214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8504 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8504  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 223 aa  456  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  0.0143221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0658  xylanase/chitin deacetylase-like protein  47.83 
 
 		 221 aa  171  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  34.78 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3076  polysaccharide deacetylase  32.6 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  27.74 
 
 		 306 aa  75.5  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  27.74 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  28.81 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3874  polysaccharide deacetylase  36 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  29.71 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  27.01 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  28.31 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  29.37 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  24.61 
 
 		 271 aa  65.1  0.0000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 336 aa  65.1  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  27.64 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  29 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  27.2 
 
 		 322 aa  62.4  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  27.89 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4674  polysaccharide deacetylase  31.71 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  28.28 
 
 		 278 aa  62  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4358  polysaccharide deacetylase  32.28 
 
 		 265 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  29.68 
 
 		 256 aa  61.6  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  30.71 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0171  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0521886  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  32.58 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  27.21 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  32.88 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  33.8 
 
 		 1001 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1639  polysaccharide deacetylase domain protein  30.99 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0853  polysaccharide deacetylase  32.43 
 
 		 318 aa  58.5  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000296204  normal  0.358313 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  28.38 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  28.91 
 
 		 645 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  26.29 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0146  polysaccharide deacetylase  27.54 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  26.29 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0678  polysaccharide deacetylase  30.23 
 
 		 415 aa  56.2  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.945313  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  30.08 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3200  polysaccharide deacetylase  34.58 
 
 		 594 aa  55.1  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000473135  hitchhiker  0.00151321 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 598 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  28.24 
 
 		 626 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  24.36 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  24.05 
 
 		 251 aa  53.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4585  polysaccharide deacetylase  30.18 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.701791 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  25.69 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  31.78 
 
 		 348 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  30.23 
 
 		 348 aa  52.8  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  31.78 
 
 		 348 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2622  polysaccharide deacetylase family protein  31.84 
 
 		 279 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.424992  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  28.23 
 
 		 510 aa  52.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 271 aa  52.4  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0448  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  32.78 
 
 		 456 aa  52.8  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 		 253 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  30.23 
 
 		 348 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1076  polysaccharide deacetylase family protein  31.36 
 
 		 274 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2342  polysaccharide deacetylase family protein  31.36 
 
 		 274 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.769381  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2052  polysaccharide deacetylase family protein  31.36 
 
 		 395 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  30.87 
 
 		 372 aa  52  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 348 aa  52  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5046  polysaccharide deacetylase  29.59 
 
 		 276 aa  52  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1359  polysaccharide deacetylase family protein  31.36 
 
 		 437 aa  52  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  29.23 
 
 		 348 aa  51.6  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  29.23 
 
 		 348 aa  51.6  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2765  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  32.78 
 
 		 554 aa  51.6  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0887626  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  28.35 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0150  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  31.28 
 
 		 279 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1030  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  31.84 
 
 		 617 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3475  polysaccharide deacetylase  28.05 
 
 		 437 aa  50.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3111  polysaccharide deacetylase family protein  31.36 
 
 		 296 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2063  polysaccharide deacetylase  30.86 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0736381 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  23.33 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1448  polysaccharide deacetylase family protein  31.36 
 
 		 378 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  29.93 
 
 		 347 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.86 
 
 		 409 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  29.46 
 
 		 258 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  22.7 
 
 		 249 aa  50.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3226  polysaccharide deacetylase family protein  31.36 
 
 		 437 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.107526  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1014  polysaccharide deacetylase family protein  28.05 
 
 		 417 aa  50.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3346  polysaccharide deacetylase family protein  28.05 
 
 		 417 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000257148  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  24.41 
 
 		 279 aa  50.1  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0360  polysaccharide deacetylase-like protein  29.69 
 
 		 360 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1659  polysaccharide deacetylase  31.86 
 
 		 429 aa  50.1  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243324  normal  0.117174 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  31.01 
 
 		 286 aa  49.7  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 353 aa  50.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6390  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 238 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0864277 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1224  polysaccharide deacetylase  38.24 
 
 		 392 aa  49.7  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.533397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  28.04 
 
 		 266 aa  49.3  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 244 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  33.06 
 
 		 283 aa  49.3  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  28.46 
 
 		 348 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  29.69 
 
 		 267 aa  49.3  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2322  polysaccharide deacetylase family protein  31.95 
 
 		 310 aa  49.3  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5079  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 		 244 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5781  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 		 244 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5874  polysaccharide deacetylase  29.71 
 
 		 296 aa  48.9  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4541  polysaccharide deacetylase  30.57 
 
 		 263 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00515582 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4408  polysaccharide deacetylase  30.57 
 
 		 263 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  26.12 
 
 		 258 aa  48.9  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.86 
 
 		 409 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0132  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.86 
 
 		 409 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>