299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0499 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0499  putative polysaccharide deacetylase family protein  100 
 
 		 300 aa  610  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4321  polysaccharide deacetylase  64.95 
 
 		 313 aa  363  1e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  46.82 
 
 		 309 aa  285  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  47.83 
 
 		 308 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  48.16 
 
 		 308 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  47.83 
 
 		 308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  48.98 
 
 		 308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  47.16 
 
 		 308 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  47.33 
 
 		 309 aa  281  9e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  46.82 
 
 		 308 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6198  urate catabolism protein  51.34 
 
 		 318 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  49 
 
 		 309 aa  279  4e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  48.3 
 
 		 308 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3707  urate catabolism protein  47.33 
 
 		 305 aa  276  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  46.33 
 
 		 308 aa  276  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2437  polysaccharide deacetylase  47.54 
 
 		 316 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2022  polysaccharide deacetylase  48.84 
 
 		 304 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.664089  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2039  polysaccharide deacetylase  48.84 
 
 		 304 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2085  polysaccharide deacetylase  48.84 
 
 		 304 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793939  normal  0.404703 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0078  polysaccharide deacetylase  47.68 
 
 		 313 aa  267  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1878  urate catabolism protein  47.23 
 
 		 332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312787  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1951  polysaccharide deacetylase  47.23 
 
 		 332 aa  265  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5278  polysaccharide deacetylase  46.91 
 
 		 359 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6114  polysaccharide deacetylase  47.23 
 
 		 317 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1963  polysaccharide deacetylase  47.23 
 
 		 317 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1987  urate catabolism protein  47.23 
 
 		 317 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.567399 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2067  polysaccharide deacetylase family protein  47.23 
 
 		 317 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2533  polysaccharide deacetylase family protein  46.58 
 
 		 317 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2432  polysaccharide deacetylase  46.58 
 
 		 317 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3303  polysaccharide deacetylase family protein  46.58 
 
 		 317 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248766  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1279  polysaccharide deacetylase family protein  46.58 
 
 		 317 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.414457  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2388  polysaccharide deacetylase  46.58 
 
 		 317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0882  polysaccharide deacetylase  45.25 
 
 		 314 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1300  urate catabolism protein  45.93 
 
 		 317 aa  258  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.540933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  47.02 
 
 		 316 aa  258  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4116  polysaccharide deacetylase  44.75 
 
 		 303 aa  258  8e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1508  polysaccharide deacetylase family protein  46.58 
 
 		 317 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324299  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2007  polysaccharide deacetylase family protein  46.58 
 
 		 317 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1919  polysaccharide deacetylase  41.69 
 
 		 326 aa  257  2e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0916  chitin deacetylase  43.14 
 
 		 312 aa  256  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0355  polysaccharide deacetylase  45.36 
 
 		 317 aa  256  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.0556603 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0934  polysaccharide deacetylase  45.79 
 
 		 308 aa  255  6e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2116  urate catabolism protein  45.67 
 
 		 322 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1424  polysaccharide deacetylase  45.07 
 
 		 312 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2120  hypothetical protein  43.93 
 
 		 328 aa  253  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.269264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1937  urate catabolism protein  44.26 
 
 		 320 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39074  normal  0.0426903 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1926  putative polysaccharide deacetylase  46.03 
 
 		 316 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  44.95 
 
 		 317 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1343  urate catabolism protein  43 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0882664  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  43.71 
 
 		 482 aa  249  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2260  urate catabolism protein  43.28 
 
 		 320 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0869  urate catabolism protein  41.97 
 
 		 315 aa  248  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1058  polysaccharide deacetylase family protein  42.52 
 
 		 316 aa  247  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0216  urate catabolism protein  45.12 
 
 		 301 aa  246  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.668034  normal  0.0222485 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0777  hypothetical protein  43.38 
 
 		 314 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1100  urate catabolism protein  42.52 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1111  urate catabolism protein  42.19 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.808218  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0901  urate catabolism protein  41.58 
 
 		 316 aa  243  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2422  polysaccharide deacetylase  41.22 
 
 		 301 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7199  hypothetical protein  41.72 
 
 		 475 aa  242  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3184  putative polysaccharide deacetylase  49.16 
 
 		 327 aa  242  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3355  hypothetical protein  44.04 
 
 		 306 aa  242  7e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0469  chitin deacetylase  42.16 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0836  urate catabolism protein  42.28 
 
 		 314 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.391521  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0659  urate catabolism protein  41.58 
 
 		 319 aa  239  4e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3927  urate catabolism protein  42.62 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3475  polysaccharide deacetylase  42.28 
 
 		 471 aa  236  3e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  42.57 
 
 		 475 aa  236  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4489  chitin deacetylase  42.62 
 
 		 309 aa  235  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.785698 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1111  polysaccharide deacetylase  42.62 
 
 		 322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02512  hypothetical protein  41.24 
 
 		 293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2888  urate catabolism protein  42.52 
 
 		 307 aa  232  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.558847  normal  0.0871438 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  42.42 
 
 		 478 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3152  urate catabolism protein  42.71 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4388  polysaccharide deacetylase  41.31 
 
 		 323 aa  228  8e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.677693  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2608  polysaccharide deacetylase  42.72 
 
 		 470 aa  227  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  40.4 
 
 		 478 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5684  Chitin deacetylase  41.18 
 
 		 302 aa  225  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260048  normal  0.439054 
 
 
-
 
NC_004310  BR0347  hypothetical protein  42.57 
 
 		 475 aa  224  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.399937  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2718  polysaccharide deacetylase  42.7 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0363  hypothetical protein  42.57 
 
 		 475 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2063  urate catabolism protein  43.05 
 
 		 470 aa  223  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890496 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1069  urate catabolism protein  43.05 
 
 		 470 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0248428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1744  urate catabolism protein  43.05 
 
 		 470 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3035  chitin deacetylase  42.09 
 
 		 471 aa  221  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  44.59 
 
 		 471 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5844  urate catabolism protein  42.47 
 
 		 387 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306631 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0206  polysaccharide deacetylase  41.75 
 
 		 471 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1554  polysaccharide deacetylase  41.41 
 
 		 471 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.442375  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1117  polysaccharide deacetylase  40.91 
 
 		 319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107227  normal  0.334948 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1037  urate catabolism protein  41.23 
 
 		 319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3795  polysaccharide deacetylase  40.94 
 
 		 470 aa  216  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0520356 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1607  hypothetical protein  37.33 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1389  hypothetical protein  36.99 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03787  polysaccharide deacetylase family protein  41.69 
 
 		 296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3151  polysaccharide deacetylase  40.48 
 
 		 295 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952588  normal  0.0334716 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2110  urate catabolism protein  39.29 
 
 		 318 aa  212  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.822591  normal  0.031958 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  39.74 
 
 		 470 aa  210  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2831  polysaccharide deacetylase  41.5 
 
 		 478 aa  208  7e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.729324  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09327  conserved hypothetical protein  37.14 
 
 		 337 aa  208  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.598208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>