More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5709 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 294 aa  609  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  67.12 
 
 		 302 aa  428  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  37.81 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  33.22 
 
 		 295 aa  185  9e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  33.22 
 
 		 295 aa  185  9e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  32.87 
 
 		 295 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  33.92 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  35.87 
 
 		 289 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  35.87 
 
 		 289 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  35.87 
 
 		 289 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  33.1 
 
 		 321 aa  167  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  33.94 
 
 		 288 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 264 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  34.19 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  34.74 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  34.74 
 
 		 307 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  34.74 
 
 		 307 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  34.74 
 
 		 307 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  34.39 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  35.56 
 
 		 296 aa  152  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  33.46 
 
 		 298 aa  142  7e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  32.58 
 
 		 271 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  31.72 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  36.65 
 
 		 287 aa  136  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  31.27 
 
 		 290 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  32.02 
 
 		 273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  32.94 
 
 		 263 aa  132  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  31.42 
 
 		 299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  30.74 
 
 		 306 aa  129  7.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  30.75 
 
 		 336 aa  126  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  31.27 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  29.71 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  30.11 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2100  hypothetical protein  32.36 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0928  polysaccharide deacetylase  32.71 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2033  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  28.83 
 
 		 279 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.932988 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  27.96 
 
 		 281 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  28.16 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  27.74 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  28.16 
 
 		 293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  28.16 
 
 		 293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  29.26 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  27.34 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39050  predicted xylanase/chitin deacetylase  28.88 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2229  polysaccharide deacetylase  29.03 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  26.81 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4391  polysaccharide deacetylase  27.18 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.424954 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0672  polysaccharide deacetylase family protein  28.82 
 
 		 293 aa  103  5e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.193798  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22830  predicted xylanase/chitin deacetylase  27.24 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3485  polysaccharide deacetylase  27.69 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1415  putative polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  26.62 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08606  hypothetical polysaccharide deacetylase (Eurofung)  35.71 
 
 		 303 aa  99.8  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.940784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3513  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 294 aa  99  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.206647  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  26.94 
 
 		 378 aa  98.6  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6169  polysaccharide deacetylase  28.93 
 
 		 302 aa  95.9  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0030  polysaccharide deacetylase  26.21 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06518  polysaccharide deacetylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G05030)  26.77 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2094  polysaccharide deacetylase  25.91 
 
 		 284 aa  89.7  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3554  hypothetical protein  29.15 
 
 		 313 aa  88.2  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6462  polysaccharide deacetylase  27.5 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1363  hypothetical protein  27.5 
 
 		 321 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722651 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0429  polysaccharide deacetylase  26.81 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5255  polysaccharide deacetylase  26.8 
 
 		 321 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.339328 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3066  polysaccharide deacetylase  28.98 
 
 		 283 aa  85.5  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00688884  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1053  hypothetical protein  25.45 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4195  polysaccharide deacetylase  27.76 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0203  polysaccharide deacetylase  27.5 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.37611  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2473  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  34.16 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1774  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  34.16 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  36.29 
 
 		 280 aa  82  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2360  polysaccharide deacetylase  33.81 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5904  polysaccharide deacetylase  26.07 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1730  polysaccharide deacetylase  30.66 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1685  polysaccharide deacetylase  30.5 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000637976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  24.57 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  33.8 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2470  polysaccharide deacetylase  34.53 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0684  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  31.65 
 
 		 283 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.934486 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2217  polysaccharide deactylase family protein, PEP- CTERM locus subfamily  33.09 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.691781  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1919  polysaccharide deacetylase  25.52 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  24.56 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  23.49 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6198  urate catabolism protein  28.83 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4850  polysaccharide deacetylase  26.64 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  25.17 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  25.45 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0499  putative polysaccharide deacetylase family protein  24.91 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2210  polysaccharide deacetylase  31.69 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  23.49 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1969  polysaccharide deacetylase  27.59 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25912  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3707  urate catabolism protein  28 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  23.84 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3617  polysaccharide deacetylase  30.71 
 
 		 281 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000367499  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  23.49 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  24.38 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 		 470 aa  71.2  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>