More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2403 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2403  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 279 aa  583  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0664  polysaccharide deacetylase  72.53 
 
 		 291 aa  414  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0290858  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3276  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  66.3 
 
 		 279 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231611  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0143  polysaccharide deacetylase  66.18 
 
 		 310 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.839924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0287  polysaccharide deacetylase  65.69 
 
 		 277 aa  375  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2510  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  62.32 
 
 		 302 aa  367  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.710977 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2524  polysaccharide deacetylase  63.44 
 
 		 281 aa  364  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0713961  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1981  polysaccharide deacetylase  55.71 
 
 		 283 aa  323  1e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1517  polysaccharide deacetylase  57.2 
 
 		 301 aa  321  7e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0751328  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0588  polysaccharide deacetylase  54.81 
 
 		 282 aa  306  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620562 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3114  polysaccharide deacetylase  52.75 
 
 		 305 aa  295  5e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4036  PEP-CTERM locus, polysaccharide deactylase  51.09 
 
 		 292 aa  288  7e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216969  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1923  polysaccharide deacetylase  49.82 
 
 		 286 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1172  polysaccharide deacetylase  49.81 
 
 		 281 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2331  polysaccharide deacetylase  53.31 
 
 		 293 aa  278  9e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1980  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  51.62 
 
 		 293 aa  276  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2473  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  52.19 
 
 		 279 aa  276  4e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1774  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  51.82 
 
 		 279 aa  273  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2470  polysaccharide deacetylase  52.54 
 
 		 301 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2968  polysaccharide deacetylase  51.09 
 
 		 284 aa  262  4e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0139  FkbH  43.17 
 
 		 295 aa  261  8.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2388  polysaccharide deacetylase  49.82 
 
 		 304 aa  259  4e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1656  polysaccharide deacetylase  48 
 
 		 299 aa  259  4e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0684  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  46.59 
 
 		 283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.934486 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2217  polysaccharide deactylase family protein, PEP- CTERM locus subfamily  46.04 
 
 		 298 aa  253  3e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.691781  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02597  Polysaccharide deacetylase  47.17 
 
 		 270 aa  252  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14174  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3066  polysaccharide deacetylase  45.88 
 
 		 283 aa  247  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00688884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2360  polysaccharide deacetylase  48.89 
 
 		 293 aa  246  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  47.21 
 
 		 280 aa  239  5e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0835  polysaccharide deacetylase family protein  49.12 
 
 		 249 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2587  polysaccharide deacetylase  37.12 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784325  normal  0.845625 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2617  polysaccharide deacetylase  37.31 
 
 		 282 aa  169  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  38.32 
 
 		 276 aa  155  9e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3617  polysaccharide deacetylase  36.16 
 
 		 281 aa  145  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000367499  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2210  polysaccharide deacetylase  36.21 
 
 		 283 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1685  polysaccharide deacetylase  35.04 
 
 		 273 aa  139  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000637976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0831  polysaccharide deacetylase  29.25 
 
 		 307 aa  95.9  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00177779  normal  0.177326 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2238  polysaccharide deacetylase  29.23 
 
 		 289 aa  92.4  8e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1104  polysaccharide deacetylase  27.53 
 
 		 298 aa  89.4  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  43.75 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  37.31 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  39.83 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  39.83 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  39.83 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  43.53 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0234  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 		 255 aa  72  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  36.61 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  36.61 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  36.61 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  39.45 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  36 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  31.69 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1730  polysaccharide deacetylase  29.84 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  36.59 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  39.45 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  35.77 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0650  polysaccharide deacetylase  36.96 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  31.86 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  33.98 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  34.91 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  32.09 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  30.77 
 
 		 307 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  34.19 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.77 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1579  polysaccharide deacetylase  35.8 
 
 		 251 aa  62  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  36.79 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  35.96 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  35.8 
 
 		 542 aa  61.2  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  33.93 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  30.77 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  32.1 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  31.86 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  30.77 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  31.86 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  31.86 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  28.72 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  30.77 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  40 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  33.04 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  34.26 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  28.97 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0213  polysaccharide deacetylase  28.14 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.497622 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  32.94 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  30.09 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  32.67 
 
 		 1099 aa  58.9  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  38.55 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  28.32 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  28.32 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1550  polysaccharide deacetylase  34.65 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0260353  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0203  polysaccharide deacetylase  33.04 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.37611  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3513  polysaccharide deacetylase  27.09 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.206647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  34.57 
 
 		 927 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  42.17 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  36.78 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>