More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0588 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0588  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 282 aa  579  1e-164  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620562 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2510  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  60.93 
 
 		 302 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.710977 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0143  polysaccharide deacetylase  58.7 
 
 		 310 aa  335  5e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.839924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0287  polysaccharide deacetylase  58.18 
 
 		 277 aa  333  2e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2524  polysaccharide deacetylase  56.88 
 
 		 281 aa  332  5e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0713961  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1981  polysaccharide deacetylase  57.91 
 
 		 283 aa  332  6e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1517  polysaccharide deacetylase  59.93 
 
 		 301 aa  330  2e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0751328  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3114  polysaccharide deacetylase  56.46 
 
 		 305 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2403  polysaccharide deacetylase  54.81 
 
 		 279 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0664  polysaccharide deacetylase  51.96 
 
 		 291 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0290858  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3276  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  54.61 
 
 		 279 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231611  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4036  PEP-CTERM locus, polysaccharide deactylase  51.61 
 
 		 292 aa  290  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216969  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1172  polysaccharide deacetylase  48.72 
 
 		 281 aa  280  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1923  polysaccharide deacetylase  50.92 
 
 		 286 aa  278  6e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1980  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  48.39 
 
 		 293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1656  polysaccharide deacetylase  50.9 
 
 		 299 aa  273  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2968  polysaccharide deacetylase  53.11 
 
 		 284 aa  267  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2388  polysaccharide deacetylase  52 
 
 		 304 aa  267  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2217  polysaccharide deactylase family protein, PEP- CTERM locus subfamily  48.59 
 
 		 298 aa  260  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.691781  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2331  polysaccharide deacetylase  51.09 
 
 		 293 aa  259  5.0000000000000005e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2470  polysaccharide deacetylase  48.91 
 
 		 301 aa  258  8e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2360  polysaccharide deacetylase  48 
 
 		 293 aa  256  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2473  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  46.21 
 
 		 279 aa  255  6e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0684  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  47.87 
 
 		 283 aa  254  9e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.934486 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3066  polysaccharide deacetylase  47.16 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00688884  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1774  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  46.21 
 
 		 279 aa  253  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0139  FkbH  44.53 
 
 		 295 aa  252  4.0000000000000004e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02597  Polysaccharide deacetylase  45.86 
 
 		 270 aa  244  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14174  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  44.32 
 
 		 280 aa  229  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0835  polysaccharide deacetylase family protein  51.74 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2617  polysaccharide deacetylase  31.11 
 
 		 282 aa  155  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  39.35 
 
 		 276 aa  155  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2210  polysaccharide deacetylase  42.74 
 
 		 283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2587  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 		 284 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784325  normal  0.845625 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3617  polysaccharide deacetylase  34.89 
 
 		 281 aa  142  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000367499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1685  polysaccharide deacetylase  35.13 
 
 		 273 aa  136  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000637976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1104  polysaccharide deacetylase  28.76 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0831  polysaccharide deacetylase  28.87 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00177779  normal  0.177326 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1730  polysaccharide deacetylase  29.53 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  34.44 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  34.44 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  39.17 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  33.77 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  41.86 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  34.15 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  41.77 
 
 		 430 aa  69.3  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2238  polysaccharide deacetylase  27.48 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  36.23 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  37.72 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  37.72 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  37.72 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  34.67 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  36 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  36 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  36 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  36 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  39.32 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  34.67 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  34.67 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  34.44 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  35.21 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  35.51 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  42.31 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  39.22 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  34.67 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  29.86 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  33.83 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  34.67 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1456  polysaccharide deacetylase family protein  33.65 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0998463  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  32.9 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  29.27 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  30.91 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0234  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  39.74 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  31.19 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3879  polysaccharide deacetylase  42.25 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1515  polysaccharide deacetylase  38.96 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.416831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  33.9 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 542 aa  59.7  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  31.19 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0628  polysaccharide deacetylase  40 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  39.19 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  30.28 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  32.89 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  30.28 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  34.26 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  33.73 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  36.71 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1728  polysaccharide deacetylase family protein  31.73 
 
 		 238 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000179283  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  34.26 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  31.08 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  40.79 
 
 		 503 aa  57.4  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  31.65 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  33.04 
 
 		 302 aa  57  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  34.51 
 
 		 319 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>