More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2857 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 296 aa  609  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3513  polysaccharide deacetylase  65.02 
 
 		 294 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.206647  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6169  polysaccharide deacetylase  53.77 
 
 		 302 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6462  polysaccharide deacetylase  53.77 
 
 		 302 aa  295  6e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  36.04 
 
 		 290 aa  175  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  36.04 
 
 		 290 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  33.81 
 
 		 281 aa  162  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  34.96 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  32.71 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 		 295 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 		 295 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  31.44 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  31.68 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  32.33 
 
 		 288 aa  122  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  32.41 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  33.07 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  29.01 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  29.59 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  29.37 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  28.37 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  31.34 
 
 		 289 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  31.34 
 
 		 289 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  31.34 
 
 		 289 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  27.73 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  29.26 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  29.92 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  27.87 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.87 
 
 		 307 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  29.26 
 
 		 306 aa  105  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  27.53 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  27.53 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  27.53 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2100  hypothetical protein  30.3 
 
 		 297 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0355  polysaccharide deacetylase  27.4 
 
 		 317 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.0556603 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  26.3 
 
 		 271 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3927  urate catabolism protein  29.45 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1424  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 312 aa  94  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  29.91 
 
 		 287 aa  92.8  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  26.86 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1508  polysaccharide deacetylase family protein  26.39 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324299  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2067  polysaccharide deacetylase family protein  26.04 
 
 		 317 aa  90.9  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2388  polysaccharide deacetylase  26.39 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2007  polysaccharide deacetylase family protein  26.39 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2533  polysaccharide deacetylase family protein  26.39 
 
 		 317 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1279  polysaccharide deacetylase family protein  26.39 
 
 		 317 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.414457  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2432  polysaccharide deacetylase  26.39 
 
 		 317 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3303  polysaccharide deacetylase family protein  26.39 
 
 		 317 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248766  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1926  putative polysaccharide deacetylase  26.46 
 
 		 316 aa  89.4  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1607  hypothetical protein  25.83 
 
 		 296 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  25.87 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  25.87 
 
 		 308 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0928  polysaccharide deacetylase  30.17 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  25.52 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2033  polysaccharide deacetylase  26.98 
 
 		 300 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08606  hypothetical polysaccharide deacetylase (Eurofung)  27.87 
 
 		 303 aa  87  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.940784  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  25.52 
 
 		 308 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1389  hypothetical protein  25.42 
 
 		 296 aa  87.4  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  25.77 
 
 		 316 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  25.52 
 
 		 308 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1100  urate catabolism protein  25.34 
 
 		 336 aa  86.7  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  23.4 
 
 		 309 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1111  polysaccharide deacetylase  25.51 
 
 		 322 aa  85.9  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1343  urate catabolism protein  26.39 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0882664  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  23.67 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1300  urate catabolism protein  25.33 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.540933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4388  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.677693  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  25 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03354  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B3VP82]  27.02 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  24.13 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  25.82 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.932988 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2437  polysaccharide deacetylase  25.34 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1878  urate catabolism protein  25.17 
 
 		 332 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312787  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  26.91 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1987  urate catabolism protein  25.17 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.567399 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1937  urate catabolism protein  24.41 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39074  normal  0.0426903 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  27.3 
 
 		 277 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2734  polysaccharide deacetylase  26.81 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562399  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1951  polysaccharide deacetylase  25.17 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  23.79 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3707  urate catabolism protein  25.78 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30682  predicted protein  25.84 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.673385  normal  0.0672265 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1919  polysaccharide deacetylase  25.83 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0659  urate catabolism protein  25.26 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  23.79 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0030  polysaccharide deacetylase  22.89 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  25.89 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6114  polysaccharide deacetylase  24.83 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0934  polysaccharide deacetylase  25.96 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1963  polysaccharide deacetylase  24.83 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0882  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0836  urate catabolism protein  24.48 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.391521  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2260  urate catabolism protein  24.07 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2116  urate catabolism protein  26.26 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  23.61 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5278  polysaccharide deacetylase  24.74 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2120  hypothetical protein  24.4 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.269264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  24.57 
 
 		 478 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0078  polysaccharide deacetylase  25.95 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>