More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3514 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 282 aa  584  1e-166  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  77.42 
 
 		 281 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  69.12 
 
 		 290 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  69.12 
 
 		 290 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  35.19 
 
 		 295 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  35.19 
 
 		 295 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  35.19 
 
 		 295 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  34.96 
 
 		 296 aa  158  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  33.94 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6462  polysaccharide deacetylase  39.41 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6169  polysaccharide deacetylase  38.35 
 
 		 302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  34.3 
 
 		 289 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 315 aa  149  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  34.3 
 
 		 289 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  34.3 
 
 		 289 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3513  polysaccharide deacetylase  34.46 
 
 		 294 aa  148  9e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.206647  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  31.64 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  33.72 
 
 		 264 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  31.21 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  30.6 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  31.21 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  32.05 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  31.21 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  30.6 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  32.1 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  32.39 
 
 		 298 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  31.52 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  33.58 
 
 		 271 aa  135  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  34.44 
 
 		 296 aa  135  9e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  29.04 
 
 		 302 aa  123  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2100  hypothetical protein  31.05 
 
 		 297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  29.43 
 
 		 306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  30.04 
 
 		 287 aa  119  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  28.94 
 
 		 279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.932988 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  30.88 
 
 		 277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  31.88 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  28.4 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  27.98 
 
 		 293 aa  108  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  27.98 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  29.06 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22830  predicted xylanase/chitin deacetylase  28.69 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  27.57 
 
 		 293 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4391  polysaccharide deacetylase  29.22 
 
 		 296 aa  106  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.424954 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0672  polysaccharide deacetylase family protein  27.8 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.193798  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  29.03 
 
 		 293 aa  104  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2033  polysaccharide deacetylase  27.57 
 
 		 300 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  28.63 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  28.63 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  26.25 
 
 		 336 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2229  polysaccharide deacetylase  26.26 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0203  polysaccharide deacetylase  33.57 
 
 		 292 aa  99.4  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.37611  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39050  predicted xylanase/chitin deacetylase  26.98 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  25.95 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  27.98 
 
 		 319 aa  93.6  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  28.52 
 
 		 299 aa  89.4  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  26.55 
 
 		 309 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03354  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B3VP82]  25.85 
 
 		 314 aa  87.4  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  26.55 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1424  polysaccharide deacetylase  27.34 
 
 		 312 aa  86.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0030  polysaccharide deacetylase  23.79 
 
 		 299 aa  85.5  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  26.9 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1919  polysaccharide deacetylase  29.34 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2022  polysaccharide deacetylase  26.21 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.664089  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2085  polysaccharide deacetylase  26.21 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793939  normal  0.404703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2039  polysaccharide deacetylase  26.21 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0836  urate catabolism protein  27.95 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.391521  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  26.21 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.190091 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06518  polysaccharide deacetylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G05030)  22.71 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  26.55 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  26.55 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  26.21 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  26.21 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  25.86 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3485  polysaccharide deacetylase  25.61 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1415  putative polysaccharide deacetylase  25.61 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1607  hypothetical protein  27.59 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1389  hypothetical protein  27.2 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  28.14 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0355  polysaccharide deacetylase  29.31 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.0556603 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0928  polysaccharide deacetylase  26.01 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0499  putative polysaccharide deacetylase family protein  25.89 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0934  polysaccharide deacetylase  28.51 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1100  urate catabolism protein  28.33 
 
 		 336 aa  79  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4388  polysaccharide deacetylase  30.34 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.677693  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  40.74 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  28.63 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  25.17 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0469  chitin deacetylase  23.71 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1926  putative polysaccharide deacetylase  29.34 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2116  urate catabolism protein  29.83 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3927  urate catabolism protein  27.9 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2094  polysaccharide deacetylase  28.52 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08606  hypothetical polysaccharide deacetylase (Eurofung)  23.36 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.940784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2437  polysaccharide deacetylase  27.04 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1343  urate catabolism protein  28.51 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0882664  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3707  urate catabolism protein  28.38 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  23.47 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1987  urate catabolism protein  28.15 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.567399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>