More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0999 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 294 aa  607  1e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  83.79 
 
 		 293 aa  523  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  81.03 
 
 		 293 aa  507  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  80.69 
 
 		 293 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  78.97 
 
 		 293 aa  494  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  78.97 
 
 		 293 aa  494  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  78.62 
 
 		 293 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  79.31 
 
 		 291 aa  493  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2033  polysaccharide deacetylase  78.62 
 
 		 300 aa  485  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0672  polysaccharide deacetylase family protein  75.52 
 
 		 293 aa  473  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.193798  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  73.04 
 
 		 294 aa  465  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39050  predicted xylanase/chitin deacetylase  74.14 
 
 		 295 aa  462  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  70.89 
 
 		 319 aa  458  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4391  polysaccharide deacetylase  69.66 
 
 		 296 aa  451  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.424954 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2229  polysaccharide deacetylase  68.6 
 
 		 296 aa  442  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22830  predicted xylanase/chitin deacetylase  70.45 
 
 		 295 aa  437  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3485  polysaccharide deacetylase  65.52 
 
 		 300 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1415  putative polysaccharide deacetylase  65.17 
 
 		 300 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  67.29 
 
 		 378 aa  396  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06518  polysaccharide deacetylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G05030)  58.02 
 
 		 295 aa  362  3e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0030  polysaccharide deacetylase  45.74 
 
 		 299 aa  280  3e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08606  hypothetical polysaccharide deacetylase (Eurofung)  42.19 
 
 		 303 aa  247  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.940784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  37.23 
 
 		 271 aa  202  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  36.91 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  36.91 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  36.91 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  36.91 
 
 		 307 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  36.91 
 
 		 307 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  38.71 
 
 		 277 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  37.93 
 
 		 299 aa  189  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  35.76 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  37.63 
 
 		 279 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.932988 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0928  polysaccharide deacetylase  36.55 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  33.45 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  32.64 
 
 		 289 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  32.64 
 
 		 289 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  32.64 
 
 		 289 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  31.91 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  30.96 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  30.96 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  30.96 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  31.3 
 
 		 315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  30.12 
 
 		 296 aa  129  7.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  31.71 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  30.58 
 
 		 299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  30.38 
 
 		 281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  29.48 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  28.93 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  27.86 
 
 		 273 aa  108  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  29.34 
 
 		 290 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  27.53 
 
 		 306 aa  108  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  29.68 
 
 		 292 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  26.81 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  30.57 
 
 		 298 aa  102  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  25.76 
 
 		 336 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  27.89 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2100  hypothetical protein  30.88 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1477  polysaccharide deacetylase  26.61 
 
 		 298 aa  93.6  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1393  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 336 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1353  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 341 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0456  polysaccharide deacetylase  26.34 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0475  polysaccharide deacetylase  26.34 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1446  polysaccharide deacetylase  28.06 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0986  twin-arginine translocation pathway signal  28.17 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.649552  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  20.65 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1468  polysaccharide deacetylase  28.17 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1607  hypothetical protein  23.63 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4092  polysaccharide deacetylase  24.28 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  hitchhiker  0.00263168 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1389  hypothetical protein  23.63 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  27.41 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0429  polysaccharide deacetylase  26.64 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4151  polysaccharide deacetylase family protein  26.34 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  24.11 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1685  polysaccharide deacetylase  31.31 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000637976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  26.56 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3692  polysaccharide deacetylase  26.34 
 
 		 334 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0499  putative polysaccharide deacetylase family protein  27.39 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3513  polysaccharide deacetylase  25.58 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.206647  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  34.86 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2422  polysaccharide deacetylase  26.69 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2094  polysaccharide deacetylase  33.02 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3554  hypothetical protein  24.91 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0934  polysaccharide deacetylase  26.64 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1100  urate catabolism protein  25.87 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 280 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1053  hypothetical protein  25.74 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1111  polysaccharide deacetylase  26.42 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  27.03 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  26.07 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1163  chitin deacetylase  27.38 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.425036  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  26.24 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0836  urate catabolism protein  27.63 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.391521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4036  PEP-CTERM locus, polysaccharide deactylase  33.64 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216969  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0355  polysaccharide deacetylase  26.45 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.0556603 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  27.09 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5147  polysaccharide deacetylase  24.54 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153837  normal  0.472101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  27.09 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  26.29 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2605  polysaccharide deacetylase family protein  25.1 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>