More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1104 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1104  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 298 aa  619  1e-176  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0831  polysaccharide deacetylase  65.66 
 
 		 307 aa  411  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00177779  normal  0.177326 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2360  polysaccharide deacetylase  33.56 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2470  polysaccharide deacetylase  32.29 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2217  polysaccharide deactylase family protein, PEP- CTERM locus subfamily  31.92 
 
 		 298 aa  113  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.691781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2473  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  29.41 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2524  polysaccharide deacetylase  29.33 
 
 		 281 aa  103  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0713961  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2388  polysaccharide deacetylase  30.95 
 
 		 304 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1774  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  28.47 
 
 		 279 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2510  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  30.95 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.710977 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  30.59 
 
 		 280 aa  99.8  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3066  polysaccharide deacetylase  28.33 
 
 		 283 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00688884  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3114  polysaccharide deacetylase  30.86 
 
 		 305 aa  97.4  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0139  FkbH  31.06 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0684  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  28.67 
 
 		 283 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.934486 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0143  polysaccharide deacetylase  28.67 
 
 		 310 aa  94.7  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.839924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1685  polysaccharide deacetylase  29.62 
 
 		 273 aa  92.4  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000637976  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.89 
 
 		 276 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1980  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.28 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1172  polysaccharide deacetylase  27.34 
 
 		 281 aa  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2403  polysaccharide deacetylase  27.53 
 
 		 279 aa  89.4  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3276  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  30.2 
 
 		 279 aa  89.4  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231611  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4036  PEP-CTERM locus, polysaccharide deactylase  28.03 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216969  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0287  polysaccharide deacetylase  28.23 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0835  polysaccharide deacetylase family protein  31.28 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1656  polysaccharide deacetylase  26.8 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1981  polysaccharide deacetylase  26.76 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1923  polysaccharide deacetylase  27.06 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0664  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0290858  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1517  polysaccharide deacetylase  27.93 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0751328  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0588  polysaccharide deacetylase  28.76 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620562 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2210  polysaccharide deacetylase  27.65 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2331  polysaccharide deacetylase  28.86 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02597  Polysaccharide deacetylase  29.74 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14174  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3617  polysaccharide deacetylase  34.16 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000367499  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2238  polysaccharide deacetylase  25.7 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  35.33 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2968  polysaccharide deacetylase  28.74 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1730  polysaccharide deacetylase  33.93 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.06 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  29.06 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  30.25 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  29.06 
 
 		 307 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  29.06 
 
 		 307 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  29.06 
 
 		 307 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  38.6 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  38.6 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  38.6 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  35.09 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  35.09 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  31.87 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0672  polysaccharide deacetylase family protein  29.41 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.193798  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  30.97 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  25.41 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0203  polysaccharide deacetylase  35.59 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.37611  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1728  polysaccharide deacetylase family protein  31.78 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000179283  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  38.6 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2587  polysaccharide deacetylase  24.63 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784325  normal  0.845625 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1456  polysaccharide deacetylase family protein  31.78 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0998463  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  36.61 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  35.65 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  33.91 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  36.61 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  36.61 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  37.72 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  30.06 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  31.01 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  31.87 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  32.17 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_002950  PG2145  polysaccharide deacetylase  40 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  31.54 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2675  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6095  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233371  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  27.68 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  31.43 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6465  polysaccharide deacetylase  33.02 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2617  polysaccharide deacetylase  25.16 
 
 		 282 aa  57  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2817  polysaccharide deacetylase  27.68 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  28.95 
 
 		 247 aa  57  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2215  putative transmembrane protein  35.11 
 
 		 288 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2151  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342073  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  23.95 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  33.62 
 
 		 279 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.932988 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2765  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468013  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  31.85 
 
 		 481 aa  56.6  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0428  hypothetical protein  29.82 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249302  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  32.04 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  32.26 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  30.28 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5979  polysaccharide deacetylase  35.11 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185285  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 		 1120 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  32.11 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  27.1 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  30.63 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  26.03 
 
 		 286 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  25.29 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>