More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1692 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  100 
 
 		 293 aa  612  9.999999999999999e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  99.32 
 
 		 293 aa  607  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  99.32 
 
 		 293 aa  607  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  86.25 
 
 		 293 aa  534  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  85.91 
 
 		 293 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  81.79 
 
 		 291 aa  505  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  78.62 
 
 		 294 aa  493  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  77.4 
 
 		 293 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2033  polysaccharide deacetylase  78.62 
 
 		 300 aa  483  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0672  polysaccharide deacetylase family protein  75 
 
 		 293 aa  477  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.193798  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  74.23 
 
 		 294 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39050  predicted xylanase/chitin deacetylase  73.63 
 
 		 295 aa  465  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  71.72 
 
 		 319 aa  460  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4391  polysaccharide deacetylase  70.45 
 
 		 296 aa  448  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.424954 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2229  polysaccharide deacetylase  70.45 
 
 		 296 aa  443  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22830  predicted xylanase/chitin deacetylase  68.15 
 
 		 295 aa  428  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3485  polysaccharide deacetylase  64.83 
 
 		 300 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1415  putative polysaccharide deacetylase  65.17 
 
 		 300 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  64.53 
 
 		 378 aa  377  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06518  polysaccharide deacetylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G05030)  57.64 
 
 		 295 aa  357  9e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0030  polysaccharide deacetylase  46.43 
 
 		 299 aa  291  1e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08606  hypothetical polysaccharide deacetylase (Eurofung)  41.2 
 
 		 303 aa  238  8e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.940784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  38.43 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  38.43 
 
 		 307 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  38.43 
 
 		 307 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  38.43 
 
 		 307 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  38.43 
 
 		 307 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  36.5 
 
 		 271 aa  193  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  38.19 
 
 		 299 aa  192  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  37.46 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  35.56 
 
 		 279 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.932988 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0928  polysaccharide deacetylase  38.01 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  33.8 
 
 		 287 aa  169  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  33.22 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  35.13 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  33.89 
 
 		 289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  33.89 
 
 		 289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  33.89 
 
 		 289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  32.37 
 
 		 299 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  31.91 
 
 		 295 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  31.91 
 
 		 295 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  31.56 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  32.11 
 
 		 315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  30.89 
 
 		 296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  31.3 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  30.53 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  30.2 
 
 		 263 aa  112  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  29.06 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  28.16 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  28.62 
 
 		 302 aa  109  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  28.98 
 
 		 290 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2100  hypothetical protein  32.87 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  29.33 
 
 		 292 aa  106  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  29.03 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  26.34 
 
 		 306 aa  102  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  26.79 
 
 		 336 aa  99.4  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  23.89 
 
 		 290 aa  89.7  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0456  polysaccharide deacetylase  26.34 
 
 		 330 aa  85.5  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0475  polysaccharide deacetylase  26.34 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1477  polysaccharide deacetylase  24.29 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  28.46 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  26.91 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  28.46 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2116  urate catabolism protein  27.24 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4151  polysaccharide deacetylase family protein  26.75 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3692  polysaccharide deacetylase  25.51 
 
 		 334 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1607  hypothetical protein  25.74 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1389  hypothetical protein  25.74 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2210  polysaccharide deacetylase  38.94 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1685  polysaccharide deacetylase  38.89 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000637976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3513  polysaccharide deacetylase  25.82 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.206647  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  25.29 
 
 		 470 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  25.81 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0429  polysaccharide deacetylase  26.99 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  26.19 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0934  polysaccharide deacetylase  26.59 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4321  polysaccharide deacetylase  28.69 
 
 		 313 aa  72.4  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2608  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 470 aa  71.6  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  27.38 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3151  polysaccharide deacetylase  24.9 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952588  normal  0.0334716 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1363  hypothetical protein  24.83 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  27.38 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  27.38 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  27.38 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5255  polysaccharide deacetylase  25.58 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.339328 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1053  hypothetical protein  26.55 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1926  putative polysaccharide deacetylase  26.86 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2217  polysaccharide deactylase family protein, PEP- CTERM locus subfamily  34.21 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.691781  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5904  polysaccharide deacetylase  25.35 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3554  hypothetical protein  25.09 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1656  polysaccharide deacetylase  34.11 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  26.45 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  31.25 
 
 		 276 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4036  PEP-CTERM locus, polysaccharide deactylase  31.37 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216969  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1393  polysaccharide deacetylase  25.7 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1353  polysaccharide deacetylase  25.81 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>