More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3555 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 306 aa  630  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  54.08 
 
 		 296 aa  330  2e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  38.78 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  34.43 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  34.43 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  34.43 
 
 		 295 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  37.9 
 
 		 264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 288 aa  143  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  32.85 
 
 		 299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  34.8 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  34.8 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  34.8 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  32.04 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  32.33 
 
 		 273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  34.32 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  30.63 
 
 		 315 aa  133  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  32.35 
 
 		 302 aa  134  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  30.74 
 
 		 294 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  31.62 
 
 		 307 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  31.62 
 
 		 307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  31.62 
 
 		 307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  31.62 
 
 		 307 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  31.75 
 
 		 299 aa  125  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  31.25 
 
 		 307 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0928  polysaccharide deacetylase  34.54 
 
 		 296 aa  122  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4391  polysaccharide deacetylase  31.48 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.424954 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  29.92 
 
 		 292 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  30.66 
 
 		 290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  29.43 
 
 		 282 aa  119  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  28.31 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2229  polysaccharide deacetylase  27.82 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  31.06 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  30.22 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0672  polysaccharide deacetylase family protein  28.08 
 
 		 293 aa  116  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.193798  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  29 
 
 		 298 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  28.03 
 
 		 281 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2033  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  27.68 
 
 		 293 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  26.89 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  26.54 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  30.33 
 
 		 294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  26.86 
 
 		 293 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  27.53 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2100  hypothetical protein  31.56 
 
 		 297 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  29.26 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0203  polysaccharide deacetylase  29.59 
 
 		 292 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.37611  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.932988 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06518  polysaccharide deacetylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G05030)  26.97 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0030  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 299 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22830  predicted xylanase/chitin deacetylase  28.23 
 
 		 295 aa  102  6e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  26.34 
 
 		 293 aa  102  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3485  polysaccharide deacetylase  26.42 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  27.39 
 
 		 378 aa  102  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  26.32 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1415  putative polysaccharide deacetylase  26.04 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  26.42 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39050  predicted xylanase/chitin deacetylase  28.34 
 
 		 295 aa  96.3  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  25.86 
 
 		 290 aa  94  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3513  polysaccharide deacetylase  28.06 
 
 		 294 aa  92.8  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.206647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0499  putative polysaccharide deacetylase family protein  29.49 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262777 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08606  hypothetical polysaccharide deacetylase (Eurofung)  26.03 
 
 		 303 aa  87  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.940784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2094  polysaccharide deacetylase  27.44 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6462  polysaccharide deacetylase  25.98 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6169  polysaccharide deacetylase  26.13 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2470  polysaccharide deacetylase  34.65 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1607  hypothetical protein  26.99 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  25.73 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  25.83 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  24.1 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  26.16 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  26.49 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3692  polysaccharide deacetylase  25.47 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  27.85 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1389  hypothetical protein  25.11 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1446  polysaccharide deacetylase  26.89 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180277  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  25.41 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  25.74 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  25.83 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  30.56 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1111  polysaccharide deacetylase  28.04 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  25.32 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3927  urate catabolism protein  27.73 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0684  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  26.86 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.934486 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  25.32 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1477  polysaccharide deacetylase  25.85 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  26.76 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4151  polysaccharide deacetylase family protein  25 
 
 		 334 aa  67  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  28.3 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2360  polysaccharide deacetylase  36.7 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0986  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.649552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1468  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6198  urate catabolism protein  28.03 
 
 		 318 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1881  polysaccharide deacetylase family protein  31.54 
 
 		 362 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1774  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  30.23 
 
 		 279 aa  67  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1393  polysaccharide deacetylase  29.75 
 
 		 336 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0456  polysaccharide deacetylase  24.06 
 
 		 330 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1702  polysaccharide deacetylase family protein  30.6 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0954  polysaccharide deacetylase family protein  30.6 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>