More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2360 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2360  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 293 aa  607  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2470  polysaccharide deacetylase  67.52 
 
 		 301 aa  393  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2217  polysaccharide deactylase family protein, PEP- CTERM locus subfamily  60.07 
 
 		 298 aa  370  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.691781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2473  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  60.22 
 
 		 279 aa  367  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1774  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  60.57 
 
 		 279 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0684  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  56.88 
 
 		 283 aa  340  2e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.934486 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3066  polysaccharide deacetylase  56.88 
 
 		 283 aa  339  4e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00688884  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2388  polysaccharide deacetylase  57.45 
 
 		 304 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1656  polysaccharide deacetylase  53.1 
 
 		 299 aa  299  4e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0139  FkbH  50.36 
 
 		 295 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0143  polysaccharide deacetylase  51.45 
 
 		 310 aa  276  4e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.839924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3114  polysaccharide deacetylase  49.65 
 
 		 305 aa  271  6e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1980  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  48.44 
 
 		 293 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0835  polysaccharide deacetylase family protein  58.3 
 
 		 249 aa  265  7e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  48.42 
 
 		 280 aa  261  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2524  polysaccharide deacetylase  46.84 
 
 		 281 aa  258  1e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0713961  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0287  polysaccharide deacetylase  46.21 
 
 		 277 aa  257  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0588  polysaccharide deacetylase  48 
 
 		 282 aa  256  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620562 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1172  polysaccharide deacetylase  46.62 
 
 		 281 aa  255  5e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1981  polysaccharide deacetylase  46.38 
 
 		 283 aa  254  8e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2510  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  47.83 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.710977 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1517  polysaccharide deacetylase  47.27 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0751328  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3276  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  45.82 
 
 		 279 aa  249  4e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231611  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2403  polysaccharide deacetylase  48.89 
 
 		 279 aa  246  4e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4036  PEP-CTERM locus, polysaccharide deactylase  44.32 
 
 		 292 aa  243  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216969  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02597  Polysaccharide deacetylase  46.72 
 
 		 270 aa  240  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14174  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0664  polysaccharide deacetylase  46.01 
 
 		 291 aa  239  5e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0290858  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1923  polysaccharide deacetylase  42.86 
 
 		 286 aa  230  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2331  polysaccharide deacetylase  43.31 
 
 		 293 aa  229  5e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2968  polysaccharide deacetylase  44.96 
 
 		 284 aa  218  7e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2617  polysaccharide deacetylase  37.78 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3617  polysaccharide deacetylase  37.68 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000367499  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  38.6 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1685  polysaccharide deacetylase  36.1 
 
 		 273 aa  166  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000637976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2210  polysaccharide deacetylase  38.18 
 
 		 283 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2587  polysaccharide deacetylase  35.77 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784325  normal  0.845625 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1104  polysaccharide deacetylase  33.56 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0831  polysaccharide deacetylase  31.15 
 
 		 307 aa  119  7e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00177779  normal  0.177326 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2238  polysaccharide deacetylase  30.37 
 
 		 289 aa  95.9  7e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  45.45 
 
 		 299 aa  92.4  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  36.88 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  36.88 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  36.88 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  43.36 
 
 		 264 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  42.48 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  42.48 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  40.77 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  42.48 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  33.81 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  39.81 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  34.29 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  40.95 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  38.89 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  37.38 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  27.33 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  37.61 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1730  polysaccharide deacetylase  28.26 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  36.7 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  38.33 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0203  polysaccharide deacetylase  38.14 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.37611  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1550  polysaccharide deacetylase  40.62 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0260353  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  43.33 
 
 		 235 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  35.51 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  34.78 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4179  polysaccharide deacetylase  43.42 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5514  polysaccharide deacetylase  38.64 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.77719  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0650  polysaccharide deacetylase  41.49 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0234  polysaccharide deacetylase  28.03 
 
 		 255 aa  68.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1349  polysaccharide deacetylase  28.75 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.723796 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  32.41 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1330  polysaccharide deacetylase  28.75 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  37.97 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  31.47 
 
 		 481 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  34.86 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  34.86 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1313  polysaccharide deacetylase  27.95 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  28.66 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2167  polysaccharide deacetylase family protein  39.09 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000111858  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  40.74 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  35.78 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  36.94 
 
 		 277 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  36.7 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6669  polysaccharide deacetylase  38.95 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.422259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  36.59 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  34.86 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  34.86 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0646  polysaccharide deacetylase  31.18 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  34.86 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1557  acetylxylan esterase  38.37 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.956674  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1497  polysaccharide deacetylase  38.37 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.507826  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  37.61 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  38.37 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  38.61 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  38.37 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1037  polysaccharide deacetylase  40.23 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742911 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  40.48 
 
 		 479 aa  65.5  0.0000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1878  polysaccharide deacetylase family protein  36.7 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117322  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  34 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>