120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6088 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6088  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 349 aa  679    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  hitchhiker  0.00305245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  41.43 
 
 		 351 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2994  polysaccharide deacetylase  36.34 
 
 		 362 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  38.41 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  33.55 
 
 		 352 aa  161  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  37.95 
 
 		 350 aa  159  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  33.87 
 
 		 352 aa  159  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  37.83 
 
 		 353 aa  159  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  37.95 
 
 		 350 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4928  polysaccharide deacetylase  34.59 
 
 		 368 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0883  polysaccharide deacetylase  34.35 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  34.93 
 
 		 352 aa  153  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0771  polysaccharide deacetylase  34.01 
 
 		 352 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  34.44 
 
 		 349 aa  150  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5866  polysaccharide deacetylase  39.6 
 
 		 350 aa  150  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  34.71 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2699  polysaccharide deacetylase  38.41 
 
 		 348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2663  polysaccharide deacetylase  35.6 
 
 		 348 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3093  polysaccharide deacetylase  33.02 
 
 		 350 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4603  putative polysaccharide deacetylase  31.7 
 
 		 353 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  30.32 
 
 		 347 aa  123  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  29.49 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0595  polysaccharide deacetylase  31.72 
 
 		 345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0635  polysaccharide deacetylase  31.38 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 672 aa  106  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1027  hypothetical protein  27.61 
 
 		 349 aa  102  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504748  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  29.26 
 
 		 368 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  28.88 
 
 		 339 aa  95.1  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  32.94 
 
 		 318 aa  92.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  26.14 
 
 		 339 aa  90.5  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  26.39 
 
 		 353 aa  89.7  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  31.31 
 
 		 398 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  27.3 
 
 		 322 aa  86.7  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  28.35 
 
 		 278 aa  86.3  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  30.3 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  29.97 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  24.83 
 
 		 386 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  32.31 
 
 		 322 aa  82.4  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  32.81 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  26.23 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  32.12 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  26.39 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  25.94 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  30.54 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  28.76 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  25.58 
 
 		 318 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  22.3 
 
 		 590 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  34.29 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  21.2 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  25 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  37.38 
 
 		 510 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  34.45 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  35.63 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5046  polysaccharide deacetylase  29.8 
 
 		 276 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  27.36 
 
 		 351 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4585  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.701791 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1635  polysaccharide deacetylase  24.62 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280055  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  38.04 
 
 		 598 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  22.94 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  22.94 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  36.19 
 
 		 1015 aa  60.1  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  26.89 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  38.81 
 
 		 615 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1121  polysaccharide deacetylase  28.52 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  27.87 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  38.81 
 
 		 615 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  25.76 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0156  hypothetical protein  23.08 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0240  polysaccharide deacetylase  27.15 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  31.87 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 		 251 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  34.09 
 
 		 645 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  23.99 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  18.81 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  27.66 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  35.16 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  27.04 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0854  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 257 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6486  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 288 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  35.56 
 
 		 274 aa  54.7  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  27.56 
 
 		 272 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  31.11 
 
 		 233 aa  53.9  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4358  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 		 265 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  28.74 
 
 		 234 aa  53.5  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  31.03 
 
 		 233 aa  53.1  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0340  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.61 
 
 		 319 aa  53.1  0.000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0441347  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  25.54 
 
 		 344 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  29.89 
 
 		 233 aa  51.2  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  35.06 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  20.75 
 
 		 318 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2112  glycosy hydrolase family protein  27.1 
 
 		 320 aa  50.4  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  32.61 
 
 		 239 aa  50.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>