More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0799 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 290 aa  607  1e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1477  polysaccharide deacetylase  38.21 
 
 		 298 aa  221  8e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3692  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4151  polysaccharide deacetylase family protein  28.57 
 
 		 334 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0475  polysaccharide deacetylase  28.07 
 
 		 330 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0456  polysaccharide deacetylase  28.07 
 
 		 330 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09327  conserved hypothetical protein  27.42 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4195  polysaccharide deacetylase  25.74 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  25.61 
 
 		 309 aa  99  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  25.96 
 
 		 309 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 289 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02512  hypothetical protein  28.16 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 289 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 289 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1056  polysaccharide deacetylase  27.01 
 
 		 302 aa  97.1  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  25.98 
 
 		 308 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  25.98 
 
 		 308 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  25.98 
 
 		 308 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  26.45 
 
 		 264 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3450  polysaccharide deacetylase  24.39 
 
 		 316 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  25.62 
 
 		 308 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  25.62 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  25.74 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  25.74 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1446  polysaccharide deacetylase  26.16 
 
 		 336 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0499  putative polysaccharide deacetylase family protein  29.35 
 
 		 300 aa  93.6  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  27.02 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  25.86 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  24.6 
 
 		 294 aa  93.6  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  26.16 
 
 		 308 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0986  twin-arginine translocation pathway signal  26.16 
 
 		 336 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.649552  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1353  polysaccharide deacetylase  27.08 
 
 		 341 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1393  polysaccharide deacetylase  27.08 
 
 		 336 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1468  polysaccharide deacetylase  26.16 
 
 		 336 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  25.37 
 
 		 295 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  24.19 
 
 		 378 aa  92.8  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4566  polysaccharide deacetylase  26.57 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  25.09 
 
 		 288 aa  92  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2229  polysaccharide deacetylase  24.29 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1389  hypothetical protein  26.15 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  26.41 
 
 		 309 aa  90.9  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  26.69 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0836  urate catabolism protein  27.21 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.391521  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1607  hypothetical protein  25.09 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  21.96 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  23.89 
 
 		 293 aa  89.7  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  25.98 
 
 		 308 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2734  polysaccharide deacetylase  25.37 
 
 		 307 aa  89  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562399  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2605  polysaccharide deacetylase family protein  26.24 
 
 		 364 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1919  polysaccharide deacetylase  26.86 
 
 		 326 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8430  polysaccharide deacetylase  24.91 
 
 		 298 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  22.18 
 
 		 293 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  22.97 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  23.48 
 
 		 293 aa  86.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  23.48 
 
 		 293 aa  86.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  22.64 
 
 		 307 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  26.47 
 
 		 292 aa  86.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1702  polysaccharide deacetylase family protein  25.18 
 
 		 366 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2260  urate catabolism protein  26.22 
 
 		 320 aa  86.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3485  polysaccharide deacetylase  24.29 
 
 		 300 aa  85.9  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1937  urate catabolism protein  26.22 
 
 		 320 aa  85.5  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39074  normal  0.0426903 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  25.44 
 
 		 302 aa  85.5  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  21.77 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3707  urate catabolism protein  25.27 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  30.22 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  25.81 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1105  polysaccharide deacetylase family protein  25.09 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.253343  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0210  polysaccharide deacetylase family protein  25.09 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0152392  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1881  polysaccharide deacetylase family protein  25.09 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1415  putative polysaccharide deacetylase  23.89 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1547  polysaccharide deacetylase family protein  25.09 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4092  polysaccharide deacetylase  25.19 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  hitchhiker  0.00263168 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  22.64 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0954  polysaccharide deacetylase family protein  25.09 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  22.64 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  22.64 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2533  polysaccharide deacetylase family protein  25.96 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2388  polysaccharide deacetylase  25.96 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2432  polysaccharide deacetylase  25.96 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0469  chitin deacetylase  24.22 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1926  putative polysaccharide deacetylase  26.06 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5904  polysaccharide deacetylase  22.55 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1728  polysaccharide deacetylase family protein  24.73 
 
 		 366 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169494  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2608  polysaccharide deacetylase  25.87 
 
 		 470 aa  82.8  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1279  polysaccharide deacetylase family protein  25.96 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.414457  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0934  polysaccharide deacetylase  25.45 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3303  polysaccharide deacetylase family protein  25.96 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248766  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1053  hypothetical protein  23.28 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3927  urate catabolism protein  24.83 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0216  urate catabolism protein  26.39 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.668034  normal  0.0222485 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  26.22 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3035  chitin deacetylase  25.17 
 
 		 471 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1300  urate catabolism protein  26.32 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.540933  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2120  hypothetical protein  25.17 
 
 		 328 aa  82  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.269264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  25.18 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1508  polysaccharide deacetylase family protein  25.96 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324299  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2007  polysaccharide deacetylase family protein  25.96 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  25.35 
 
 		 470 aa  81.6  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2422  polysaccharide deacetylase  25.99 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  25.27 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>