More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1172 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1172  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 281 aa  588  1e-167  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02597  Polysaccharide deacetylase  57.04 
 
 		 270 aa  320  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14174  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3114  polysaccharide deacetylase  52.55 
 
 		 305 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3276  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  51.67 
 
 		 279 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231611  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0664  polysaccharide deacetylase  51.09 
 
 		 291 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0290858  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0143  polysaccharide deacetylase  51.47 
 
 		 310 aa  299  3e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.839924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1981  polysaccharide deacetylase  51.45 
 
 		 283 aa  297  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2524  polysaccharide deacetylase  48.89 
 
 		 281 aa  293  2e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0713961  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0287  polysaccharide deacetylase  50.18 
 
 		 277 aa  292  4e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1980  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  47.22 
 
 		 293 aa  285  5e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2403  polysaccharide deacetylase  49.81 
 
 		 279 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2510  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  49.08 
 
 		 302 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.710977 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0139  FkbH  49.82 
 
 		 295 aa  282  5.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2331  polysaccharide deacetylase  51.62 
 
 		 293 aa  281  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0588  polysaccharide deacetylase  48.72 
 
 		 282 aa  280  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620562 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4036  PEP-CTERM locus, polysaccharide deactylase  46.98 
 
 		 292 aa  279  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216969  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2470  polysaccharide deacetylase  50.72 
 
 		 301 aa  279  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1517  polysaccharide deacetylase  46.91 
 
 		 301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0751328  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1656  polysaccharide deacetylase  47.48 
 
 		 299 aa  265  8e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2388  polysaccharide deacetylase  48.35 
 
 		 304 aa  262  6e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1923  polysaccharide deacetylase  48.11 
 
 		 286 aa  261  6.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2360  polysaccharide deacetylase  46.62 
 
 		 293 aa  255  5e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0684  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  46.4 
 
 		 283 aa  255  6e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.934486 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2473  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  48.03 
 
 		 279 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1774  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  48.03 
 
 		 279 aa  252  6e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3066  polysaccharide deacetylase  45.45 
 
 		 283 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00688884  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2968  polysaccharide deacetylase  48.38 
 
 		 284 aa  249  4e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2217  polysaccharide deactylase family protein, PEP- CTERM locus subfamily  46.07 
 
 		 298 aa  248  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.691781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  45.22 
 
 		 280 aa  246  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2617  polysaccharide deacetylase  39.03 
 
 		 282 aa  196  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0835  polysaccharide deacetylase family protein  45.09 
 
 		 249 aa  192  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2587  polysaccharide deacetylase  37.59 
 
 		 284 aa  183  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784325  normal  0.845625 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  35.11 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2210  polysaccharide deacetylase  36.09 
 
 		 283 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3617  polysaccharide deacetylase  33.95 
 
 		 281 aa  143  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000367499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1685  polysaccharide deacetylase  36.02 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000637976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0831  polysaccharide deacetylase  27.43 
 
 		 307 aa  92.8  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00177779  normal  0.177326 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1104  polysaccharide deacetylase  27.34 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  39.13 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  36.96 
 
 		 264 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1730  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2238  polysaccharide deacetylase  25.19 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  32.43 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  30.51 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  37.25 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  36.61 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  30.82 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  30.6 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  41.94 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  41.67 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  28.67 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  27.87 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  36.36 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  32.77 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0234  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  31.62 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  36.36 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  34.52 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  33.1 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1834  polysaccharide deacetylase  53.7 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  31.47 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  29.23 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  35.85 
 
 		 307 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  39.29 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  35.85 
 
 		 307 aa  65.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  32.73 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1224  polysaccharide deacetylase  55.77 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.533397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  31.43 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  34.69 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  31.37 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  30.68 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  33.72 
 
 		 542 aa  63.2  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  33.96 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  27.7 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  34.91 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  34.91 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  34.91 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  37.96 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  35.19 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0628  polysaccharide deacetylase  34.88 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  36.04 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08606  hypothetical polysaccharide deacetylase (Eurofung)  36.11 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.940784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  32.43 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  37.65 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  39.29 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4727  polysaccharide deacetylase  35 
 
 		 357 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000111297  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  29.35 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1353  polysaccharide deacetylase  34.86 
 
 		 341 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>