More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3296 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
315 aa  648    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  85.67 
 
 
321 aa  563  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  58.67 
 
 
299 aa  335  5.999999999999999e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  53.33 
 
 
295 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  53.33 
 
 
295 aa  312  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  53.33 
 
 
295 aa  312  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  54.58 
 
 
289 aa  308  5e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  54.58 
 
 
289 aa  308  5e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  54.58 
 
 
289 aa  308  5e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  55.64 
 
 
264 aa  306  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  50.89 
 
 
288 aa  305  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  37.82 
 
 
307 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  37.45 
 
 
307 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  37.45 
 
 
307 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  35.13 
 
 
302 aa  176  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  37.45 
 
 
307 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  37.65 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  37.09 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  33.92 
 
 
294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  38.15 
 
 
292 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  33.75 
 
 
336 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  37.64 
 
 
263 aa  170  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  37.59 
 
 
299 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  35.69 
 
 
271 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  34.8 
 
 
296 aa  162  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  36.64 
 
 
287 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  36.43 
 
 
277 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0928  polysaccharide deacetylase  37.28 
 
 
296 aa  155  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.686986  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 
298 aa  154  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  30.86 
 
 
281 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 
282 aa  149  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2100  hypothetical protein  35.36 
 
 
297 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2229  polysaccharide deacetylase  36.59 
 
 
296 aa  145  9e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  33.74 
 
 
293 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3485  polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 
300 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4391  polysaccharide deacetylase  34.96 
 
 
296 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.424954 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
293 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1415  putative polysaccharide deacetylase  33.47 
 
 
300 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  31.11 
 
 
290 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22830  predicted xylanase/chitin deacetylase  32.79 
 
 
295 aa  141  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  31.09 
 
 
290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  34.41 
 
 
294 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  33.74 
 
 
319 aa  139  7.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  32.52 
 
 
293 aa  135  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2033  polysaccharide deacetylase  33.74 
 
 
300 aa  135  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  30.63 
 
 
306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0672  polysaccharide deacetylase family protein  33.75 
 
 
293 aa  132  6e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.193798  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  32.52 
 
 
293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 
293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  32.51 
 
 
378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  32.11 
 
 
293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  31.3 
 
 
294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08606  hypothetical polysaccharide deacetylase (Eurofung)  28.08 
 
 
303 aa  127  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.940784  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39050  predicted xylanase/chitin deacetylase  30.49 
 
 
295 aa  123  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3513  polysaccharide deacetylase  31.34 
 
 
294 aa  124  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.206647  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  28.77 
 
 
279 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.932988 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0030  polysaccharide deacetylase  29.6 
 
 
299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  28.37 
 
 
296 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  28.83 
 
 
309 aa  108  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  28.33 
 
 
317 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  28.67 
 
 
308 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6169  polysaccharide deacetylase  28.52 
 
 
302 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06518  polysaccharide deacetylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G05030)  27.02 
 
 
295 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  28.72 
 
 
308 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  27.3 
 
 
316 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1987  urate catabolism protein  27.49 
 
 
317 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.567399 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  27.52 
 
 
308 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6114  polysaccharide deacetylase  27.49 
 
 
317 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1963  polysaccharide deacetylase  27.49 
 
 
317 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  29.96 
 
 
309 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1878  urate catabolism protein  27.49 
 
 
332 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312787  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2094  polysaccharide deacetylase  30.71 
 
 
284 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5278  polysaccharide deacetylase  27.15 
 
 
359 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1424  polysaccharide deacetylase  28.47 
 
 
312 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1951  polysaccharide deacetylase  27.49 
 
 
332 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  27.84 
 
 
309 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  27.85 
 
 
308 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2533  polysaccharide deacetylase family protein  27.3 
 
 
317 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2388  polysaccharide deacetylase  27.3 
 
 
317 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2432  polysaccharide deacetylase  27.3 
 
 
317 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3303  polysaccharide deacetylase family protein  27.3 
 
 
317 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248766  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1279  polysaccharide deacetylase family protein  27.3 
 
 
317 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.414457  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0355  polysaccharide deacetylase  30.04 
 
 
317 aa  98.6  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.0556603 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  27.52 
 
 
308 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  27.8 
 
 
308 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1926  putative polysaccharide deacetylase  26.96 
 
 
316 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  27.18 
 
 
308 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1508  polysaccharide deacetylase family protein  26.96 
 
 
317 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324299  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1300  urate catabolism protein  26.55 
 
 
317 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.540933  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2007  polysaccharide deacetylase family protein  26.96 
 
 
317 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2067  polysaccharide deacetylase family protein  26.96 
 
 
317 aa  96.3  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0203  polysaccharide deacetylase  30.48 
 
 
292 aa  95.9  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.37611  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2437  polysaccharide deacetylase  25.78 
 
 
316 aa  93.2  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  27.52 
 
 
308 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0882  polysaccharide deacetylase  25.78 
 
 
314 aa  92.8  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0186045  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6462  polysaccharide deacetylase  26.8 
 
 
302 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3184  putative polysaccharide deacetylase  29.11 
 
 
327 aa  90.1  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1100  urate catabolism protein  28.4 
 
 
336 aa  90.1  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0456  polysaccharide deacetylase  25.45 
 
 
330 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>