More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1980 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1980  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  100 
 
 		 293 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3276  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  53.07 
 
 		 279 aa  295  4e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231611  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1774  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  51.71 
 
 		 279 aa  293  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2473  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  51.71 
 
 		 279 aa  292  5e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0287  polysaccharide deacetylase  52.13 
 
 		 277 aa  288  7e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2470  polysaccharide deacetylase  52.07 
 
 		 301 aa  288  9e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2388  polysaccharide deacetylase  51.92 
 
 		 304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1172  polysaccharide deacetylase  47.22 
 
 		 281 aa  285  5e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2217  polysaccharide deactylase family protein, PEP- CTERM locus subfamily  49.66 
 
 		 298 aa  285  7e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.691781  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0139  FkbH  47.04 
 
 		 295 aa  285  7e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0664  polysaccharide deacetylase  50.54 
 
 		 291 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0290858  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2510  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  49.15 
 
 		 302 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.710977 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0143  polysaccharide deacetylase  50.17 
 
 		 310 aa  281  7.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.839924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1656  polysaccharide deacetylase  49.66 
 
 		 299 aa  281  8.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1981  polysaccharide deacetylase  48.39 
 
 		 283 aa  280  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2524  polysaccharide deacetylase  50.9 
 
 		 281 aa  276  2e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0713961  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2403  polysaccharide deacetylase  51.62 
 
 		 279 aa  276  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  50 
 
 		 280 aa  275  7e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0588  polysaccharide deacetylase  48.39 
 
 		 282 aa  274  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620562 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3114  polysaccharide deacetylase  48.38 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2360  polysaccharide deacetylase  48.44 
 
 		 293 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0684  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  45.86 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.934486 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3066  polysaccharide deacetylase  45.86 
 
 		 283 aa  261  8e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00688884  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4036  PEP-CTERM locus, polysaccharide deactylase  45.49 
 
 		 292 aa  258  6e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216969  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02597  Polysaccharide deacetylase  42.2 
 
 		 270 aa  250  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14174  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2331  polysaccharide deacetylase  45.14 
 
 		 293 aa  243  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1517  polysaccharide deacetylase  43.9 
 
 		 301 aa  238  5.999999999999999e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0751328  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1923  polysaccharide deacetylase  41.96 
 
 		 286 aa  235  5.0000000000000005e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2968  polysaccharide deacetylase  46.42 
 
 		 284 aa  224  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0835  polysaccharide deacetylase family protein  42.39 
 
 		 249 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2617  polysaccharide deacetylase  32.86 
 
 		 282 aa  171  9e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2587  polysaccharide deacetylase  32.63 
 
 		 284 aa  153  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784325  normal  0.845625 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  36.21 
 
 		 276 aa  145  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1685  polysaccharide deacetylase  35.62 
 
 		 273 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000637976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2210  polysaccharide deacetylase  35.07 
 
 		 283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3617  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 281 aa  137  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000367499  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2238  polysaccharide deacetylase  33.07 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0831  polysaccharide deacetylase  30.62 
 
 		 307 aa  92.8  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00177779  normal  0.177326 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1104  polysaccharide deacetylase  28.28 
 
 		 298 aa  90.9  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1730  polysaccharide deacetylase  32 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  34.02 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  38.6 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  38.6 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  36.84 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  38.6 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  38.6 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  36.84 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  36.84 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  36.5 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  37.84 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  40.91 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  31.45 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  46.51 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  37.72 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  36.47 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  41.98 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  40.59 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0234  polysaccharide deacetylase  31.97 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4179  polysaccharide deacetylase  41.67 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  36.67 
 
 		 430 aa  67  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  38.27 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  35.16 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  41.86 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  41.41 
 
 		 204 aa  67  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0628  polysaccharide deacetylase  38.61 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  31.68 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  31.68 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  36.36 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  35.42 
 
 		 413 aa  66.2  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  33.58 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  36.67 
 
 		 404 aa  65.9  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  33.58 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  41.03 
 
 		 352 aa  65.9  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  41.67 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  36.52 
 
 		 271 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0518  polysaccharide deacetylase  31.41 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  43.53 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  33.03 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  34.41 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  36.28 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1446  polysaccharide deacetylase  43.53 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.781341  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  35.35 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  31.68 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  38.55 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  31.68 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  31.68 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  36.27 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  34.41 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1576  polysaccharide deacetylase  46.15 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  28.1 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  35.48 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2167  polysaccharide deacetylase family protein  36.17 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000111858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>