More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2210 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2210  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 283 aa  569  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  57.25 
 
 		 276 aa  300  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1685  polysaccharide deacetylase  50.75 
 
 		 273 aa  270  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000637976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3617  polysaccharide deacetylase  49.26 
 
 		 281 aa  249  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000367499  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2388  polysaccharide deacetylase  40.21 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1656  polysaccharide deacetylase  38.49 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0139  FkbH  36.75 
 
 		 295 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0684  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  37.86 
 
 		 283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.934486 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2360  polysaccharide deacetylase  38.18 
 
 		 293 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4036  PEP-CTERM locus, polysaccharide deactylase  37.23 
 
 		 292 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216969  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1774  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  37.97 
 
 		 279 aa  162  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0143  polysaccharide deacetylase  39.56 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.839924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3066  polysaccharide deacetylase  36.79 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00688884  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  37.73 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2473  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  36.94 
 
 		 279 aa  160  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2470  polysaccharide deacetylase  36.14 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1517  polysaccharide deacetylase  42.26 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0751328  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2217  polysaccharide deactylase family protein, PEP- CTERM locus subfamily  37.77 
 
 		 298 aa  155  7e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.691781  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2510  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  37.41 
 
 		 302 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.710977 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1172  polysaccharide deacetylase  36.09 
 
 		 281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1923  polysaccharide deacetylase  37.96 
 
 		 286 aa  152  8e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3114  polysaccharide deacetylase  37.86 
 
 		 305 aa  149  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0835  polysaccharide deacetylase family protein  37.89 
 
 		 249 aa  148  9e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0588  polysaccharide deacetylase  42.74 
 
 		 282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620562 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0287  polysaccharide deacetylase  39.32 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1981  polysaccharide deacetylase  38.75 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2403  polysaccharide deacetylase  36.21 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2524  polysaccharide deacetylase  35.83 
 
 		 281 aa  142  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0713961  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3276  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  33.33 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231611  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1980  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  35.07 
 
 		 293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2331  polysaccharide deacetylase  38.24 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2968  polysaccharide deacetylase  39.33 
 
 		 284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0664  polysaccharide deacetylase  35.15 
 
 		 291 aa  129  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0290858  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2617  polysaccharide deacetylase  33.71 
 
 		 282 aa  125  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2587  polysaccharide deacetylase  32.71 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784325  normal  0.845625 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02597  Polysaccharide deacetylase  34.87 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14174  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2238  polysaccharide deacetylase  31 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  32.83 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  39.13 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0831  polysaccharide deacetylase  28.29 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00177779  normal  0.177326 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1104  polysaccharide deacetylase  27.65 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  44.95 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  39.13 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  33.75 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  44.95 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  44.95 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  38.94 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  38.94 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  38.94 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  35.78 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  35.78 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  43.82 
 
 		 503 aa  76.6  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  35.78 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  35.78 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  35.78 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  37.61 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  34.07 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  30.63 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  39.09 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  31.69 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  36.61 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  35.4 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0203  polysaccharide deacetylase  44.86 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.37611  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1730  polysaccharide deacetylase  31.13 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  35.78 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  35.78 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  39.45 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0234  polysaccharide deacetylase  27.88 
 
 		 255 aa  72  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  39.45 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  36.17 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  37.61 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  37.08 
 
 		 440 aa  70.9  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08606  hypothetical polysaccharide deacetylase (Eurofung)  40.18 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.940784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  38.46 
 
 		 542 aa  70.1  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  35.46 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  38.53 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  32.64 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.98 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  34.27 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  38.95 
 
 		 522 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  31.63 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3879  polysaccharide deacetylase  42.68 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  34.29 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  35.4 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.932988 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  36.73 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0030  polysaccharide deacetylase  35.78 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  36.22 
 
 		 277 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  34.52 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 		 275 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  37.5 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>