223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1313 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1313  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 330 aa  657    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1330  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 317 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1349  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 317 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.723796 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0518  polysaccharide deacetylase  32.69 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2470  polysaccharide deacetylase  29.09 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  34 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  28.17 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  26.59 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2360  polysaccharide deacetylase  27.76 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2473  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  26.92 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1774  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  26.61 
 
 		 279 aa  67  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  33.11 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  32.89 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  33.78 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0684  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  32.47 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.934486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  35.92 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  34.46 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3066  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00688884  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  36.28 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  36.28 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  36.28 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  33.56 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  33.04 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  35.78 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  35.78 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2968  polysaccharide deacetylase  29.29 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  33.04 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  33.04 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4391  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.424954 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  35.17 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2217  polysaccharide deactylase family protein, PEP- CTERM locus subfamily  29.68 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.691781  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  34.86 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2238  polysaccharide deacetylase  29.38 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  37.23 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1923  polysaccharide deacetylase  27.74 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1980  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  31.25 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0139  FkbH  27.67 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  27.22 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1172  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 281 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  30.08 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  41.05 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3276  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  27.42 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231611  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2229  polysaccharide deacetylase  32.19 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  30.3 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1981  polysaccharide deacetylase  24.53 
 
 		 283 aa  57  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0475  polysaccharide deacetylase  39.05 
 
 		 336 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0117021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0203  polysaccharide deacetylase  34.55 
 
 		 292 aa  57  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.37611  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  34.13 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2388  polysaccharide deacetylase  30.13 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1656  polysaccharide deacetylase  27.32 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  30.97 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  30.97 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  32.99 
 
 		 417 aa  55.5  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  28.97 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  30.61 
 
 		 271 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.34 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  30.34 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 294 aa  55.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.17 
 
 		 276 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2210  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0928  polysaccharide deacetylase  31.29 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  32.63 
 
 		 683 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3574  polysaccharide deacetylase  35.14 
 
 		 267 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845428  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2524  polysaccharide deacetylase  28.91 
 
 		 281 aa  53.9  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0713961  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3114  polysaccharide deacetylase  26.97 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  29.91 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  33.96 
 
 		 465 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3617  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 281 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000367499  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39050  predicted xylanase/chitin deacetylase  33.93 
 
 		 295 aa  54.3  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1517  polysaccharide deacetylase  24 
 
 		 301 aa  53.9  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0751328  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 		 263 aa  53.5  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  35.87 
 
 		 277 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  33.65 
 
 		 204 aa  53.5  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  30.34 
 
 		 307 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  30.34 
 
 		 307 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1685  polysaccharide deacetylase  27.1 
 
 		 273 aa  53.1  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000637976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  30.34 
 
 		 307 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4036  PEP-CTERM locus, polysaccharide deactylase  25.81 
 
 		 292 aa  53.1  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216969  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 294 aa  52.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2331  polysaccharide deacetylase  25.87 
 
 		 293 aa  52.8  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  29.82 
 
 		 302 aa  52.8  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  37.37 
 
 		 227 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  33.71 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1576  polysaccharide deacetylase  32.77 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  33.04 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  30.91 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0588  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620562 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0287  polysaccharide deacetylase  26.89 
 
 		 277 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  33 
 
 		 258 aa  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 		 353 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2094  polysaccharide deacetylase  34.23 
 
 		 284 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  27.63 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  29.78 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0143  polysaccharide deacetylase  29.46 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.839924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 264 aa  50.8  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2587  polysaccharide deacetylase  25.17 
 
 		 284 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784325  normal  0.845625 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 503 aa  50.8  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  30.25 
 
 		 387 aa  50.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>