More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6286 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 277 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  55.06 
 
 		 271 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  47.76 
 
 		 299 aa  228  7e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  42.48 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  42.48 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  42.48 
 
 		 307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  42.11 
 
 		 307 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  44.66 
 
 		 287 aa  213  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  41.73 
 
 		 307 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0928  polysaccharide deacetylase  46.15 
 
 		 296 aa  206  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  41.51 
 
 		 279 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.932988 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22830  predicted xylanase/chitin deacetylase  38.6 
 
 		 295 aa  202  5e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  38.52 
 
 		 293 aa  202  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  39.78 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  39.78 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  38.38 
 
 		 291 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4391  polysaccharide deacetylase  37.28 
 
 		 296 aa  192  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.424954 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  37.46 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  38.71 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2229  polysaccharide deacetylase  37.41 
 
 		 296 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  37.46 
 
 		 293 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  37.46 
 
 		 293 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2033  polysaccharide deacetylase  37.28 
 
 		 300 aa  185  8e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  41.26 
 
 		 288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0672  polysaccharide deacetylase family protein  36.62 
 
 		 293 aa  181  8.000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.193798  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  40.6 
 
 		 264 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  36.43 
 
 		 378 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39050  predicted xylanase/chitin deacetylase  36.27 
 
 		 295 aa  178  9e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0030  polysaccharide deacetylase  35.48 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1415  putative polysaccharide deacetylase  35.84 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3485  polysaccharide deacetylase  35.48 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  35.44 
 
 		 319 aa  172  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  39.93 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  39.93 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  39.93 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06518  polysaccharide deacetylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G05030)  33.57 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  37.55 
 
 		 263 aa  155  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  36.43 
 
 		 315 aa  155  7e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08606  hypothetical polysaccharide deacetylase (Eurofung)  33.33 
 
 		 303 aa  155  8e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.940784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  35.69 
 
 		 321 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  36.53 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  36.53 
 
 		 295 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  37.92 
 
 		 296 aa  152  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  36.53 
 
 		 295 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  35.51 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  33.96 
 
 		 336 aa  145  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  32.71 
 
 		 298 aa  134  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  34.32 
 
 		 306 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  32.12 
 
 		 273 aa  133  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  32.78 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  30.63 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  33.7 
 
 		 290 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  34.43 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  31.84 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  30.11 
 
 		 294 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  30.88 
 
 		 282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2100  hypothetical protein  33.33 
 
 		 297 aa  98.6  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3513  polysaccharide deacetylase  28.99 
 
 		 294 aa  97.1  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.206647  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  27.3 
 
 		 296 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0203  polysaccharide deacetylase  42.99 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.37611  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2094  polysaccharide deacetylase  40.52 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6169  polysaccharide deacetylase  29.1 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6462  polysaccharide deacetylase  29.51 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1919  polysaccharide deacetylase  27.76 
 
 		 326 aa  72.4  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  26.36 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1685  polysaccharide deacetylase  27.31 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000637976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  26.78 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  25.94 
 
 		 308 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  25.52 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  25.94 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  25.94 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  26.67 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1730  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 241 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2360  polysaccharide deacetylase  36.94 
 
 		 293 aa  67  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2210  polysaccharide deacetylase  36.22 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  26.78 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1172  polysaccharide deacetylase  31.47 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1056  polysaccharide deacetylase  22.03 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09327  conserved hypothetical protein  24.51 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  26.56 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0836  urate catabolism protein  27.27 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.391521  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1477  polysaccharide deacetylase  24.91 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  32.94 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0078  polysaccharide deacetylase  24.69 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0399  polysaccharide deacetylase  26.41 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  34.68 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2470  polysaccharide deacetylase  38.05 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  25.94 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0934  polysaccharide deacetylase  26.21 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  25.52 
 
 		 308 aa  62  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2422  polysaccharide deacetylase  24.58 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  31.37 
 
 		 238 aa  62  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1774  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  34.23 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  32.18 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  23.05 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2217  polysaccharide deactylase family protein, PEP- CTERM locus subfamily  34.23 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.691781  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2260  urate catabolism protein  24.7 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02597  Polysaccharide deacetylase  33.94 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14174  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2473  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  33.33 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>