More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1456 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1456  polysaccharide deacetylase family protein  100 
 
 		 238 aa  484  1e-136  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0998463  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1728  polysaccharide deacetylase family protein  98.32 
 
 		 238 aa  477  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000179283  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  42 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  42 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  42 
 
 		 273 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  41.5 
 
 		 273 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  41.5 
 
 		 273 aa  142  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  41.5 
 
 		 273 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  41.5 
 
 		 273 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  41.5 
 
 		 273 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  37.38 
 
 		 372 aa  140  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3350  putative polysaccharide deacetylase  41.41 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  hitchhiker  0.00000000000000655968 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  40.91 
 
 		 273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  38.32 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  35.95 
 
 		 272 aa  135  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  39.8 
 
 		 273 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  39.9 
 
 		 273 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3126  polysaccharide deacetylase  37.81 
 
 		 276 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000165534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  39.25 
 
 		 275 aa  132  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0538  polysaccharide deacetylase  38.28 
 
 		 323 aa  131  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0863369  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2979  hypothetical protein  39.2 
 
 		 275 aa  129  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000165918  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2734  polysaccharide deacetylase  33.98 
 
 		 275 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000154127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2685  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  33.98 
 
 		 275 aa  129  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2944  polysaccharide deacetylase  33.98 
 
 		 275 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000517931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2943  polysaccharide deacetylase  33.98 
 
 		 275 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.02279e-62 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0950  polysaccharide deacetylase  35.15 
 
 		 331 aa  129  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.942837  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2661  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  39.7 
 
 		 275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000138252  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2948  polysaccharide deacetylase  39.2 
 
 		 275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000275955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2990  polysaccharide deacetylase  39.7 
 
 		 275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000426534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2699  polysaccharide deacetylase  38.78 
 
 		 274 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000565788  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2833  polysaccharide deacetylase  38.39 
 
 		 273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120678  hitchhiker  0.0000000454714 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2736  polysaccharide deacetylase  39.2 
 
 		 275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000182255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2294  polysaccharide deacetylase  38.69 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923024  unclonable  2.97243e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3747  polysaccharide deacetylase  34.65 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000014318  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4727  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 357 aa  125  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000111297  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5312  polysaccharide deacetylase, putative  36 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5051  polysaccharide deacetylase  36 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5292  putative polysaccharide deacetylase  36 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000730048 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5436  polysaccharide deacetylase  36 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4881  polysaccharide deacetylase  36 
 
 		 245 aa  123  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5368  putative polysaccharide deacetylase  36 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000675459  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4896  polysaccharide deacetylase  36 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.434213  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5636  putative polysaccharide deacetylase  35.11 
 
 		 245 aa  122  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000255185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5323  putative polysaccharide deacetylase  34.67 
 
 		 245 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  33.8 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  35.47 
 
 		 277 aa  115  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  33 
 
 		 368 aa  115  7.999999999999999e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4996  polysaccharide deacetylase  34.22 
 
 		 245 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  35.05 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  35.38 
 
 		 372 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  34.7 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 221 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  35.95 
 
 		 1119 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  36.57 
 
 		 1115 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  36.74 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  32.81 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  36.57 
 
 		 927 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  36.57 
 
 		 1115 aa  109  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  36.57 
 
 		 1115 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24870  predicted xylanase/chitin deacetylase  34.13 
 
 		 503 aa  108  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  33.99 
 
 		 373 aa  108  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3178  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  32.53 
 
 		 280 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  33.62 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  36.68 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 		 199 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1521  polysaccharide deacetylase family protein  31.49 
 
 		 332 aa  106  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0654867  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  34.58 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  36.11 
 
 		 1115 aa  105  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  35.12 
 
 		 872 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2070  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  35.35 
 
 		 280 aa  105  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1802  polysaccharide deacetylase family protein  31.22 
 
 		 332 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.12203  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  36.46 
 
 		 275 aa  104  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1863  polysaccharide deacetylase family protein  30.42 
 
 		 324 aa  105  9e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00543619  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  36.51 
 
 		 275 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  36.51 
 
 		 275 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  36.51 
 
 		 275 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  36.51 
 
 		 275 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  36.51 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  35.98 
 
 		 275 aa  102  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0152  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.82 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  36.51 
 
 		 275 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  34.92 
 
 		 275 aa  101  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  31.76 
 
 		 258 aa  102  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  31.08 
 
 		 382 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1582  polysaccharide deacetylase family protein  32.54 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00773707  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  32.66 
 
 		 279 aa  99.8  3e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  34.65 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  29.68 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  30.14 
 
 		 242 aa  99.8  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  35.98 
 
 		 276 aa  99.4  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2908  polysaccharide deacetylase  31.05 
 
 		 280 aa  99.8  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.850515  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  33.01 
 
 		 238 aa  99.4  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  33.99 
 
 		 417 aa  99  6e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1488  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 319 aa  99  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.373553  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0810  polysaccharide deacetylase family protein  29.52 
 
 		 305 aa  97.4  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00210366  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2674  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  29.36 
 
 		 250 aa  97.8  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0198792  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  30.9 
 
 		 244 aa  98.2  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3196  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase A  33.5 
 
 		 280 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.220844  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1185  polysaccharide deacetylase  28 
 
 		 409 aa  97.1  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>