215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2718 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2718  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 298 aa  622  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0499  putative polysaccharide deacetylase family protein  42.7 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  40.07 
 
 		 309 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  41.4 
 
 		 308 aa  223  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  39.37 
 
 		 309 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  39.79 
 
 		 308 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  39.79 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  39.44 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  39.79 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  39.44 
 
 		 308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  39.44 
 
 		 308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  41.79 
 
 		 478 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1300  urate catabolism protein  39.86 
 
 		 317 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.540933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  40.21 
 
 		 316 aa  209  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0916  chitin deacetylase  40.35 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1508  polysaccharide deacetylase family protein  38.85 
 
 		 317 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324299  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2007  polysaccharide deacetylase family protein  38.85 
 
 		 317 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1279  polysaccharide deacetylase family protein  38.85 
 
 		 317 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.414457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3303  polysaccharide deacetylase family protein  38.85 
 
 		 317 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248766  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2533  polysaccharide deacetylase family protein  38.85 
 
 		 317 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  38.46 
 
 		 308 aa  206  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2067  polysaccharide deacetylase family protein  39.19 
 
 		 317 aa  206  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2432  polysaccharide deacetylase  38.85 
 
 		 317 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4116  polysaccharide deacetylase  38.95 
 
 		 303 aa  205  7e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1926  putative polysaccharide deacetylase  39.51 
 
 		 316 aa  205  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2388  polysaccharide deacetylase  38.51 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  39.3 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2120  hypothetical protein  38.51 
 
 		 328 aa  202  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.269264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5278  polysaccharide deacetylase  38.51 
 
 		 359 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6114  polysaccharide deacetylase  38.51 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1963  polysaccharide deacetylase  38.51 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  39.19 
 
 		 317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0355  polysaccharide deacetylase  38.78 
 
 		 317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.0556603 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2039  polysaccharide deacetylase  39.16 
 
 		 304 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2085  polysaccharide deacetylase  39.16 
 
 		 304 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793939  normal  0.404703 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1987  urate catabolism protein  38.18 
 
 		 317 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.567399 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2022  polysaccharide deacetylase  39.16 
 
 		 304 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.664089  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0659  urate catabolism protein  38.81 
 
 		 319 aa  198  9e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3707  urate catabolism protein  40 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1058  polysaccharide deacetylase family protein  38.46 
 
 		 316 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2116  urate catabolism protein  39.46 
 
 		 322 aa  196  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6198  urate catabolism protein  40.21 
 
 		 318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1878  urate catabolism protein  37.5 
 
 		 332 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312787  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0078  polysaccharide deacetylase  39.02 
 
 		 313 aa  196  5.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0869  urate catabolism protein  37.54 
 
 		 315 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1951  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 332 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09327  conserved hypothetical protein  38.67 
 
 		 337 aa  194  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2437  polysaccharide deacetylase  38.01 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1100  urate catabolism protein  38.11 
 
 		 336 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1919  polysaccharide deacetylase  36.73 
 
 		 326 aa  195  1e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0836  urate catabolism protein  38.52 
 
 		 314 aa  194  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.391521  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02512  hypothetical protein  37.81 
 
 		 293 aa  195  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0901  urate catabolism protein  37.54 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2260  urate catabolism protein  37.93 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1937  urate catabolism protein  37.93 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39074  normal  0.0426903 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1111  urate catabolism protein  38.11 
 
 		 316 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.808218  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  39.93 
 
 		 475 aa  192  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1343  urate catabolism protein  37.19 
 
 		 310 aa  192  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0882664  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3927  urate catabolism protein  37.59 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0882  polysaccharide deacetylase  36.61 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2063  urate catabolism protein  38.41 
 
 		 470 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890496 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1424  polysaccharide deacetylase  37.41 
 
 		 312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  40.22 
 
 		 478 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7199  hypothetical protein  36.75 
 
 		 475 aa  188  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2422  polysaccharide deacetylase  36.84 
 
 		 301 aa  188  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0469  chitin deacetylase  36.77 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1069  urate catabolism protein  38.06 
 
 		 470 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0248428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2888  urate catabolism protein  40.21 
 
 		 307 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.558847  normal  0.0871438 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1744  urate catabolism protein  37.72 
 
 		 470 aa  187  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3152  urate catabolism protein  39.16 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0216  urate catabolism protein  38.68 
 
 		 301 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.668034  normal  0.0222485 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1111  polysaccharide deacetylase  35.47 
 
 		 322 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0934  polysaccharide deacetylase  35.93 
 
 		 308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3355  hypothetical protein  38.6 
 
 		 306 aa  182  8.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4321  polysaccharide deacetylase  37.23 
 
 		 313 aa  182  8.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  36.21 
 
 		 482 aa  180  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3475  polysaccharide deacetylase  36.04 
 
 		 471 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0777  hypothetical protein  36.68 
 
 		 314 aa  179  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  37.97 
 
 		 470 aa  176  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4489  chitin deacetylase  35.46 
 
 		 309 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.785698 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5844  urate catabolism protein  38.71 
 
 		 387 aa  175  7e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306631 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3035  chitin deacetylase  36.33 
 
 		 471 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0347  hypothetical protein  37.75 
 
 		 475 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.399937  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1554  polysaccharide deacetylase  37.1 
 
 		 471 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.442375  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0363  hypothetical protein  37.75 
 
 		 475 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4388  polysaccharide deacetylase  36.08 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.677693  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0206  polysaccharide deacetylase  37.1 
 
 		 471 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  35.69 
 
 		 471 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3533  chitin deacetylase 1  39.57 
 
 		 255 aa  170  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0673867 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3795  polysaccharide deacetylase  34.9 
 
 		 470 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0520356 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1105  polysaccharide deacetylase family protein  36.63 
 
 		 362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.253343  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2608  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 470 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1547  polysaccharide deacetylase family protein  36.63 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0210  polysaccharide deacetylase family protein  36.63 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0152392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0954  polysaccharide deacetylase family protein  36.63 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4151  polysaccharide deacetylase family protein  34.41 
 
 		 334 aa  163  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1881  polysaccharide deacetylase family protein  36.63 
 
 		 362 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1702  polysaccharide deacetylase family protein  36.63 
 
 		 366 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40052  predicted protein  35.6 
 
 		 377 aa  162  5.0000000000000005e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1353  polysaccharide deacetylase  35.11 
 
 		 341 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>