More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2742 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 319 aa  664    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  73.2 
 
 		 293 aa  474  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  73.2 
 
 		 293 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  72.85 
 
 		 293 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0672  polysaccharide deacetylase family protein  71.82 
 
 		 293 aa  461  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.193798  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  72.07 
 
 		 293 aa  461  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  72.07 
 
 		 293 aa  461  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  71.72 
 
 		 293 aa  460  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  70.89 
 
 		 294 aa  458  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  72.66 
 
 		 291 aa  454  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2033  polysaccharide deacetylase  71.18 
 
 		 300 aa  450  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  71.38 
 
 		 294 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1415  putative polysaccharide deacetylase  70.14 
 
 		 300 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4391  polysaccharide deacetylase  69.66 
 
 		 296 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.424954 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3485  polysaccharide deacetylase  69.44 
 
 		 300 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39050  predicted xylanase/chitin deacetylase  69.66 
 
 		 295 aa  438  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2229  polysaccharide deacetylase  68.86 
 
 		 296 aa  435  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22830  predicted xylanase/chitin deacetylase  69.18 
 
 		 295 aa  433  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  64.53 
 
 		 378 aa  375  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06518  polysaccharide deacetylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G05030)  57.58 
 
 		 295 aa  359  3e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0030  polysaccharide deacetylase  46.43 
 
 		 299 aa  277  1e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08606  hypothetical polysaccharide deacetylase (Eurofung)  40.73 
 
 		 303 aa  238  9e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.940784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  37.68 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  37.68 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  37.68 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  37.68 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  37.68 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  36.81 
 
 		 299 aa  192  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  36.2 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 279 aa  185  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.932988 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  35.51 
 
 		 287 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  35.44 
 
 		 277 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0928  polysaccharide deacetylase  36.69 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  33.74 
 
 		 315 aa  139  8.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 		 321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  32.95 
 
 		 288 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  33.47 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 		 289 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 		 289 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 		 289 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  30.6 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  30.6 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  30.6 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  31.42 
 
 		 299 aa  119  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  30.5 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  29.92 
 
 		 290 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  27.31 
 
 		 296 aa  109  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  30.33 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  26.62 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  26.42 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  27.14 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  28.87 
 
 		 292 aa  99.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  24.9 
 
 		 263 aa  94  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  27.98 
 
 		 282 aa  93.6  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  28.81 
 
 		 281 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0456  polysaccharide deacetylase  25.41 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  26.92 
 
 		 302 aa  90.9  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0475  polysaccharide deacetylase  25.41 
 
 		 330 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4151  polysaccharide deacetylase family protein  25.1 
 
 		 334 aa  87.8  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  24.52 
 
 		 336 aa  87.4  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2100  hypothetical protein  29.08 
 
 		 297 aa  87  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3692  polysaccharide deacetylase  25.1 
 
 		 334 aa  87  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1300  urate catabolism protein  31.85 
 
 		 317 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.540933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  31.45 
 
 		 316 aa  86.3  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  30.12 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  32.14 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1393  polysaccharide deacetylase  29.76 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5278  polysaccharide deacetylase  31.2 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1685  polysaccharide deacetylase  31.18 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000637976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1987  urate catabolism protein  31.2 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.567399 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1353  polysaccharide deacetylase  29.76 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1878  urate catabolism protein  31.2 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312787  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6114  polysaccharide deacetylase  30.83 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1963  polysaccharide deacetylase  30.83 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  28.19 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2210  polysaccharide deacetylase  32.83 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1951  polysaccharide deacetylase  31.2 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  29.57 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1607  hypothetical protein  24.18 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1926  putative polysaccharide deacetylase  31.3 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0469  chitin deacetylase  28.52 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  27.89 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1389  hypothetical protein  24.18 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1446  polysaccharide deacetylase  27.63 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  30.83 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0986  twin-arginine translocation pathway signal  27.63 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.649552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1468  polysaccharide deacetylase  27.63 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2067  polysaccharide deacetylase family protein  30.65 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2533  polysaccharide deacetylase family protein  30.49 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2388  polysaccharide deacetylase  30.49 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2432  polysaccharide deacetylase  30.49 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3303  polysaccharide deacetylase family protein  30.49 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248766  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1279  polysaccharide deacetylase family protein  30.49 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.414457  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2422  polysaccharide deacetylase  27.63 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2116  urate catabolism protein  28.85 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1477  polysaccharide deacetylase  23.86 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1100  urate catabolism protein  30.49 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  28.79 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1508  polysaccharide deacetylase family protein  29.88 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324299  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4036  PEP-CTERM locus, polysaccharide deactylase  38.32 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216969  normal  0.884964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>