275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1639 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1639  polysaccharide deacetylase domain protein  100 
 
 		 269 aa  548  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  46.61 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3554  polysaccharide deacetylase  37.93 
 
 		 630 aa  171  9e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1231  polysaccharide deacetylase  38.53 
 
 		 630 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.534738  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1230  polysaccharide deacetylase  38.5 
 
 		 482 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2337  polysaccharide deacetylase  35.14 
 
 		 500 aa  161  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00797389  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3555  polysaccharide deacetylase  36.52 
 
 		 487 aa  156  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1227  polysaccharide deacetylase  31.87 
 
 		 657 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0615  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 		 843 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00286732 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0146  polysaccharide deacetylase  32.82 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1536  polysaccharide deacetylase  39.47 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  33.55 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1454  polysaccharide deacetylase  34.19 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0891104  hitchhiker  0.0000678514 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  37.8 
 
 		 598 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2795  polysaccharide deacetylase  26.24 
 
 		 600 aa  69.3  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0146758 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2723  polysaccharide deacetylase  26.47 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3874  polysaccharide deacetylase  36.97 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 		 542 aa  65.9  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  27.66 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5876  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0232  polysaccharide deacetylase  26.72 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.621532  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2730  polysaccharide deacetylase  26.42 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  27.21 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  35.77 
 
 		 503 aa  63.5  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  31.69 
 
 		 1015 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1551  polysaccharide deacetylase  30.67 
 
 		 243 aa  62  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  32.61 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3200  polysaccharide deacetylase  29 
 
 		 594 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000473135  hitchhiker  0.00151321 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2794  polysaccharide deacetylase  28.37 
 
 		 597 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0412434 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  32.39 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  26.57 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3339  polysaccharide deacetylase  29.38 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  34.23 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  30.53 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  34.09 
 
 		 465 aa  59.7  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  29.32 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  25 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  29.58 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3411  polysaccharide deacetylase  26.92 
 
 		 242 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2967  polysaccharide deacetylase  31.41 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000931063  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8504  polysaccharide deacetylase  30.99 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  0.0143221 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  23.57 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  23.57 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  30.36 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  22.16 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4674  polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  37.23 
 
 		 590 aa  57  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  28.87 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  33.87 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  33.09 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  22.93 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  22.93 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  22.93 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  27.85 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  22.93 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1659  polysaccharide deacetylase  31.47 
 
 		 429 aa  55.8  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243324  normal  0.117174 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  27.71 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  33.77 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  22.93 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  31.36 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  29.75 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0175  polysaccharide deacetylase  30.5 
 
 		 378 aa  55.5  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.122625  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  28 
 
 		 306 aa  55.5  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  29.89 
 
 		 199 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  24.26 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07960  polysaccharide deacetylase  28.68 
 
 		 228 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  30.46 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0628  polysaccharide deacetylase  28.51 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  29.32 
 
 		 233 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  28.14 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2063  polysaccharide deacetylase  32.3 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0736381 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  29.73 
 
 		 417 aa  53.5  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0390  polysaccharide deacetylase  25.46 
 
 		 294 aa  53.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  33.61 
 
 		 307 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  23.56 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  27.2 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  23.53 
 
 		 241 aa  53.9  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  26.92 
 
 		 263 aa  53.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2571  polysaccharide deacetylase  31.78 
 
 		 235 aa  53.1  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  26.81 
 
 		 233 aa  53.1  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  32.48 
 
 		 275 aa  53.1  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  26.81 
 
 		 233 aa  52.8  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2851  polysaccharide deacetylase  27.96 
 
 		 371 aa  52.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000258612  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24520  predicted xylanase/chitin deacetylase  36.69 
 
 		 292 aa  52.8  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.417407 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 282 aa  52.4  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0924  polysaccharide deacetylase  25.81 
 
 		 173 aa  52.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18670  predicted xylanase/chitin deacetylase  32.2 
 
 		 289 aa  52.4  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  36.44 
 
 		 267 aa  52.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  30.58 
 
 		 256 aa  52  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  28.24 
 
 		 275 aa  52  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  28.24 
 
 		 275 aa  52  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  26.72 
 
 		 238 aa  52  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  27.66 
 
 		 387 aa  51.6  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  28.24 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  26.86 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>