More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1517 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1517  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 301 aa  610  9.999999999999999e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0751328  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0143  polysaccharide deacetylase  67.63 
 
 		 310 aa  393  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.839924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2510  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  65.47 
 
 		 302 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.710977 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0287  polysaccharide deacetylase  61.31 
 
 		 277 aa  349  3e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2524  polysaccharide deacetylase  58.3 
 
 		 281 aa  337  9.999999999999999e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0713961  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0588  polysaccharide deacetylase  59.93 
 
 		 282 aa  330  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620562 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2403  polysaccharide deacetylase  57.2 
 
 		 279 aa  321  7e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1981  polysaccharide deacetylase  56.25 
 
 		 283 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3276  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  56.25 
 
 		 279 aa  311  5.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231611  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2968  polysaccharide deacetylase  59.06 
 
 		 284 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0664  polysaccharide deacetylase  54.41 
 
 		 291 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0290858  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3114  polysaccharide deacetylase  55.15 
 
 		 305 aa  299  3e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1923  polysaccharide deacetylase  52.96 
 
 		 286 aa  299  5e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4036  PEP-CTERM locus, polysaccharide deactylase  52.71 
 
 		 292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216969  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2331  polysaccharide deacetylase  52.71 
 
 		 293 aa  277  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1172  polysaccharide deacetylase  46.91 
 
 		 281 aa  273  3e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2388  polysaccharide deacetylase  51.27 
 
 		 304 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1656  polysaccharide deacetylase  48.91 
 
 		 299 aa  258  6e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0139  FkbH  40.81 
 
 		 295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2217  polysaccharide deactylase family protein, PEP- CTERM locus subfamily  47.65 
 
 		 298 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.691781  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2470  polysaccharide deacetylase  47.48 
 
 		 301 aa  251  7e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2473  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  48.5 
 
 		 279 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2360  polysaccharide deacetylase  47.27 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1774  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  48.12 
 
 		 279 aa  249  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02597  Polysaccharide deacetylase  45.32 
 
 		 270 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14174  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3066  polysaccharide deacetylase  44.88 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00688884  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  48.12 
 
 		 280 aa  240  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0684  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  45.23 
 
 		 283 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.934486 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1980  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  43.9 
 
 		 293 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0835  polysaccharide deacetylase family protein  48.48 
 
 		 249 aa  199  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2587  polysaccharide deacetylase  37.22 
 
 		 284 aa  175  8e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784325  normal  0.845625 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2617  polysaccharide deacetylase  34.49 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2210  polysaccharide deacetylase  42.26 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  39.78 
 
 		 276 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1685  polysaccharide deacetylase  40.68 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000637976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3617  polysaccharide deacetylase  36.26 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000367499  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1104  polysaccharide deacetylase  27.93 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2238  polysaccharide deacetylase  28.46 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0831  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00177779  normal  0.177326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  38.41 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  39.82 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  39.82 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  39.82 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  44.95 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  39.82 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  38.94 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  38.94 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  38.05 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  35.46 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  35.46 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  38.94 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  40.66 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  35.4 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  34.82 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1730  polysaccharide deacetylase  27.69 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  36.05 
 
 		 542 aa  62.8  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  34.21 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  39.02 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  40.74 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0234  polysaccharide deacetylase  24.55 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  42.35 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  34.51 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  35.51 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.09 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  30.09 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  34.23 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3513  polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.206647  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  31.93 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  31.93 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1579  polysaccharide deacetylase  32.94 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0650  polysaccharide deacetylase  31.78 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  31.75 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  31.48 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  32.63 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  31.48 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  31.48 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  32.5 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  30.23 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  34.19 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  32.71 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  36.36 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  32.71 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  33.33 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  31.09 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1710  polysaccharide deacetylase  50 
 
 		 427 aa  55.8  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190308  normal  0.343412 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0672  polysaccharide deacetylase family protein  29.2 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.193798  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  35.45 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  32.35 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  33.78 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4179  polysaccharide deacetylase  32.63 
 
 		 266 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1037  polysaccharide deacetylase  37.93 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  35.45 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  28 
 
 		 232 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0928  polysaccharide deacetylase  32.24 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4793  putative polysaccharide deacetylase  48.94 
 
 		 393 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  32.71 
 
 		 272 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2765  polysaccharide deacetylase  30.83 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468013  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>