More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0928 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0928  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 296 aa  608  1e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  67.92 
 
 		 299 aa  419  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  45.91 
 
 		 287 aa  252  6e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  46.13 
 
 		 271 aa  229  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  44.81 
 
 		 279 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.932988 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  46.15 
 
 		 277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  41.33 
 
 		 307 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  41.33 
 
 		 307 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  41.33 
 
 		 307 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  41.33 
 
 		 307 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  40.96 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2229  polysaccharide deacetylase  38.83 
 
 		 296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  38.28 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  38.28 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1415  putative polysaccharide deacetylase  37.02 
 
 		 300 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3485  polysaccharide deacetylase  36.33 
 
 		 300 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  37.23 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  37.28 
 
 		 291 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39050  predicted xylanase/chitin deacetylase  37.63 
 
 		 295 aa  186  6e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  36.69 
 
 		 319 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  38.38 
 
 		 293 aa  182  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  38.38 
 
 		 293 aa  182  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  38.01 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  36.55 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2033  polysaccharide deacetylase  35.52 
 
 		 300 aa  177  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0672  polysaccharide deacetylase family protein  36.67 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.193798  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22830  predicted xylanase/chitin deacetylase  34.36 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4391  polysaccharide deacetylase  34.62 
 
 		 296 aa  176  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.424954 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  39.05 
 
 		 321 aa  176  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  37.28 
 
 		 315 aa  169  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  38.63 
 
 		 295 aa  168  8e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  38.63 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  38.63 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  35.19 
 
 		 378 aa  166  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0030  polysaccharide deacetylase  33.22 
 
 		 299 aa  162  8.000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  37.91 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  40.39 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  38.18 
 
 		 289 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  38.18 
 
 		 289 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  38.18 
 
 		 289 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06518  polysaccharide deacetylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G05030)  33.92 
 
 		 295 aa  157  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  37.2 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08606  hypothetical polysaccharide deacetylase (Eurofung)  33.33 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.940784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  39.38 
 
 		 263 aa  152  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  33.95 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  32.71 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  34.54 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  33.6 
 
 		 273 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  32.01 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  31.21 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  31.67 
 
 		 290 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  31.69 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  29.88 
 
 		 336 aa  113  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  30.97 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  27.5 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  29.58 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3513  polysaccharide deacetylase  29.18 
 
 		 294 aa  97.4  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.206647  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  26.01 
 
 		 282 aa  92.4  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2100  hypothetical protein  28.16 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0203  polysaccharide deacetylase  29.69 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.37611  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2210  polysaccharide deacetylase  31.37 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  34.84 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1685  polysaccharide deacetylase  28.74 
 
 		 273 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000637976  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.37 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  27.91 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  27.92 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1730  polysaccharide deacetylase  35.38 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  35.24 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  38.24 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2470  polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  26.85 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6169  polysaccharide deacetylase  29.82 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  34.31 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  34.31 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  34.31 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  34.31 
 
 		 275 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2360  polysaccharide deacetylase  33.63 
 
 		 293 aa  67  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  34.31 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  34.31 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  34.86 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  32.32 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1330  polysaccharide deacetylase  31.48 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1349  polysaccharide deacetylase  31.48 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.723796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1313  polysaccharide deacetylase  31.29 
 
 		 330 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  26.24 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  26.67 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2094  polysaccharide deacetylase  32.89 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  26.34 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  25.86 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  34.31 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  27.24 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  26.64 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1477  polysaccharide deacetylase  25.09 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4036  PEP-CTERM locus, polysaccharide deactylase  31.33 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216969  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  26.24 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  36.9 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  36.9 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0355  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.0556603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3927  urate catabolism protein  26.1 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>