More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2326 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 294 aa  608  1e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39050  predicted xylanase/chitin deacetylase  80.27 
 
 		 295 aa  511  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  77.4 
 
 		 293 aa  484  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  77.4 
 
 		 293 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0672  polysaccharide deacetylase family protein  76.29 
 
 		 293 aa  479  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.193798  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  76.29 
 
 		 293 aa  479  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  75.95 
 
 		 291 aa  474  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  74.57 
 
 		 293 aa  471  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  74.57 
 
 		 293 aa  471  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  74.23 
 
 		 293 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  73.04 
 
 		 294 aa  465  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2033  polysaccharide deacetylase  76.55 
 
 		 300 aa  467  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22830  predicted xylanase/chitin deacetylase  71.19 
 
 		 295 aa  457  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4391  polysaccharide deacetylase  72.35 
 
 		 296 aa  457  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.424954 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  71.38 
 
 		 319 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2229  polysaccharide deacetylase  70.1 
 
 		 296 aa  442  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1415  putative polysaccharide deacetylase  63.79 
 
 		 300 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3485  polysaccharide deacetylase  63.79 
 
 		 300 aa  400  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  67.29 
 
 		 378 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06518  polysaccharide deacetylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G05030)  56.12 
 
 		 295 aa  348  9e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0030  polysaccharide deacetylase  49.64 
 
 		 299 aa  291  9e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08606  hypothetical polysaccharide deacetylase (Eurofung)  39.87 
 
 		 303 aa  233  3e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.940784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  39.72 
 
 		 307 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  39.72 
 
 		 307 aa  215  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  39.72 
 
 		 307 aa  214  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  39.72 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  39.72 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  38.25 
 
 		 287 aa  195  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  35.84 
 
 		 271 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  36.46 
 
 		 299 aa  185  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  38.85 
 
 		 279 aa  185  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.932988 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0928  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 296 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  33.79 
 
 		 288 aa  148  9e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  34.67 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  35.97 
 
 		 264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  34.67 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  34.67 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  36 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  34.41 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  34.03 
 
 		 299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  33.11 
 
 		 295 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  33.11 
 
 		 295 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  32.76 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  31.27 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  29.81 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  29.8 
 
 		 263 aa  119  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  29.58 
 
 		 273 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  30.47 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  30.33 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  29.06 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  28.37 
 
 		 290 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  28.72 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  29.82 
 
 		 292 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  27.17 
 
 		 281 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2100  hypothetical protein  31.62 
 
 		 297 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  27.71 
 
 		 336 aa  99.4  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  24.6 
 
 		 290 aa  93.6  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1446  polysaccharide deacetylase  30.71 
 
 		 336 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0986  twin-arginine translocation pathway signal  30.71 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.649552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1468  polysaccharide deacetylase  30.71 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1393  polysaccharide deacetylase  29.53 
 
 		 336 aa  89.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1353  polysaccharide deacetylase  29.53 
 
 		 341 aa  89.4  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  31.2 
 
 		 309 aa  85.9  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0429  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1105  polysaccharide deacetylase family protein  29.53 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.253343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1881  polysaccharide deacetylase family protein  29.53 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1728  polysaccharide deacetylase family protein  29.53 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169494  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  30.08 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  30.47 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0210  polysaccharide deacetylase family protein  29.53 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0152392  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1547  polysaccharide deacetylase family protein  29.53 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0954  polysaccharide deacetylase family protein  29.53 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1702  polysaccharide deacetylase family protein  29.53 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1477  polysaccharide deacetylase  23.79 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2605  polysaccharide deacetylase family protein  28.74 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1607  hypothetical protein  25.31 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1389  hypothetical protein  24.9 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0475  polysaccharide deacetylase  26.12 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0456  polysaccharide deacetylase  26.12 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1300  urate catabolism protein  31.15 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.540933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2116  urate catabolism protein  29.18 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4092  polysaccharide deacetylase  24.49 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  hitchhiker  0.00263168 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  24.39 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1919  polysaccharide deacetylase  29.62 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4151  polysaccharide deacetylase family protein  25.71 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1948  polysaccharide deacetylase  34.4 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000715916  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1926  putative polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1878  urate catabolism protein  30.45 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312787  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0469  chitin deacetylase  29.57 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5904  polysaccharide deacetylase  25.7 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  29.62 
 
 		 309 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1987  urate catabolism protein  30.33 
 
 		 317 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.567399 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1951  polysaccharide deacetylase  30.45 
 
 		 332 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1100  urate catabolism protein  29.07 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  31.28 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1053  hypothetical protein  27.21 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  30.86 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1963  polysaccharide deacetylase  29.92 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>