More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3335 on replicon NC_013201
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
298 aa  613  9.999999999999999e-175  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  41.04 
 
 
289 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  41.04 
 
 
289 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  41.04 
 
 
289 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  38.01 
 
 
321 aa  163  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  34.5 
 
 
273 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  36.23 
 
 
295 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  36.23 
 
 
295 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 
315 aa  154  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  37.31 
 
 
299 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  35.85 
 
 
295 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  38.6 
 
 
288 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  34.28 
 
 
290 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  33.45 
 
 
307 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  35.79 
 
 
302 aa  151  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  33.45 
 
 
307 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  33.45 
 
 
307 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  33.45 
 
 
307 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  33.45 
 
 
307 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  33.57 
 
 
290 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  38.78 
 
 
264 aa  149  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  34.88 
 
 
287 aa  145  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  31.79 
 
 
281 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  33.46 
 
 
294 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  36.18 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  32.39 
 
 
282 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  33.21 
 
 
299 aa  139  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  32.71 
 
 
277 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  34.81 
 
 
296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3513  polysaccharide deacetylase  30.94 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.206647  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  30.11 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  31.14 
 
 
293 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  30.77 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  30.53 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  29.37 
 
 
296 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  29 
 
 
306 aa  115  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0928  polysaccharide deacetylase  32.01 
 
 
296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.686986  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2100  hypothetical protein  31.52 
 
 
297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  31.11 
 
 
293 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  27.88 
 
 
336 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  31.11 
 
 
293 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 
291 aa  112  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2033  polysaccharide deacetylase  30.8 
 
 
300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  27.05 
 
 
279 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.932988 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4391  polysaccharide deacetylase  29.68 
 
 
296 aa  109  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.424954 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  31.3 
 
 
293 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0672  polysaccharide deacetylase family protein  28.46 
 
 
293 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.193798  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2229  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 
296 aa  104  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1919  polysaccharide deacetylase  26.55 
 
 
326 aa  104  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6462  polysaccharide deacetylase  30.29 
 
 
302 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  30.57 
 
 
294 aa  102  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6169  polysaccharide deacetylase  30.07 
 
 
302 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 
294 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  27.14 
 
 
319 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39050  predicted xylanase/chitin deacetylase  29.58 
 
 
295 aa  99.4  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6198  urate catabolism protein  31.28 
 
 
318 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  30.47 
 
 
309 aa  99  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1607  hypothetical protein  25.34 
 
 
296 aa  97.8  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1389  hypothetical protein  25 
 
 
296 aa  97.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  30.21 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  28.76 
 
 
309 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0934  polysaccharide deacetylase  30.57 
 
 
308 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22830  predicted xylanase/chitin deacetylase  28.16 
 
 
295 aa  95.5  9e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3485  polysaccharide deacetylase  28.29 
 
 
300 aa  95.5  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1415  putative polysaccharide deacetylase  28.29 
 
 
300 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0030  polysaccharide deacetylase  26.07 
 
 
299 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  27.59 
 
 
378 aa  93.6  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3707  urate catabolism protein  28.09 
 
 
305 aa  93.6  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482899  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  28.88 
 
 
308 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  28.94 
 
 
308 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  28.88 
 
 
308 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  28.09 
 
 
308 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  28.51 
 
 
308 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1100  urate catabolism protein  29.37 
 
 
336 aa  92  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3152  urate catabolism protein  27.45 
 
 
307 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  28.51 
 
 
308 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4321  polysaccharide deacetylase  25 
 
 
313 aa  92  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285208  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2116  urate catabolism protein  27.39 
 
 
322 aa  91.3  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  28.09 
 
 
308 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0078  polysaccharide deacetylase  25.73 
 
 
313 aa  90.1  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2022  polysaccharide deacetylase  31.17 
 
 
304 aa  89  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.664089  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2085  polysaccharide deacetylase  31.17 
 
 
304 aa  89  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793939  normal  0.404703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2039  polysaccharide deacetylase  31.17 
 
 
304 aa  89  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0469  chitin deacetylase  24.32 
 
 
308 aa  89  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2063  urate catabolism protein  30.13 
 
 
470 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890496 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2067  polysaccharide deacetylase family protein  29.49 
 
 
317 aa  87  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1300  urate catabolism protein  28.09 
 
 
317 aa  86.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.540933  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2888  urate catabolism protein  26.4 
 
 
307 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.558847  normal  0.0871438 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  28.09 
 
 
316 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 
309 aa  86.7  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1744  urate catabolism protein  29.26 
 
 
470 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0499  putative polysaccharide deacetylase family protein  28.26 
 
 
300 aa  86.3  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.262777 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06518  polysaccharide deacetylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G05030)  29.15 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7199  hypothetical protein  29.39 
 
 
475 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1111  polysaccharide deacetylase  28.27 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  29.74 
 
 
475 aa  84.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2608  polysaccharide deacetylase  29.44 
 
 
470 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234618  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0882  polysaccharide deacetylase  24.67 
 
 
314 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0186045  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1951  polysaccharide deacetylase  26.8 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>