More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2470 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2470  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 301 aa  622  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2473  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  67.75 
 
 		 279 aa  407  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1774  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  67.75 
 
 		 279 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2360  polysaccharide deacetylase  67.52 
 
 		 293 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2217  polysaccharide deactylase family protein, PEP- CTERM locus subfamily  60.63 
 
 		 298 aa  365  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.691781  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3066  polysaccharide deacetylase  57.09 
 
 		 283 aa  338  5e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00688884  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0684  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  57.09 
 
 		 283 aa  338  5e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.934486 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1656  polysaccharide deacetylase  54.64 
 
 		 299 aa  316  3e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2388  polysaccharide deacetylase  55.52 
 
 		 304 aa  301  8.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0139  FkbH  49.66 
 
 		 295 aa  301  9e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0287  polysaccharide deacetylase  52.9 
 
 		 277 aa  290  2e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1980  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  52.07 
 
 		 293 aa  288  9e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0143  polysaccharide deacetylase  53.99 
 
 		 310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.839924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3114  polysaccharide deacetylase  50 
 
 		 305 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3276  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  51.99 
 
 		 279 aa  281  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231611  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1172  polysaccharide deacetylase  50.72 
 
 		 281 aa  279  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2510  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  52.54 
 
 		 302 aa  277  1e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.710977 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2524  polysaccharide deacetylase  50 
 
 		 281 aa  277  2e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0713961  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  50.36 
 
 		 280 aa  273  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2403  polysaccharide deacetylase  52.54 
 
 		 279 aa  272  4.0000000000000004e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1981  polysaccharide deacetylase  48.55 
 
 		 283 aa  272  5.000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0664  polysaccharide deacetylase  49.28 
 
 		 291 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0290858  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0835  polysaccharide deacetylase family protein  54.2 
 
 		 249 aa  263  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4036  PEP-CTERM locus, polysaccharide deactylase  47.31 
 
 		 292 aa  259  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216969  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0588  polysaccharide deacetylase  48.91 
 
 		 282 aa  258  9e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620562 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1517  polysaccharide deacetylase  47.48 
 
 		 301 aa  251  7e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0751328  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2331  polysaccharide deacetylase  44.93 
 
 		 293 aa  248  7e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1923  polysaccharide deacetylase  44.72 
 
 		 286 aa  246  4e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02597  Polysaccharide deacetylase  44.04 
 
 		 270 aa  237  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14174  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2968  polysaccharide deacetylase  49.28 
 
 		 284 aa  225  7e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3617  polysaccharide deacetylase  41.4 
 
 		 281 aa  186  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000367499  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2617  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1685  polysaccharide deacetylase  36.65 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000637976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2587  polysaccharide deacetylase  32.28 
 
 		 284 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784325  normal  0.845625 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2210  polysaccharide deacetylase  36.14 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  36.46 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0831  polysaccharide deacetylase  32.08 
 
 		 307 aa  122  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00177779  normal  0.177326 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1104  polysaccharide deacetylase  32.29 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2238  polysaccharide deacetylase  27.42 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  34.55 
 
 		 295 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  34.55 
 
 		 295 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  34.55 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  42.73 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  34.53 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  39.82 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  34.53 
 
 		 294 aa  79  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  36.79 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  38.94 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  38.94 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  38.94 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0203  polysaccharide deacetylase  41.51 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.37611  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  38.94 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  42.22 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  40.95 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1730  polysaccharide deacetylase  28 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  41.67 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  32.86 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  28.48 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  37.84 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  39.45 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  34.65 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1349  polysaccharide deacetylase  29.09 
 
 		 317 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.723796 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1330  polysaccharide deacetylase  29.09 
 
 		 317 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  34.26 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1313  polysaccharide deacetylase  29.09 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  36.7 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  33.91 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  37.96 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  36.7 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  33.91 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  33.91 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  37.04 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2167  polysaccharide deacetylase family protein  42.55 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000111858  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1037  polysaccharide deacetylase  38.82 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742911 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  40.7 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1550  polysaccharide deacetylase  34.17 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0260353  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  40.7 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  35.78 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  39.53 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  33.91 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0234  polysaccharide deacetylase  27.86 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  33.91 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6669  polysaccharide deacetylase  36.84 
 
 		 240 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.422259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  41.86 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1878  polysaccharide deacetylase family protein  41.49 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117322  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  32.5 
 
 		 276 aa  67  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2151  polysaccharide deacetylase  39.53 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342073  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  33.03 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2817  polysaccharide deacetylase  39.53 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2765  polysaccharide deacetylase  39.53 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468013  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  42.11 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4179  polysaccharide deacetylase  40.48 
 
 		 266 aa  67  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5979  polysaccharide deacetylase  42.05 
 
 		 285 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185285  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  32.5 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0650  polysaccharide deacetylase  37.76 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1728  polysaccharide deacetylase family protein  37.39 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000179283  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5514  polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.77719  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  39.53 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0236101 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>