More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4617 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4617  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 266 aa  528  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  34.02 
 
 		 275 aa  102  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  34.8 
 
 		 244 aa  98.6  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  27.69 
 
 		 234 aa  89  8e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4585  polysaccharide deacetylase  34.31 
 
 		 276 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.701791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5046  polysaccharide deacetylase  34.31 
 
 		 276 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  28.11 
 
 		 306 aa  86.3  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  28.11 
 
 		 306 aa  85.5  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  23.67 
 
 		 224 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  27.51 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  26.26 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  27.51 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  30.22 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  28.04 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  28.04 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  36.16 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  29.07 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  31.91 
 
 		 348 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  30.38 
 
 		 348 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  32.31 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  33.52 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  24.47 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  29.5 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  27.66 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  30.94 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  28.8 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  28.04 
 
 		 510 aa  77.4  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0792  polysaccharide deacetylase  32.12 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.623292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5797  polysaccharide deacetylase  32.12 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  32.56 
 
 		 626 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0248  polysaccharide deacetylase  25.89 
 
 		 352 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  32.84 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  32.49 
 
 		 321 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04002  Polysaccharide deacetylase family protein  25.51 
 
 		 391 aa  75.5  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  28.42 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  30.08 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  29.39 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  30.09 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  30.97 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  32.8 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0340  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.88 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0441347  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1796  polysaccharide deacetylase  31.98 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  24.72 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1457  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  31.89 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  28.06 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6214  polysaccharide deacetylase  28.82 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3076  polysaccharide deacetylase  30.94 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4358  polysaccharide deacetylase  33.73 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  34.55 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  30.35 
 
 		 673 aa  69.3  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  27.33 
 
 		 363 aa  68.9  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  27.69 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  26.32 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5874  polysaccharide deacetylase  27.8 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199758  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  28.82 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  24.46 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  37.31 
 
 		 659 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  28.82 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  36.57 
 
 		 659 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2698  polysaccharide deacetylase  24.23 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000289703  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  26.42 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  37.31 
 
 		 660 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 		 1001 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1542  polysaccharide deacetylase  24.23 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.04781e-18 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  28.98 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  28.09 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  27.91 
 
 		 590 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1454  polysaccharide deacetylase  39.39 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0891104  hitchhiker  0.0000678514 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  31.01 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  30.72 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4541  polysaccharide deacetylase  30.18 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00515582 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4408  polysaccharide deacetylase  30.18 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  22.91 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  31.4 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  30.29 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  34.1 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5079  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  30.29 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5781  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0658  xylanase/chitin deacetylase-like protein  36.75 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 		 1015 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3200  polysaccharide deacetylase  33.03 
 
 		 594 aa  62.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000473135  hitchhiker  0.00151321 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  24.02 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4674  polysaccharide deacetylase  30.87 
 
 		 234 aa  62  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  26.15 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 		 598 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  32.03 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1616  polysaccharide deacetylase  29.68 
 
 		 488 aa  62  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  24.53 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  25.49 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8504  polysaccharide deacetylase  31.65 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  0.0143221 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3100  polysaccharide deacetylase  23.61 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1476  polysaccharide deacetylase  27.93 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.412903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2167  polysaccharide deacetylase family protein  24.8 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000111858  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6390  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0864277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>