233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1100 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1100  urate catabolism protein  100 
 
 		 336 aa  692    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0355  polysaccharide deacetylase  85.53 
 
 		 317 aa  567  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.0556603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1343  urate catabolism protein  79.35 
 
 		 310 aa  524  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0882664  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1424  polysaccharide deacetylase  79.15 
 
 		 312 aa  517  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3927  urate catabolism protein  76.13 
 
 		 323 aa  506  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1111  polysaccharide deacetylase  75.87 
 
 		 322 aa  501  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4388  polysaccharide deacetylase  75.33 
 
 		 323 aa  486  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.677693  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5278  polysaccharide deacetylase  75.75 
 
 		 359 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1987  urate catabolism protein  76.08 
 
 		 317 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.567399 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  75.58 
 
 		 317 aa  482  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  74.75 
 
 		 316 aa  481  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1937  urate catabolism protein  71.57 
 
 		 320 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39074  normal  0.0426903 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2260  urate catabolism protein  71.25 
 
 		 320 aa  480  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1878  urate catabolism protein  74.03 
 
 		 332 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312787  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1926  putative polysaccharide deacetylase  75.08 
 
 		 316 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0078  polysaccharide deacetylase  73.14 
 
 		 313 aa  479  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0882  polysaccharide deacetylase  71.66 
 
 		 314 aa  479  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6114  polysaccharide deacetylase  75.75 
 
 		 317 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1951  polysaccharide deacetylase  74.03 
 
 		 332 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1963  polysaccharide deacetylase  75.75 
 
 		 317 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1300  urate catabolism protein  74.67 
 
 		 317 aa  481  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.540933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2437  polysaccharide deacetylase  70.38 
 
 		 316 aa  477  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2120  hypothetical protein  69.09 
 
 		 328 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.269264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2533  polysaccharide deacetylase family protein  73.75 
 
 		 317 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2432  polysaccharide deacetylase  73.75 
 
 		 317 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2388  polysaccharide deacetylase  73.75 
 
 		 317 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3303  polysaccharide deacetylase family protein  73.75 
 
 		 317 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248766  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2067  polysaccharide deacetylase family protein  73.75 
 
 		 317 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1279  polysaccharide deacetylase family protein  73.75 
 
 		 317 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.414457  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1508  polysaccharide deacetylase family protein  73.42 
 
 		 317 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324299  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2110  urate catabolism protein  72.35 
 
 		 318 aa  467  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.822591  normal  0.031958 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2007  polysaccharide deacetylase family protein  73.42 
 
 		 317 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1037  urate catabolism protein  71.38 
 
 		 319 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1117  polysaccharide deacetylase  70.38 
 
 		 319 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107227  normal  0.334948 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0777  hypothetical protein  69.45 
 
 		 314 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0901  urate catabolism protein  67.44 
 
 		 316 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0659  urate catabolism protein  64.47 
 
 		 319 aa  432  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0869  urate catabolism protein  66.01 
 
 		 315 aa  433  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0916  chitin deacetylase  65.45 
 
 		 312 aa  429  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1058  polysaccharide deacetylase family protein  63.7 
 
 		 316 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1111  urate catabolism protein  63.37 
 
 		 316 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.808218  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0469  chitin deacetylase  62.21 
 
 		 308 aa  411  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2116  urate catabolism protein  62.87 
 
 		 322 aa  403  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  60 
 
 		 308 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  59.68 
 
 		 308 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  60 
 
 		 308 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  59.35 
 
 		 308 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0934  polysaccharide deacetylase  63.79 
 
 		 308 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6198  urate catabolism protein  63.93 
 
 		 318 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2022  polysaccharide deacetylase  62.87 
 
 		 304 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.664089  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2039  polysaccharide deacetylase  62.87 
 
 		 304 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  60.32 
 
 		 308 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2085  polysaccharide deacetylase  62.87 
 
 		 304 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793939  normal  0.404703 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  57.74 
 
 		 309 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  59.68 
 
 		 308 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3707  urate catabolism protein  61.59 
 
 		 305 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  57.28 
 
 		 309 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  58.36 
 
 		 308 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  60.26 
 
 		 308 aa  386  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  62.05 
 
 		 309 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1919  polysaccharide deacetylase  55.1 
 
 		 326 aa  380  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7199  hypothetical protein  56.49 
 
 		 475 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1744  urate catabolism protein  60.93 
 
 		 470 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1069  urate catabolism protein  61.2 
 
 		 470 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0248428 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2063  urate catabolism protein  61.2 
 
 		 470 aa  368  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890496 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2422  polysaccharide deacetylase  56.15 
 
 		 301 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0216  urate catabolism protein  59.14 
 
 		 301 aa  367  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.668034  normal  0.0222485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  57.7 
 
 		 478 aa  362  4e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02512  hypothetical protein  56.42 
 
 		 293 aa  361  9e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  57.38 
 
 		 478 aa  360  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  56.48 
 
 		 482 aa  358  6e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  57.05 
 
 		 475 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4489  chitin deacetylase  56.86 
 
 		 309 aa  355  5e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.785698 
 
 
-
 
NC_004310  BR0347  hypothetical protein  56.95 
 
 		 475 aa  349  5e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.399937  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0363  hypothetical protein  56.95 
 
 		 475 aa  349  5e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3355  hypothetical protein  53.92 
 
 		 306 aa  345  7e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  57.24 
 
 		 471 aa  344  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2888  urate catabolism protein  53.55 
 
 		 307 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.558847  normal  0.0871438 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3795  polysaccharide deacetylase  55.92 
 
 		 470 aa  340  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0520356 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5844  urate catabolism protein  56.62 
 
 		 387 aa  340  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306631 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3152  urate catabolism protein  53.23 
 
 		 307 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3533  chitin deacetylase 1  62.66 
 
 		 255 aa  338  5.9999999999999996e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0673867 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3475  polysaccharide deacetylase  54.46 
 
 		 471 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0836  urate catabolism protein  54.49 
 
 		 314 aa  335  5.999999999999999e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.391521  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0206  polysaccharide deacetylase  55.15 
 
 		 471 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2831  polysaccharide deacetylase  53.9 
 
 		 478 aa  330  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.729324  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3035  chitin deacetylase  54.82 
 
 		 471 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1554  polysaccharide deacetylase  54.49 
 
 		 471 aa  329  4e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.442375  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1163  chitin deacetylase  55.15 
 
 		 307 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.425036  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  52.12 
 
 		 470 aa  317  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2608  polysaccharide deacetylase  51.82 
 
 		 470 aa  317  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03787  polysaccharide deacetylase family protein  52.17 
 
 		 296 aa  300  3e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1607  hypothetical protein  44.63 
 
 		 296 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1389  hypothetical protein  44.3 
 
 		 296 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40052  predicted protein  44.62 
 
 		 377 aa  275  6e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4116  polysaccharide deacetylase  46.33 
 
 		 303 aa  258  9e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.795588 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09327  conserved hypothetical protein  41.21 
 
 		 337 aa  255  9e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4268  chitin deacetylase  56.4 
 
 		 220 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30682  predicted protein  41.03 
 
 		 339 aa  248  9e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.673385  normal  0.0672265 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0499  putative polysaccharide deacetylase family protein  42.52 
 
 		 300 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>