More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6461 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 290 aa  591  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  98.28 
 
 		 290 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  69.12 
 
 		 282 aa  389  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  64.41 
 
 		 281 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3513  polysaccharide deacetylase  38.63 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.206647  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  36.04 
 
 		 296 aa  175  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6169  polysaccharide deacetylase  38.46 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6462  polysaccharide deacetylase  38.11 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  37.59 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  34.28 
 
 		 298 aa  152  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  34.17 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 295 aa  148  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 295 aa  148  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 295 aa  148  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  33.58 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  35.16 
 
 		 289 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  34.94 
 
 		 288 aa  143  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  35.16 
 
 		 289 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  35.16 
 
 		 289 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.5 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  31.09 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  30.5 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  30.5 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  30.5 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  30.5 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  32.21 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  31.72 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  31.09 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  35.11 
 
 		 264 aa  135  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  30.75 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  34.98 
 
 		 263 aa  132  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  31.03 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  29.62 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  30.94 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.932988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2100  hypothetical protein  32.08 
 
 		 297 aa  122  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  33.7 
 
 		 277 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  30.2 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  29.89 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  29.75 
 
 		 293 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  30.22 
 
 		 306 aa  117  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0672  polysaccharide deacetylase family protein  28.08 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.193798  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  29.75 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  29.34 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22830  predicted xylanase/chitin deacetylase  29.02 
 
 		 295 aa  115  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2033  polysaccharide deacetylase  29.1 
 
 		 300 aa  112  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  28.98 
 
 		 293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  28.98 
 
 		 293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0203  polysaccharide deacetylase  33.82 
 
 		 292 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.37611  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4391  polysaccharide deacetylase  28.19 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.424954 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  28.57 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  28.93 
 
 		 294 aa  109  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  29.92 
 
 		 319 aa  109  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  29.24 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  28.9 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  28.37 
 
 		 294 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  28.9 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2229  polysaccharide deacetylase  26.51 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  28.57 
 
 		 308 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  28.04 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  28.72 
 
 		 308 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39050  predicted xylanase/chitin deacetylase  28.32 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0469  chitin deacetylase  26.35 
 
 		 308 aa  102  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  28.52 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  28.38 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0928  polysaccharide deacetylase  31.69 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  27.7 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 		 378 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2116  urate catabolism protein  26.73 
 
 		 322 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 309 aa  99.8  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1415  putative polysaccharide deacetylase  26.03 
 
 		 300 aa  99.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  29.43 
 
 		 299 aa  99.4  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3355  hypothetical protein  28.38 
 
 		 306 aa  99  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  27.7 
 
 		 308 aa  99  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1100  urate catabolism protein  29.33 
 
 		 336 aa  98.2  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3485  polysaccharide deacetylase  25.68 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08606  hypothetical polysaccharide deacetylase (Eurofung)  24.84 
 
 		 303 aa  97.1  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.940784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2888  urate catabolism protein  27.7 
 
 		 307 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.558847  normal  0.0871438 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3152  urate catabolism protein  28.38 
 
 		 307 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1919  polysaccharide deacetylase  26.64 
 
 		 326 aa  95.9  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0499  putative polysaccharide deacetylase family protein  27.59 
 
 		 300 aa  95.9  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0836  urate catabolism protein  27.65 
 
 		 314 aa  94.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.391521  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0355  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 317 aa  93.6  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.0556603 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1424  polysaccharide deacetylase  28.09 
 
 		 312 aa  93.2  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2022  polysaccharide deacetylase  28.23 
 
 		 304 aa  92  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.664089  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2039  polysaccharide deacetylase  28.23 
 
 		 304 aa  92  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2085  polysaccharide deacetylase  28.23 
 
 		 304 aa  92  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793939  normal  0.404703 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1987  urate catabolism protein  26.8 
 
 		 317 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.567399 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03354  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B3VP82]  27.08 
 
 		 314 aa  91.7  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5278  polysaccharide deacetylase  28.74 
 
 		 359 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1951  polysaccharide deacetylase  28.85 
 
 		 332 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3707  urate catabolism protein  26.62 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6114  polysaccharide deacetylase  26.47 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1963  polysaccharide deacetylase  26.47 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1878  urate catabolism protein  28.74 
 
 		 332 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312787  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  26.23 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2067  polysaccharide deacetylase family protein  29.2 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1300  urate catabolism protein  26.33 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.540933  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2120  hypothetical protein  24.6 
 
 		 328 aa  89  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.269264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0030  polysaccharide deacetylase  26.72 
 
 		 299 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1937  urate catabolism protein  27.67 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39074  normal  0.0426903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>