More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2229 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2229  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 296 aa  612  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4391  polysaccharide deacetylase  82.43 
 
 		 296 aa  522  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.424954 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  73.54 
 
 		 293 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2033  polysaccharide deacetylase  74.48 
 
 		 300 aa  464  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  73.2 
 
 		 293 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0672  polysaccharide deacetylase family protein  69.07 
 
 		 293 aa  450  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.193798  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  70.79 
 
 		 293 aa  444  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  68.04 
 
 		 293 aa  445  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  70.79 
 
 		 293 aa  444  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  70.1 
 
 		 294 aa  442  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  68.6 
 
 		 294 aa  442  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  70.45 
 
 		 293 aa  443  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39050  predicted xylanase/chitin deacetylase  71.48 
 
 		 295 aa  444  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  70.45 
 
 		 291 aa  439  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  76.03 
 
 		 378 aa  437  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  68.86 
 
 		 319 aa  435  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22830  predicted xylanase/chitin deacetylase  67.81 
 
 		 295 aa  426  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3485  polysaccharide deacetylase  63.48 
 
 		 300 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1415  putative polysaccharide deacetylase  63.48 
 
 		 300 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06518  polysaccharide deacetylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G05030)  53.74 
 
 		 295 aa  343  2.9999999999999997e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0030  polysaccharide deacetylase  45.36 
 
 		 299 aa  272  4.0000000000000004e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08606  hypothetical polysaccharide deacetylase (Eurofung)  38.87 
 
 		 303 aa  226  4e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.940784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  36.88 
 
 		 307 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  37.01 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  37.01 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  37.01 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  36.65 
 
 		 307 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  38.41 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.932988 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  37.1 
 
 		 271 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  37.41 
 
 		 277 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  37.93 
 
 		 299 aa  189  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0928  polysaccharide deacetylase  38.83 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  34.97 
 
 		 287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  36.23 
 
 		 299 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  36.59 
 
 		 315 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  35.77 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  34.44 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  34.31 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  34.31 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  34.31 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  32.3 
 
 		 295 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  32.3 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  32.3 
 
 		 295 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  30.12 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  27.82 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  29.5 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  30.98 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  26.51 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  26.85 
 
 		 290 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 		 298 aa  104  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  29.03 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  26.26 
 
 		 282 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  28.28 
 
 		 302 aa  99.4  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  25.6 
 
 		 336 aa  95.1  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  24.29 
 
 		 290 aa  92  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2100  hypothetical protein  29.97 
 
 		 297 aa  86.3  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1300  urate catabolism protein  30.67 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.540933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  29.41 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1685  polysaccharide deacetylase  31.55 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000637976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1878  urate catabolism protein  28.79 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312787  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1951  polysaccharide deacetylase  28.79 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1987  urate catabolism protein  28.79 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.567399 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5278  polysaccharide deacetylase  28.03 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2388  polysaccharide deacetylase  29.28 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2533  polysaccharide deacetylase family protein  29.28 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2432  polysaccharide deacetylase  29.28 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4151  polysaccharide deacetylase family protein  24.51 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1279  polysaccharide deacetylase family protein  29.28 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.414457  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2067  polysaccharide deacetylase family protein  29.28 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6114  polysaccharide deacetylase  28.03 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3303  polysaccharide deacetylase family protein  29.28 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248766  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1963  polysaccharide deacetylase  28.03 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  26.09 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3513  polysaccharide deacetylase  24.08 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.206647  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1926  putative polysaccharide deacetylase  28.99 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0456  polysaccharide deacetylase  23.32 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2007  polysaccharide deacetylase family protein  28.9 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1508  polysaccharide deacetylase family protein  28.9 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324299  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1477  polysaccharide deacetylase  22.58 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0475  polysaccharide deacetylase  23.32 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  29.29 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3692  polysaccharide deacetylase  23.72 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  26.24 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2094  polysaccharide deacetylase  36.7 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1948  polysaccharide deacetylase  32 
 
 		 249 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000715916  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1393  polysaccharide deacetylase  26.29 
 
 		 336 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2116  urate catabolism protein  28.57 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0986  twin-arginine translocation pathway signal  25.9 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.649552  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1353  polysaccharide deacetylase  26.29 
 
 		 341 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1468  polysaccharide deacetylase  25.9 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  24.62 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1446  polysaccharide deacetylase  25.5 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  36.28 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  23.75 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  35.9 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0203  polysaccharide deacetylase  36.89 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.37611  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4388  polysaccharide deacetylase  25.56 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.677693  normal  0.766307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>