More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3485 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3485  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 300 aa  622  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1415  putative polysaccharide deacetylase  99.33 
 
 		 300 aa  620  1e-176  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  69.44 
 
 		 319 aa  442  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0672  polysaccharide deacetylase family protein  68.28 
 
 		 293 aa  429  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.193798  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  68.28 
 
 		 293 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  67.93 
 
 		 293 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  65.17 
 
 		 293 aa  420  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  65.52 
 
 		 294 aa  412  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  67.24 
 
 		 291 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  65.17 
 
 		 293 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2033  polysaccharide deacetylase  64.83 
 
 		 300 aa  408  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  65.17 
 
 		 293 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  64.83 
 
 		 293 aa  408  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2229  polysaccharide deacetylase  63.48 
 
 		 296 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4391  polysaccharide deacetylase  63.14 
 
 		 296 aa  403  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.424954 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  63.79 
 
 		 294 aa  400  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39050  predicted xylanase/chitin deacetylase  62.76 
 
 		 295 aa  395  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22830  predicted xylanase/chitin deacetylase  61.17 
 
 		 295 aa  376  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  58.05 
 
 		 378 aa  342  5.999999999999999e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06518  polysaccharide deacetylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G05030)  53.12 
 
 		 295 aa  329  3e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0030  polysaccharide deacetylase  43.06 
 
 		 299 aa  268  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08606  hypothetical polysaccharide deacetylase (Eurofung)  38.94 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.940784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  39.15 
 
 		 299 aa  200  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  35.23 
 
 		 307 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  35.23 
 
 		 307 aa  188  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  35.23 
 
 		 307 aa  188  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  35.23 
 
 		 307 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  35.23 
 
 		 307 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  33.7 
 
 		 271 aa  182  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  34.39 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.932988 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  35.48 
 
 		 277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0928  polysaccharide deacetylase  36.33 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 		 315 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 288 aa  139  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  30.34 
 
 		 289 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  30.34 
 
 		 289 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  30.34 
 
 		 289 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 264 aa  132  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 		 321 aa  132  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 295 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 295 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 295 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  27.86 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  28.11 
 
 		 299 aa  112  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  26.9 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  28.29 
 
 		 302 aa  103  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  26.42 
 
 		 306 aa  102  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  27.69 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  25.29 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  25.17 
 
 		 336 aa  99.4  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  25.68 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  26.03 
 
 		 290 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  28.29 
 
 		 298 aa  95.5  9e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  27.6 
 
 		 281 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  26.74 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0456  polysaccharide deacetylase  26.23 
 
 		 330 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0475  polysaccharide deacetylase  26.23 
 
 		 330 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3692  polysaccharide deacetylase  25.51 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  27.65 
 
 		 309 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  24.29 
 
 		 290 aa  85.9  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4151  polysaccharide deacetylase family protein  25.1 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  25.61 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  26.52 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  26.72 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1607  hypothetical protein  24.7 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  35.92 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09327  conserved hypothetical protein  26.22 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1389  hypothetical protein  24.7 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  25.94 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1393  polysaccharide deacetylase  26.07 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1353  polysaccharide deacetylase  26.07 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2608  polysaccharide deacetylase  26.04 
 
 		 470 aa  76.6  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1446  polysaccharide deacetylase  25.41 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4092  polysaccharide deacetylase  23.77 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  hitchhiker  0.00263168 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  25.28 
 
 		 470 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1300  urate catabolism protein  28.14 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.540933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0934  polysaccharide deacetylase  26.42 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0986  twin-arginine translocation pathway signal  25.41 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.649552  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  26.34 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1468  polysaccharide deacetylase  25.41 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2116  urate catabolism protein  26.36 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  25.84 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  28.03 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1881  polysaccharide deacetylase family protein  25.19 
 
 		 362 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1477  polysaccharide deacetylase  24.38 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1728  polysaccharide deacetylase family protein  25.19 
 
 		 366 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169494  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1547  polysaccharide deacetylase family protein  25.19 
 
 		 366 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0210  polysaccharide deacetylase family protein  25.19 
 
 		 366 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0152392  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1105  polysaccharide deacetylase family protein  25.19 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.253343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2100  hypothetical protein  27.8 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0954  polysaccharide deacetylase family protein  25.19 
 
 		 366 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1878  urate catabolism protein  27.82 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312787  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  34.29 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  25.19 
 
 		 308 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1987  urate catabolism protein  27.17 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.567399 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5278  polysaccharide deacetylase  27.07 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1951  polysaccharide deacetylase  27.82 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  38.32 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2388  polysaccharide deacetylase  27.17 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>