More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6465 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6465  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
219 aa  452  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  35.52 
 
 
320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  34.85 
 
 
251 aa  118  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  34.03 
 
 
302 aa  116  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  34.22 
 
 
305 aa  112  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  34.43 
 
 
244 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  36.51 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  31.47 
 
 
241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  35.87 
 
 
244 aa  108  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  31.98 
 
 
220 aa  108  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  31.98 
 
 
241 aa  107  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 
204 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  32.02 
 
 
247 aa  107  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  30.96 
 
 
241 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 
221 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1081  polysaccharide deacetylase  35.68 
 
 
242 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1912  polysaccharide deacetylase  37.01 
 
 
232 aa  106  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  30.96 
 
 
213 aa  105  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  30.96 
 
 
213 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  30.96 
 
 
241 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  30.96 
 
 
213 aa  105  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  30.96 
 
 
213 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 
275 aa  105  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  34.21 
 
 
368 aa  105  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  32.99 
 
 
373 aa  105  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  32.63 
 
 
405 aa  105  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  30.96 
 
 
244 aa  105  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  35.05 
 
 
275 aa  104  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  30.96 
 
 
217 aa  104  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  34.07 
 
 
417 aa  104  9e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0650  polysaccharide deacetylase  40.65 
 
 
233 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  35.42 
 
 
275 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  34.54 
 
 
275 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  32.62 
 
 
372 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  36.22 
 
 
465 aa  103  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  34.54 
 
 
275 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  34.54 
 
 
275 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  34.54 
 
 
275 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  38.02 
 
 
204 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  39.74 
 
 
252 aa  102  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  32.75 
 
 
211 aa  102  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 
321 aa  102  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  34.02 
 
 
275 aa  102  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  38.18 
 
 
219 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 
404 aa  102  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  37.44 
 
 
273 aa  102  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  34.39 
 
 
352 aa  101  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  34.01 
 
 
479 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1037  polysaccharide deacetylase  41.4 
 
 
269 aa  100  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0742911 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  34.02 
 
 
275 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  33 
 
 
240 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1978  polysaccharide deacetylase  32.97 
 
 
229 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  38.61 
 
 
215 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  33.71 
 
 
256 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  34.87 
 
 
264 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 
258 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  30.05 
 
 
425 aa  99.8  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  33.69 
 
 
232 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  37.04 
 
 
212 aa  98.6  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  34.62 
 
 
267 aa  98.2  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 
387 aa  98.2  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 
276 aa  98.2  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  38.99 
 
 
299 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 
217 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6669  polysaccharide deacetylase  39.13 
 
 
240 aa  97.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.422259  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3931  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 
224 aa  97.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  32.97 
 
 
285 aa  97.1  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  35.35 
 
 
287 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  33.15 
 
 
259 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  37.58 
 
 
481 aa  96.7  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  38.82 
 
 
264 aa  96.7  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  37.74 
 
 
301 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  31.69 
 
 
503 aa  95.5  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  38.06 
 
 
235 aa  95.5  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1185  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 
236 aa  95.5  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  36.25 
 
 
250 aa  95.5  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  36.26 
 
 
468 aa  95.1  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1224  polysaccharide deacetylase  32.61 
 
 
392 aa  95.1  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.533397  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  32.62 
 
 
238 aa  94.7  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01375  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 
218 aa  94.4  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  29.73 
 
 
295 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 
242 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  29.7 
 
 
324 aa  93.6  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1834  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 
397 aa  93.6  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  33.54 
 
 
240 aa  93.2  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1515  polysaccharide deacetylase  32.56 
 
 
222 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.416831  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  29.59 
 
 
258 aa  92.8  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  29.28 
 
 
292 aa  92.8  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
479 aa  92.8  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5514  polysaccharide deacetylase  35.85 
 
 
252 aa  92.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.77719  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  35.67 
 
 
345 aa  92.4  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0152  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  28.51 
 
 
253 aa  92.4  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120528  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  30.16 
 
 
258 aa  92  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  27.84 
 
 
243 aa  92  6e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1185  polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 
409 aa  92  7e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  35.38 
 
 
1099 aa  91.7  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  28.36 
 
 
263 aa  91.7  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 
537 aa  91.7  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  37.25 
 
 
227 aa  91.7  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  32.97 
 
 
413 aa  91.3  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>