40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_14351 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_14351  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  630  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.188906  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1265  polysaccharide deacetylase  26.6 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  21.79 
 
 
672 aa  68.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0148  polysaccharide deacetylase  22.86 
 
 
342 aa  68.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  23.88 
 
 
353 aa  65.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  23.14 
 
 
339 aa  62.4  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3250  polysaccharide deacetylase family protein  25.08 
 
 
317 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  22.44 
 
 
339 aa  55.8  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  18.8 
 
 
354 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  17.45 
 
 
316 aa  53.5  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1500  polysaccharide deacetylase family protein  24.32 
 
 
304 aa  52.8  0.000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.89834  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  18.35 
 
 
322 aa  53.1  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  20.89 
 
 
337 aa  50.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  18.05 
 
 
318 aa  50.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  22.62 
 
 
337 aa  49.7  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  27.94 
 
 
224 aa  49.7  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  20.2 
 
 
318 aa  49.3  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  30.68 
 
 
354 aa  49.3  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  17.08 
 
 
305 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  28.32 
 
 
373 aa  48.5  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  20.82 
 
 
386 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  18.94 
 
 
339 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3984  polysaccharide deacetylase  20.61 
 
 
322 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  25.9 
 
 
279 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  15.88 
 
 
322 aa  43.5  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  34.12 
 
 
318 aa  43.9  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0404  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  35.8 
 
 
260 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0540  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  34.57 
 
 
260 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0217877  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0398  polysaccharide deacetylase  34.57 
 
 
260 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4834  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  34.57 
 
 
260 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0489  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  34.57 
 
 
260 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0470  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  34.57 
 
 
260 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0402  polysaccharide deacetylase  34.57 
 
 
260 aa  42.7  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0424  polysaccharide deacetylase  34.57 
 
 
260 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0411  polysaccharide deacetylase  34.57 
 
 
260 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2723  polysaccharide deacetylase  25.69 
 
 
265 aa  42.7  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3817  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  33.33 
 
 
344 aa  42.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0327337  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0540  polysaccharide deacetylase, putative  34.57 
 
 
260 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  34.72 
 
 
260 aa  42.4  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  30.1 
 
 
318 aa  42.4  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>