231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0078 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0078  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
313 aa  645    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1343  urate catabolism protein  74.59 
 
 
310 aa  497  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0882664  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1878  urate catabolism protein  77.52 
 
 
332 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312787  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5278  polysaccharide deacetylase  76.55 
 
 
359 aa  494  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1951  polysaccharide deacetylase  77.52 
 
 
332 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  77.67 
 
 
317 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1937  urate catabolism protein  73.68 
 
 
320 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39074  normal  0.0426903 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1987  urate catabolism protein  77.38 
 
 
317 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.567399 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6114  polysaccharide deacetylase  77.05 
 
 
317 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1963  polysaccharide deacetylase  77.05 
 
 
317 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2437  polysaccharide deacetylase  73.68 
 
 
316 aa  487  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2260  urate catabolism protein  73.03 
 
 
320 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671776  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0882  polysaccharide deacetylase  74.01 
 
 
314 aa  487  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0186045  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0355  polysaccharide deacetylase  75.67 
 
 
317 aa  485  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.0556603 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1926  putative polysaccharide deacetylase  76.72 
 
 
316 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1300  urate catabolism protein  74.92 
 
 
317 aa  481  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.540933  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  75.41 
 
 
316 aa  480  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1100  urate catabolism protein  73.14 
 
 
336 aa  479  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2120  hypothetical protein  71.38 
 
 
328 aa  477  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.269264  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2388  polysaccharide deacetylase  74.1 
 
 
317 aa  474  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0916  chitin deacetylase  72.33 
 
 
312 aa  476  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1111  polysaccharide deacetylase  71.29 
 
 
322 aa  474  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1508  polysaccharide deacetylase family protein  73.77 
 
 
317 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324299  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2533  polysaccharide deacetylase family protein  74.1 
 
 
317 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2432  polysaccharide deacetylase  74.1 
 
 
317 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2067  polysaccharide deacetylase family protein  74.1 
 
 
317 aa  472  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2007  polysaccharide deacetylase family protein  73.77 
 
 
317 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1279  polysaccharide deacetylase family protein  74.1 
 
 
317 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.414457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3303  polysaccharide deacetylase family protein  74.1 
 
 
317 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248766  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2110  urate catabolism protein  69.43 
 
 
318 aa  466  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.822591  normal  0.031958 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1424  polysaccharide deacetylase  70.13 
 
 
312 aa  463  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3927  urate catabolism protein  69.9 
 
 
323 aa  464  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1037  urate catabolism protein  69.21 
 
 
319 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1117  polysaccharide deacetylase  67.94 
 
 
319 aa  454  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107227  normal  0.334948 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4388  polysaccharide deacetylase  67.1 
 
 
323 aa  452  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.677693  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0869  urate catabolism protein  68.63 
 
 
315 aa  449  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1058  polysaccharide deacetylase family protein  66.34 
 
 
316 aa  450  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0901  urate catabolism protein  65.71 
 
 
316 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0659  urate catabolism protein  67.67 
 
 
319 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1111  urate catabolism protein  65.8 
 
 
316 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.808218  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0777  hypothetical protein  68.51 
 
 
314 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6198  urate catabolism protein  69.9 
 
 
318 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0934  polysaccharide deacetylase  65.89 
 
 
308 aa  422  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2039  polysaccharide deacetylase  67.88 
 
 
304 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2022  polysaccharide deacetylase  67.88 
 
 
304 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.664089  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2085  polysaccharide deacetylase  67.88 
 
 
304 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793939  normal  0.404703 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0469  chitin deacetylase  63.88 
 
 
308 aa  421  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  64.14 
 
 
308 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2116  urate catabolism protein  63.96 
 
 
322 aa  416  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  63.82 
 
 
308 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  63.82 
 
 
308 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  63.49 
 
 
308 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  61.18 
 
 
309 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  61.18 
 
 
309 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  62.5 
 
 
308 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3707  urate catabolism protein  62.58 
 
 
305 aa  399  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482899  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  61.18 
 
 
308 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  61.84 
 
 
308 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  62.58 
 
 
309 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  60.93 
 
 
308 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1919  polysaccharide deacetylase  58.03 
 
 
326 aa  388  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2422  polysaccharide deacetylase  60.07 
 
 
301 aa  389  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1744  urate catabolism protein  62 
 
 
470 aa  381  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7199  hypothetical protein  57.57 
 
 
475 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2063  urate catabolism protein  61.67 
 
 
470 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890496 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0216  urate catabolism protein  60.06 
 
 
301 aa  372  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.668034  normal  0.0222485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1069  urate catabolism protein  61 
 
 
470 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0248428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  60.13 
 
 
478 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  55.59 
 
 
482 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3355  hypothetical protein  58.5 
 
 
306 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4489  chitin deacetylase  57.14 
 
 
309 aa  364  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.785698 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02512  hypothetical protein  59.32 
 
 
293 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  57.58 
 
 
475 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  59 
 
 
478 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3152  urate catabolism protein  57.24 
 
 
307 aa  358  8e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2888  urate catabolism protein  57.24 
 
 
307 aa  358  8e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.558847  normal  0.0871438 
 
 
-
 
NC_004310  BR0347  hypothetical protein  56.81 
 
 
475 aa  351  7e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.399937  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0363  hypothetical protein  56.81 
 
 
475 aa  351  7e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0836  urate catabolism protein  55.41 
 
 
314 aa  351  8e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.391521  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3533  chitin deacetylase 1  64.71 
 
 
255 aa  348  5e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0673867 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  57.43 
 
 
471 aa  345  4e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1163  chitin deacetylase  56.81 
 
 
307 aa  343  2e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.425036  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0206  polysaccharide deacetylase  56.67 
 
 
471 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3475  polysaccharide deacetylase  55.3 
 
 
471 aa  340  2e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40619  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3795  polysaccharide deacetylase  56.29 
 
 
470 aa  340  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0520356 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5844  urate catabolism protein  56.03 
 
 
387 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000306631 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1554  polysaccharide deacetylase  56 
 
 
471 aa  335  5e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.442375  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3035  chitin deacetylase  55.33 
 
 
471 aa  331  8e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2831  polysaccharide deacetylase  55.12 
 
 
478 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.729324  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2608  polysaccharide deacetylase  54.64 
 
 
470 aa  322  6e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234618  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  53.64 
 
 
470 aa  320  3e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03787  polysaccharide deacetylase family protein  54.33 
 
 
296 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40052  predicted protein  45.85 
 
 
377 aa  284  2.0000000000000002e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09327  conserved hypothetical protein  43.21 
 
 
337 aa  272  6e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1389  hypothetical protein  43.29 
 
 
296 aa  270  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1607  hypothetical protein  43.29 
 
 
296 aa  269  4e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0499  putative polysaccharide deacetylase family protein  47.68 
 
 
300 aa  267  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4116  polysaccharide deacetylase  46.67 
 
 
303 aa  263  3e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30682  predicted protein  42.58 
 
 
339 aa  261  6.999999999999999e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.673385  normal  0.0672265 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4268  chitin deacetylase  55.92 
 
 
220 aa  249  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>