More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5661 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
289 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
289 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
289 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  84.88 
 
 
288 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  87.22 
 
 
264 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  64.56 
 
 
299 aa  366  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  62.28 
 
 
295 aa  352  4e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  62.28 
 
 
295 aa  352  4e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  61.92 
 
 
295 aa  351  1e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  56.25 
 
 
321 aa  314  9.999999999999999e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  54.58 
 
 
315 aa  308  5e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  37.69 
 
 
302 aa  182  7e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  35.87 
 
 
294 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  39.93 
 
 
277 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  40.5 
 
 
292 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  37.59 
 
 
307 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  37.23 
 
 
307 aa  168  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  41.43 
 
 
287 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  41.04 
 
 
298 aa  167  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  38.66 
 
 
296 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  37.23 
 
 
307 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  37.23 
 
 
307 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  37.23 
 
 
307 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  41.2 
 
 
263 aa  166  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  35.97 
 
 
281 aa  165  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  38.77 
 
 
299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  39.56 
 
 
271 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  33.89 
 
 
293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  33.55 
 
 
293 aa  149  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  34.3 
 
 
282 aa  149  7e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  33.55 
 
 
293 aa  149  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  34.67 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  33.68 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22830  predicted xylanase/chitin deacetylase  33.57 
 
 
295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0928  polysaccharide deacetylase  38.18 
 
 
296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.686986  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  33.68 
 
 
293 aa  145  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  35.14 
 
 
273 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39050  predicted xylanase/chitin deacetylase  33.91 
 
 
295 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  35.53 
 
 
290 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  35.16 
 
 
290 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4391  polysaccharide deacetylase  33.21 
 
 
296 aa  142  7e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.424954 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  32.74 
 
 
336 aa  142  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2229  polysaccharide deacetylase  34.31 
 
 
296 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  32.4 
 
 
291 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  34.8 
 
 
306 aa  138  8.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0030  polysaccharide deacetylase  33.74 
 
 
299 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2033  polysaccharide deacetylase  32.64 
 
 
300 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0672  polysaccharide deacetylase family protein  31.25 
 
 
293 aa  136  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.193798  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  32.64 
 
 
294 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3485  polysaccharide deacetylase  30.34 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3513  polysaccharide deacetylase  34.33 
 
 
294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.206647  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1415  putative polysaccharide deacetylase  30 
 
 
300 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 
319 aa  129  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2100  hypothetical protein  34.31 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
378 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08606  hypothetical polysaccharide deacetylase (Eurofung)  34.6 
 
 
303 aa  122  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.940784  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6169  polysaccharide deacetylase  32.97 
 
 
302 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  31.34 
 
 
296 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.67916 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06518  polysaccharide deacetylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G05030)  30.29 
 
 
295 aa  113  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  29.89 
 
 
279 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.932988 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6462  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 
302 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 
290 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1477  polysaccharide deacetylase  28.93 
 
 
298 aa  94.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0203  polysaccharide deacetylase  31.36 
 
 
292 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.37611  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8430  polysaccharide deacetylase  28 
 
 
298 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  31.03 
 
 
308 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  29.18 
 
 
309 aa  89  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  29.23 
 
 
308 aa  89  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  30.93 
 
 
308 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  30.96 
 
 
309 aa  87.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1172  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 
281 aa  87.8  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  28.47 
 
 
309 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5278  polysaccharide deacetylase  30.21 
 
 
359 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1951  polysaccharide deacetylase  30.9 
 
 
332 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1878  urate catabolism protein  30.9 
 
 
332 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312787  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1987  urate catabolism protein  30.21 
 
 
317 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.567399 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  30.9 
 
 
317 aa  86.7  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6114  polysaccharide deacetylase  30.21 
 
 
317 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1963  polysaccharide deacetylase  30.21 
 
 
317 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  29.86 
 
 
316 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1926  putative polysaccharide deacetylase  30.21 
 
 
316 aa  86.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2360  polysaccharide deacetylase  42.48 
 
 
293 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1300  urate catabolism protein  29.86 
 
 
317 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.540933  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  38.13 
 
 
280 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2510  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  44.74 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.710977 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 
308 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2718  polysaccharide deacetylase  27.49 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1923  polysaccharide deacetylase  41.96 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2432  polysaccharide deacetylase  29.86 
 
 
317 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1508  polysaccharide deacetylase family protein  29.86 
 
 
317 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324299  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1279  polysaccharide deacetylase family protein  29.86 
 
 
317 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.414457  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2533  polysaccharide deacetylase family protein  29.86 
 
 
317 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1774  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  40.52 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2388  polysaccharide deacetylase  29.86 
 
 
317 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3066  polysaccharide deacetylase  39.83 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00688884  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2007  polysaccharide deacetylase family protein  29.86 
 
 
317 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  28.42 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3303  polysaccharide deacetylase family protein  29.86 
 
 
317 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248766  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3151  polysaccharide deacetylase  26.86 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952588  normal  0.0334716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>