48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0213 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0213  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 218 aa  452  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.497622 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0234  polysaccharide deacetylase  45.23 
 
 		 255 aa  172  2.9999999999999996e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1784  hypothetical protein  42.45 
 
 		 264 aa  156  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2238  polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 		 289 aa  82  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2510  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  29.13 
 
 		 302 aa  65.5  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.710977 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0287  polysaccharide deacetylase  26.38 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4036  PEP-CTERM locus, polysaccharide deactylase  30.09 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216969  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  30.47 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1656  polysaccharide deacetylase  27.57 
 
 		 299 aa  62  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3276  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  29.26 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231611  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1980  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.57 
 
 		 293 aa  61.6  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2403  polysaccharide deacetylase  28.14 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1923  polysaccharide deacetylase  31.38 
 
 		 286 aa  58.5  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0143  polysaccharide deacetylase  30.48 
 
 		 310 aa  58.5  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.839924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2388  polysaccharide deacetylase  27.76 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0664  polysaccharide deacetylase  30.26 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0290858  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02597  Polysaccharide deacetylase  29.53 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14174  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2524  polysaccharide deacetylase  29.46 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0713961  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2331  polysaccharide deacetylase  30.53 
 
 		 293 aa  55.1  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1730  polysaccharide deacetylase  25.12 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3066  polysaccharide deacetylase  29.88 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00688884  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1172  polysaccharide deacetylase  27.37 
 
 		 281 aa  53.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0684  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  28.15 
 
 		 283 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.934486 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2470  polysaccharide deacetylase  25.1 
 
 		 301 aa  52.4  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1517  polysaccharide deacetylase  28.11 
 
 		 301 aa  52.4  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0751328  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0835  polysaccharide deacetylase family protein  29.78 
 
 		 249 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0139  FkbH  26.32 
 
 		 295 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2968  polysaccharide deacetylase  31.12 
 
 		 284 aa  48.9  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2473  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  25.54 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0588  polysaccharide deacetylase  26.74 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620562 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1774  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  25.11 
 
 		 279 aa  47.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3114  polysaccharide deacetylase  27.15 
 
 		 305 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4674  polysaccharide deacetylase  34.48 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1981  polysaccharide deacetylase  24.86 
 
 		 283 aa  45.1  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1685  polysaccharide deacetylase  29.05 
 
 		 273 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000637976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  30.83 
 
 		 308 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2360  polysaccharide deacetylase  23.97 
 
 		 293 aa  43.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1116  hypothetical protein  25.65 
 
 		 349 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  30 
 
 		 308 aa  42  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  31 
 
 		 295 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1832  hypothetical protein  31.11 
 
 		 280 aa  42  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  31 
 
 		 295 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 309 aa  42  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  31 
 
 		 295 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  30 
 
 		 308 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  29.46 
 
 		 308 aa  42  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  30 
 
 		 308 aa  42  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.24 
 
 		 276 aa  41.6  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>