53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3505 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3505  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 275 aa  570  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3917  polysaccharide deacetylase  29.71 
 
 		 259 aa  112  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3200  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 594 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000473135  hitchhiker  0.00151321 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  26.99 
 
 		 280 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1446  polysaccharide deacetylase  26.56 
 
 		 280 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.781341  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  23.32 
 
 		 255 aa  49.3  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  25.62 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  25.1 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  33.91 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  28.91 
 
 		 251 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2795  polysaccharide deacetylase  27.59 
 
 		 600 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0146758 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  24.69 
 
 		 213 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  33.06 
 
 		 417 aa  46.6  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  24.69 
 
 		 220 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  24.69 
 
 		 213 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  24.69 
 
 		 213 aa  46.6  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1842  putative polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 234 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 261 aa  46.6  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  25.17 
 
 		 256 aa  46.2  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1658  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 234 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 241 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  29.52 
 
 		 234 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3501  putative polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 234 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1683  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 234 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.381461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  29.52 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0538  polysaccharide deacetylase  26.71 
 
 		 323 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0863369  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2674  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  29 
 
 		 250 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0198792  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  25.78 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  24.17 
 
 		 241 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.69 
 
 		 307 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09380  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AQQ0]  28.92 
 
 		 237 aa  43.5  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.124183 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  27.69 
 
 		 307 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  31.3 
 
 		 300 aa  43.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1639  polysaccharide deacetylase domain protein  25 
 
 		 269 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  28 
 
 		 258 aa  43.5  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  28.28 
 
 		 298 aa  43.1  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  23.85 
 
 		 217 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2571  polysaccharide deacetylase  30.85 
 
 		 235 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  31.86 
 
 		 244 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1696  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 		 234 aa  42.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.847499  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5797  polysaccharide deacetylase  24.07 
 
 		 289 aa  42.7  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3076  polysaccharide deacetylase  32.89 
 
 		 258 aa  42.4  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  25.5 
 
 		 241 aa  42.7  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  23.75 
 
 		 244 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  27.69 
 
 		 307 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  27.69 
 
 		 307 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  27.69 
 
 		 307 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  25.36 
 
 		 251 aa  42.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1062  hypothetical protein  22.5 
 
 		 268 aa  42.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.530433 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  23.21 
 
 		 413 aa  42.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0928  polysaccharide deacetylase  32.63 
 
 		 296 aa  42.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1347  polysaccharide deacetylase  25.71 
 
 		 196 aa  42  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0921833  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 		 1002 aa  42  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>