
 
 		 350 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  69.6 
 
 		 350 aa  457  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  69.32 
 
 		 350 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  64.89 
 
 		 353 aa  431  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  45.85 
 
 		 352 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  42.45 
 
 		 352 aa  260  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  43.14 
 
 		 352 aa  260  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  45.56 
 
 		 352 aa  255  6e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0771  polysaccharide deacetylase  43.3 
 
 		 352 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0883  polysaccharide deacetylase  43.59 
 
 		 352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4928  polysaccharide deacetylase  41.81 
 
 		 368 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2994  polysaccharide deacetylase  41.77 
 
 		 362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649589 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  43.21 
 
 		 352 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  39.64 
 
 		 347 aa  205  9e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0595  polysaccharide deacetylase  40.54 
 
 		 345 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0635  polysaccharide deacetylase  40.06 
 
 		 345 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  41.03 
 
 		 349 aa  189  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  36.23 
 
 		 348 aa  189  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1027  hypothetical protein  36.84 
 
 		 349 aa  186  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504748  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4603  putative polysaccharide deacetylase  37.03 
 
 		 353 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3093  polysaccharide deacetylase  36.5 
 
 		 350 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6088  polysaccharide deacetylase  41.42 
 
 		 349 aa  165  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  hitchhiker  0.00305245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2663  polysaccharide deacetylase  37.73 
 
 		 348 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2699  polysaccharide deacetylase  37.15 
 
 		 348 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  35.6 
 
 		 368 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  34.32 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  32.85 
 
 		 305 aa  104  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  32.85 
 
 		 672 aa  99  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  35 
 
 		 322 aa  97.1  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  31.29 
 
 		 322 aa  96.7  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  26.62 
 
 		 318 aa  95.9  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  25.33 
 
 		 282 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  31.88 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  27.6 
 
 		 337 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 339 aa  89.4  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  32.97 
 
 		 318 aa  89.4  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 339 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  34.42 
 
 		 398 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  25.71 
 
 		 337 aa  87.4  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.32 
 
 		 294 aa  86.7  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  34.06 
 
 		 398 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  32.61 
 
 		 316 aa  86.3  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  33.7 
 
 		 398 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  25.12 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  23.51 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  35.69 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  34.39 
 
 		 400 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  31.44 
 
 		 353 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  33.99 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  31.92 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  30.3 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  22.37 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0156  hypothetical protein  23.97 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  22.88 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0854  polysaccharide deacetylase  28.17 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1121  polysaccharide deacetylase  28.92 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  34.58 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  25.45 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6486  polysaccharide deacetylase  28.22 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  23.08 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  28.92 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  28.35 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  25.99 
 
 		 344 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  27 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  28.4 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  32.27 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  26.06 
 
 		 257 aa  67  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  31.62 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  26.62 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  36.42 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  35.59 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  24.44 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1635  polysaccharide deacetylase  22.53 
 
 		 328 aa  62.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280055  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5046  polysaccharide deacetylase  30.34 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  27.9 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  25.72 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4585  polysaccharide deacetylase  29.96 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.701791 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  31.78 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  28.46 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  26.37 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  39.81 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0148  polysaccharide deacetylase  24.91 
 
 		 342 aa  57  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  32.29 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  44.44 
 
 		 626 aa  56.2  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  35.58 
 
 		 251 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  39.36 
 
 		 239 aa  55.5  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4730  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 548 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  39.36 
 
 		 239 aa  55.5  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5025  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 548 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.794076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  21.96 
 
 		 256 aa  54.3  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  25.19 
 
 		 339 aa  53.9  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  25.23 
 
 		 254 aa  53.9  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0475  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (glutamineamidotransferase; GMP synthetase)  25 
 
 		 265 aa  53.9  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>