289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3200 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3200  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 594 aa  1157    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000473135  hitchhiker  0.00151321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3593  hypothetical protein  34.55 
 
 		 723 aa  132  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.27604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3458  hypothetical protein  31.25 
 
 		 649 aa  127  8.000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2795  polysaccharide deacetylase  31.54 
 
 		 600 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0146758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2607  hypothetical protein  29.78 
 
 		 755 aa  89.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.459804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  34.72 
 
 		 496 aa  80.1  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  38.68 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3339  polysaccharide deacetylase  31.74 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  37.74 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2794  polysaccharide deacetylase  32.67 
 
 		 597 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0412434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0658  xylanase/chitin deacetylase-like protein  33.33 
 
 		 221 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 271 aa  69.3  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2522  polysaccharide deacetylase  31.13 
 
 		 237 aa  69.3  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.250856  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  26.38 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  34.87 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  30.4 
 
 		 270 aa  67  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1907  polysaccharide deacetylase  26.28 
 
 		 282 aa  66.6  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  27.21 
 
 		 249 aa  66.6  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  32.71 
 
 		 322 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  32.71 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  36.21 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 542 aa  64.7  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1454  polysaccharide deacetylase  29.13 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0891104  hitchhiker  0.0000678514 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  26.57 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  30.07 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1231  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 		 630 aa  64.7  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.534738  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  28.47 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 645 aa  63.9  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  30.37 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  28.21 
 
 		 352 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  35.34 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  27.94 
 
 		 233 aa  62.4  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  27.94 
 
 		 233 aa  62.4  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 		 626 aa  62  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  37.04 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1639  polysaccharide deacetylase domain protein  28.14 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0924  polysaccharide deacetylase  30.61 
 
 		 173 aa  61.2  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1796  polysaccharide deacetylase  31.71 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  29.51 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  34.23 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  29.61 
 
 		 1748 aa  60.8  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  30.56 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  28.15 
 
 		 502 aa  60.8  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  31.65 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3510  polysaccharide deacetylase  36 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  29.7 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3505  polysaccharide deacetylase  34.4 
 
 		 275 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3076  polysaccharide deacetylase  28.67 
 
 		 258 aa  60.1  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2051  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.82 
 
 		 491 aa  60.1  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  30.65 
 
 		 283 aa  60.1  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09380  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AQQ0]  30.87 
 
 		 237 aa  59.7  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.124183 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  31.01 
 
 		 271 aa  59.7  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  24.42 
 
 		 349 aa  59.3  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0127  PKD domain containing protein  30 
 
 		 931 aa  59.3  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00188311 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3411  polysaccharide deacetylase  29.71 
 
 		 242 aa  58.9  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  26.95 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  30.4 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  29.6 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1476  polysaccharide deacetylase  27.61 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.412903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  26.09 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  26.06 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3226  polysaccharide deacetylase family protein  30.08 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.107526  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  34.78 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  29.82 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2337  polysaccharide deacetylase  31.84 
 
 		 500 aa  57  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00797389  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  25.28 
 
 		 278 aa  57  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01852  Chitin deacetylasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.41); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BC78]  30.89 
 
 		 249 aa  56.6  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2052  polysaccharide deacetylase family protein  30.08 
 
 		 395 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3765  polysaccharide deacetylase  27.67 
 
 		 712 aa  56.6  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4842  polysaccharide deacetylase  27.67 
 
 		 712 aa  56.6  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  34.62 
 
 		 1101 aa  56.6  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  30.43 
 
 		 239 aa  57  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  30.89 
 
 		 273 aa  56.6  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 		 239 aa  56.6  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5797  polysaccharide deacetylase  28.05 
 
 		 289 aa  56.6  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  29.01 
 
 		 295 aa  55.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 		 627 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  30.99 
 
 		 590 aa  55.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  31.03 
 
 		 238 aa  56.2  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  42.47 
 
 		 669 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0063  hypothetical protein  36.71 
 
 		 363 aa  56.2  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1448  polysaccharide deacetylase family protein  30.08 
 
 		 378 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  30.58 
 
 		 320 aa  55.8  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  31.03 
 
 		 238 aa  56.2  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1659  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 		 429 aa  55.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243324  normal  0.117174 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  27.73 
 
 		 253 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0615  polysaccharide deacetylase  25.35 
 
 		 843 aa  56.2  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00286732 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1076  polysaccharide deacetylase family protein  30.08 
 
 		 274 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1359  polysaccharide deacetylase family protein  30.08 
 
 		 437 aa  56.2  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2342  polysaccharide deacetylase family protein  30.08 
 
 		 274 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.769381  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0846  polysaccharide deacetylase  29.92 
 
 		 280 aa  55.5  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  30.6 
 
 		 272 aa  55.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  33.06 
 
 		 261 aa  55.5  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  25.69 
 
 		 252 aa  55.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3111  polysaccharide deacetylase family protein  30.08 
 
 		 296 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  32.04 
 
 		 287 aa  55.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>