More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2331 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2331  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 293 aa  592  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4036  PEP-CTERM locus, polysaccharide deactylase  68.57 
 
 		 292 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216969  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1923  polysaccharide deacetylase  65.85 
 
 		 286 aa  392  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1981  polysaccharide deacetylase  56.25 
 
 		 283 aa  330  2e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3276  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  57.82 
 
 		 279 aa  325  4.0000000000000003e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231611  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0143  polysaccharide deacetylase  56.58 
 
 		 310 aa  317  2e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.839924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2524  polysaccharide deacetylase  54.78 
 
 		 281 aa  312  3.9999999999999997e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0713961  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0287  polysaccharide deacetylase  55.19 
 
 		 277 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3114  polysaccharide deacetylase  53.36 
 
 		 305 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2510  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  54.09 
 
 		 302 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.710977 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0664  polysaccharide deacetylase  54.78 
 
 		 291 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0290858  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1172  polysaccharide deacetylase  51.62 
 
 		 281 aa  300  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1517  polysaccharide deacetylase  52.71 
 
 		 301 aa  296  4e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0751328  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2403  polysaccharide deacetylase  53.31 
 
 		 279 aa  292  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0588  polysaccharide deacetylase  50.9 
 
 		 282 aa  279  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620562 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1656  polysaccharide deacetylase  46.64 
 
 		 299 aa  270  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2470  polysaccharide deacetylase  46.38 
 
 		 301 aa  261  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2217  polysaccharide deactylase family protein, PEP- CTERM locus subfamily  45.08 
 
 		 298 aa  260  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.691781  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0139  FkbH  42.96 
 
 		 295 aa  260  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1980  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  45.14 
 
 		 293 aa  258  6e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1774  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  47.83 
 
 		 279 aa  258  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2473  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  47.1 
 
 		 279 aa  255  6e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2968  polysaccharide deacetylase  50.91 
 
 		 284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02597  Polysaccharide deacetylase  46.77 
 
 		 270 aa  250  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14174  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  46.57 
 
 		 280 aa  250  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3066  polysaccharide deacetylase  47.27 
 
 		 283 aa  249  3e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00688884  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2388  polysaccharide deacetylase  44.06 
 
 		 304 aa  248  8e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0684  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  46.55 
 
 		 283 aa  245  6e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.934486 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2360  polysaccharide deacetylase  43.31 
 
 		 293 aa  242  7e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0835  polysaccharide deacetylase family protein  45.5 
 
 		 249 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  38.77 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2587  polysaccharide deacetylase  34.83 
 
 		 284 aa  168  8e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784325  normal  0.845625 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2617  polysaccharide deacetylase  32.96 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3617  polysaccharide deacetylase  34.89 
 
 		 281 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000367499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1685  polysaccharide deacetylase  34.07 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000637976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2210  polysaccharide deacetylase  38.24 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2238  polysaccharide deacetylase  33.46 
 
 		 289 aa  90.5  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1104  polysaccharide deacetylase  28.06 
 
 		 298 aa  89.4  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0831  polysaccharide deacetylase  27.56 
 
 		 307 aa  89.4  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00177779  normal  0.177326 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  36.69 
 
 		 264 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  37.41 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1730  polysaccharide deacetylase  29.38 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  33.57 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  33.57 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  31.33 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  35.4 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  35.4 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  35.4 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  32.86 
 
 		 295 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  35 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  38.89 
 
 		 542 aa  74.7  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  37.04 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  36.59 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  38.32 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  29.89 
 
 		 1120 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  31.43 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1948  polysaccharide deacetylase  32.26 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000715916  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  30.95 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2675  polysaccharide deacetylase  38.66 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  41.49 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  43.21 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  33.64 
 
 		 378 aa  67  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  29.77 
 
 		 372 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  34.51 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  35.06 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  36.11 
 
 		 302 aa  67  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  32.41 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  35.37 
 
 		 238 aa  67  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  33.93 
 
 		 372 aa  67  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0628  polysaccharide deacetylase  45.95 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  28.66 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  37.04 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  32.74 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  34.48 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  31.97 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  36.17 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  28.66 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4179  polysaccharide deacetylase  36.13 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  37.5 
 
 		 373 aa  65.9  0.0000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  30.57 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  38.54 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1037  polysaccharide deacetylase  41.38 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742911 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  32.74 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  30.57 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  40.54 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  30.57 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07960  polysaccharide deacetylase  32.71 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  39.08 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  34.92 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  26.37 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  29.58 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0983  xylanase/chitin deacetylase-like  30.94 
 
 		 830 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4391  polysaccharide deacetylase  29.01 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.424954 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39050  predicted xylanase/chitin deacetylase  29.56 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  30.97 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  30.97 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  32.64 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0646  polysaccharide deacetylase  40 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1219  polysaccharide deacetylase  35.37 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000011337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>