More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2968 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2968  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 284 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0143  polysaccharide deacetylase  59.21 
 
 		 310 aa  323  3e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.839924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1517  polysaccharide deacetylase  59.06 
 
 		 301 aa  322  3e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0751328  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2510  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  56.03 
 
 		 302 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.710977 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3114  polysaccharide deacetylase  56.57 
 
 		 305 aa  305  6e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1981  polysaccharide deacetylase  53.11 
 
 		 283 aa  293  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2524  polysaccharide deacetylase  52.55 
 
 		 281 aa  290  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0713961  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3276  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  53.45 
 
 		 279 aa  288  9e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231611  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0287  polysaccharide deacetylase  54.21 
 
 		 277 aa  287  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0588  polysaccharide deacetylase  53.11 
 
 		 282 aa  282  5.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620562 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2403  polysaccharide deacetylase  51.09 
 
 		 279 aa  275  9e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0664  polysaccharide deacetylase  51.09 
 
 		 291 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0290858  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2388  polysaccharide deacetylase  51.8 
 
 		 304 aa  267  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1172  polysaccharide deacetylase  48.38 
 
 		 281 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2473  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  50.36 
 
 		 279 aa  262  4e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1774  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  50.36 
 
 		 279 aa  261  8e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4036  PEP-CTERM locus, polysaccharide deactylase  50.36 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216969  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2331  polysaccharide deacetylase  50.91 
 
 		 293 aa  257  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1923  polysaccharide deacetylase  50 
 
 		 286 aa  255  5e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02597  Polysaccharide deacetylase  45.86 
 
 		 270 aa  251  7e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14174  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2217  polysaccharide deactylase family protein, PEP- CTERM locus subfamily  47.84 
 
 		 298 aa  247  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.691781  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0139  FkbH  43.8 
 
 		 295 aa  246  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2470  polysaccharide deacetylase  49.28 
 
 		 301 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1980  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  46.42 
 
 		 293 aa  242  6e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1656  polysaccharide deacetylase  47.18 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  48.18 
 
 		 280 aa  239  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2360  polysaccharide deacetylase  44.96 
 
 		 293 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0684  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  44.77 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.934486 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3066  polysaccharide deacetylase  45.13 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00688884  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0835  polysaccharide deacetylase family protein  46.26 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2587  polysaccharide deacetylase  36.3 
 
 		 284 aa  163  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784325  normal  0.845625 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2617  polysaccharide deacetylase  33.92 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1685  polysaccharide deacetylase  41.6 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000637976  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  38.79 
 
 		 276 aa  150  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2210  polysaccharide deacetylase  39.33 
 
 		 283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3617  polysaccharide deacetylase  37.23 
 
 		 281 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000367499  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2238  polysaccharide deacetylase  29.91 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1104  polysaccharide deacetylase  29.5 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  42.54 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0831  polysaccharide deacetylase  26.9 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00177779  normal  0.177326 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  40.18 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  40.18 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  39.29 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1730  polysaccharide deacetylase  29.11 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1313  polysaccharide deacetylase  29.29 
 
 		 330 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1349  polysaccharide deacetylase  29.29 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.723796 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1330  polysaccharide deacetylase  29.29 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  38.85 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  38.85 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  39.81 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  38.39 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  38.39 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  38.39 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  41.86 
 
 		 542 aa  66.2  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  49.41 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  42.86 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  36.11 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0213  polysaccharide deacetylase  31.12 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.497622 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  34.96 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  29.2 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  39.33 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1550  polysaccharide deacetylase  43.53 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0260353  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0628  polysaccharide deacetylase  45.35 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  35.71 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  40 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  36.96 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  36.11 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4011  polysaccharide deacetylase  43.21 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0234  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  33.98 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  32.64 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0646  polysaccharide deacetylase  43.53 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  40.74 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1784  hypothetical protein  27.21 
 
 		 264 aa  57  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3513  polysaccharide deacetylase  32.64 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.206647  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  34.78 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5514  polysaccharide deacetylase  39.78 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.77719  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  33.72 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0518  polysaccharide deacetylase  29.24 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  34.67 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  44 
 
 		 321 aa  55.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4179  polysaccharide deacetylase  33.94 
 
 		 266 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  34.09 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2978  polysaccharide deacetylase  38.71 
 
 		 205 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000961865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1548  polysaccharide deacetylase  46.58 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.402351  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3360  polysaccharide deacetylase  40.7 
 
 		 202 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0110446 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1579  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  34.58 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  38.82 
 
 		 217 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 387 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  27.16 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  34.58 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0650  polysaccharide deacetylase  36.25 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  31.37 
 
 		 232 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1037  polysaccharide deacetylase  42.39 
 
 		 269 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742911 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  30.46 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  38.67 
 
 		 242 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>